MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 5930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_008511	AATTC	2	10	254001	254010	40 %	40 %	0 %	20 %	116332641
5003	NC_008511	ATT	2	6	254057	254062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332641
5004	NC_008511	CATC	2	8	254066	254073	25 %	25 %	0 %	50 %	116332641
5005	NC_008511	CAAA	2	8	254230	254237	75 %	0 %	0 %	25 %	116332641
5006	NC_008511	AAGA	2	8	254266	254273	75 %	0 %	25 %	0 %	116332641
5007	NC_008511	GATT	2	8	254332	254339	25 %	50 %	25 %	0 %	116332641
5008	NC_008511	ATGGGA	2	12	254363	254374	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116332641
5009	NC_008511	GTGC	2	8	254402	254409	0 %	25 %	50 %	25 %	116332641
5010	NC_008511	ACA	2	6	254469	254474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332641
5011	NC_008511	CTAT	2	8	254500	254507	25 %	50 %	0 %	25 %	116332641
5012	NC_008511	TCA	2	6	254544	254549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332641
5013	NC_008511	GAA	2	6	254564	254569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332641
5014	NC_008511	A	7	7	254651	254657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008511	A	6	6	254688	254693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008511	TTA	2	6	254727	254732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008511	TAT	2	6	254812	254817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008511	AT	3	6	254845	254850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008511	GAT	2	6	254867	254872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008511	AGG	2	6	254873	254878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008511	TAG	2	6	254883	254888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008511	T	6	6	254907	254912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008511	TCCATC	2	12	254933	254944	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116332642
5024	NC_008511	CTT	2	6	254956	254961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332642
5025	NC_008511	TAT	2	6	255102	255107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332642
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5027	NC_008511	TATC	2	8	255276	255283	25 %	50 %	0 %	25 %	116332642
5028	NC_008511	AAAG	2	8	255322	255329	75 %	0 %	25 %	0 %	116332642
5029	NC_008511	TACA	2	8	255343	255350	50 %	25 %	0 %	25 %	116332642
5030	NC_008511	GAA	2	6	255360	255365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332642
5031	NC_008511	ATTT	2	8	255381	255388	25 %	75 %	0 %	0 %	116332642
5032	NC_008511	GGA	2	6	255426	255431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332642
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5039	NC_008511	A	6	6	255737	255742	100 %	0 %	0 %	0 %	116332642
5040	NC_008511	TTA	2	6	255779	255784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332642
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5043	NC_008511	GGAGGT	2	12	255918	255929	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116332642
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5049	NC_008511	T	6	6	256574	256579	0 %	100 %	0 %	0 %	116332643
5050	NC_008511	TCT	2	6	256582	256587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008511	ATCCT	2	10	256611	256620	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5052	NC_008511	ATC	2	6	256663	256668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332644
5053	NC_008511	TA	3	6	256678	256683	50 %	50 %	0 %	0 %	116332644
5054	NC_008511	TCGA	2	8	256714	256721	25 %	25 %	25 %	25 %	116332644
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5059	NC_008511	AG	3	6	256842	256847	50 %	0 %	50 %	0 %	116332644
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5061	NC_008511	T	6	6	256911	256916	0 %	100 %	0 %	0 %	116332645
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5075	NC_008511	GATT	2	8	257669	257676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_008511	AACG	2	8	257724	257731	50 %	0 %	25 %	25 %	116332646
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5098	NC_008511	TTGCA	2	10	258759	258768	20 %	40 %	20 %	20 %	116332647
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5105	NC_008511	TCTTT	2	10	259071	259080	0 %	80 %	0 %	20 %	116332647
5106	NC_008511	GAATC	2	10	259088	259097	40 %	20 %	20 %	20 %	116332647
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5109	NC_008511	ATA	2	6	259218	259223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332647
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5114	NC_008511	GAT	2	6	259410	259415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332647
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5120	NC_008511	ACTT	2	8	259535	259542	25 %	50 %	0 %	25 %	116332647
5121	NC_008511	ATTT	2	8	259576	259583	25 %	75 %	0 %	0 %	116332648
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5127	NC_008511	ATA	2	6	259833	259838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332648
5128	NC_008511	CTT	2	6	259871	259876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332648
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5131	NC_008511	AAT	2	6	259970	259975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332648
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5133	NC_008511	CTT	2	6	260111	260116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332648
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5154	NC_008511	GAA	2	6	261348	261353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5156	NC_008511	TGA	2	6	261406	261411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332650
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5166	NC_008511	T	7	7	261868	261874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5170	NC_008511	A	6	6	262080	262085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5173	NC_008511	AG	3	6	262185	262190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_008511	TTG	2	6	262210	262215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_008511	TAA	2	6	262257	262262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_008511	AGA	2	6	262327	262332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5182	NC_008511	TCC	2	6	262738	262743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5183	NC_008511	CTT	2	6	262750	262755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5240	NC_008511	AAAAG	2	10	265733	265742	80 %	0 %	20 %	0 %	116332653
5241	NC_008511	TCT	2	6	265775	265780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332653
5242	NC_008511	GAT	2	6	265784	265789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332653
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5244	NC_008511	A	7	7	265881	265887	100 %	0 %	0 %	0 %	116332653
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5250	NC_008511	TTC	2	6	266107	266112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332653
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5252	NC_008511	A	6	6	266176	266181	100 %	0 %	0 %	0 %	116332654
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5386	NC_008511	T	6	6	272720	272725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_008511	A	6	6	279875	279880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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