MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 72610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_008508	GAT	2	6	2129090	2129095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43002	NC_008508	CTT	2	6	2129108	2129113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43003	NC_008508	TTCC	2	8	2129173	2129180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43004	NC_008508	TTCT	2	8	2129317	2129324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43005	NC_008508	TTC	2	6	2129328	2129333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43006	NC_008508	A	6	6	2129434	2129439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43007	NC_008508	GTA	2	6	2129441	2129446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43008	NC_008508	GTCC	2	8	2129556	2129563	0 %	25 %	25 %	50 %	116328481
43009	NC_008508	GA	3	6	2129593	2129598	50 %	0 %	50 %	0 %	116328481
43010	NC_008508	TGAA	2	8	2129785	2129792	50 %	25 %	25 %	0 %	116328481
43011	NC_008508	TCG	2	6	2129804	2129809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328481
43012	NC_008508	T	6	6	2129839	2129844	0 %	100 %	0 %	0 %	116328481
43013	NC_008508	TTC	2	6	2129851	2129856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43014	NC_008508	TCTT	2	8	2129863	2129870	0 %	75 %	0 %	25 %	116328481
43015	NC_008508	TTC	2	6	2129872	2129877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43016	NC_008508	GAA	2	6	2129891	2129896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328481
43017	NC_008508	TCCGA	2	10	2129906	2129915	20 %	20 %	20 %	40 %	116328481
43018	NC_008508	GAA	2	6	2130000	2130005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328481
43019	NC_008508	TCG	2	6	2130041	2130046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328481
43020	NC_008508	CTT	2	6	2130068	2130073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43021	NC_008508	TCG	2	6	2130101	2130106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328481
43022	NC_008508	GCG	2	6	2130123	2130128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116328481
43023	NC_008508	TCGAT	2	10	2130176	2130185	20 %	40 %	20 %	20 %	116328481
43024	NC_008508	TCG	2	6	2130200	2130205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328481
43025	NC_008508	AAG	2	6	2130394	2130399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328481
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43027	NC_008508	CTT	3	9	2130483	2130491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43028	NC_008508	CTT	2	6	2130510	2130515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43029	NC_008508	T	7	7	2130517	2130523	0 %	100 %	0 %	0 %	116328481
43030	NC_008508	TTC	2	6	2130526	2130531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43031	NC_008508	GATT	2	8	2130594	2130601	25 %	50 %	25 %	0 %	116328481
43032	NC_008508	TTTC	2	8	2130608	2130615	0 %	75 %	0 %	25 %	116328481
43033	NC_008508	TCTT	2	8	2130763	2130770	0 %	75 %	0 %	25 %	116328481
43034	NC_008508	T	6	6	2130790	2130795	0 %	100 %	0 %	0 %	116328481
43035	NC_008508	CT	3	6	2130802	2130807	0 %	50 %	0 %	50 %	116328481
43036	NC_008508	CG	3	6	2130838	2130843	0 %	0 %	50 %	50 %	116328481
43037	NC_008508	TTC	2	6	2130850	2130855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43038	NC_008508	TCGATC	2	12	2130866	2130877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116328481
43039	NC_008508	AGA	2	6	2130886	2130891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328481
43040	NC_008508	TCG	2	6	2130896	2130901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328481
43041	NC_008508	GGAA	2	8	2130923	2130930	50 %	0 %	50 %	0 %	116328481
43042	NC_008508	CGA	2	6	2130936	2130941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116328481
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43044	NC_008508	GAATTC	2	12	2130987	2130998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116328481
43045	NC_008508	ATG	2	6	2131000	2131005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116328481
43046	NC_008508	CTT	2	6	2131088	2131093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43047	NC_008508	GCG	2	6	2131100	2131105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116328481
43048	NC_008508	TAAA	2	8	2131254	2131261	75 %	25 %	0 %	0 %	116328481
43049	NC_008508	TCG	2	6	2131289	2131294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328481
43050	NC_008508	TTCC	2	8	2131389	2131396	0 %	50 %	0 %	50 %	116328481
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43052	NC_008508	CTT	2	6	2131517	2131522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43053	NC_008508	T	6	6	2131583	2131588	0 %	100 %	0 %	0 %	116328481
43054	NC_008508	TTCC	2	8	2131614	2131621	0 %	50 %	0 %	50 %	116328481
43055	NC_008508	CCTTTC	2	12	2131641	2131652	0 %	50 %	0 %	50 %	116328481
43056	NC_008508	TCC	2	6	2131709	2131714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116328481
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43058	NC_008508	TCC	2	6	2131861	2131866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116328481
43059	NC_008508	GCC	2	6	2131878	2131883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116328481
43060	NC_008508	T	6	6	2131899	2131904	0 %	100 %	0 %	0 %	116328481
43061	NC_008508	TTC	2	6	2131993	2131998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328481
43062	NC_008508	CT	3	6	2132124	2132129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43063	NC_008508	AAAT	2	8	2132222	2132229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43064	NC_008508	T	6	6	2132376	2132381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43065	NC_008508	ACA	2	6	2132406	2132411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43066	NC_008508	CAT	2	6	2132441	2132446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328482
43067	NC_008508	CGG	2	6	2132564	2132569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116328482
43068	NC_008508	CAT	2	6	2132591	2132596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328482
43069	NC_008508	GAA	2	6	2132647	2132652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328482
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43071	NC_008508	TA	4	8	2132760	2132767	50 %	50 %	0 %	0 %	116328482
43072	NC_008508	ATC	2	6	2132865	2132870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328482
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43074	NC_008508	GC	4	8	2132907	2132914	0 %	0 %	50 %	50 %	116328482
43075	NC_008508	ACT	2	6	2132949	2132954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328482
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43078	NC_008508	CGC	2	6	2133161	2133166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116328482
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43085	NC_008508	CCT	2	6	2133274	2133279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116328482
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43087	NC_008508	CTTT	2	8	2133332	2133339	0 %	75 %	0 %	25 %	116328482
43088	NC_008508	CTTC	2	8	2133393	2133400	0 %	50 %	0 %	50 %	116328482
43089	NC_008508	T	6	6	2133403	2133408	0 %	100 %	0 %	0 %	116328482
43090	NC_008508	GGA	2	6	2133420	2133425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116328482
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43092	NC_008508	TCTT	2	8	2133457	2133464	0 %	75 %	0 %	25 %	116328482
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43096	NC_008508	TCAA	2	8	2133601	2133608	50 %	25 %	0 %	25 %	116328482
43097	NC_008508	A	6	6	2133711	2133716	100 %	0 %	0 %	0 %	116328482
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43100	NC_008508	TCG	2	6	2133805	2133810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328482
43101	NC_008508	T	7	7	2133946	2133952	0 %	100 %	0 %	0 %	116328482
43102	NC_008508	A	6	6	2134015	2134020	100 %	0 %	0 %	0 %	116328482
43103	NC_008508	AAG	2	6	2134050	2134055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_008508	AGA	2	6	2134248	2134253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328483
43105	NC_008508	TC	3	6	2134309	2134314	0 %	50 %	0 %	50 %	116328483
43106	NC_008508	TCGA	2	8	2134342	2134349	25 %	25 %	25 %	25 %	116328483
43107	NC_008508	AGA	2	6	2134353	2134358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328483
43108	NC_008508	CGT	2	6	2134362	2134367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328483
43109	NC_008508	CTC	2	6	2134473	2134478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116328483
43110	NC_008508	TG	3	6	2134485	2134490	0 %	50 %	50 %	0 %	116328483
43111	NC_008508	AAAG	2	8	2134493	2134500	75 %	0 %	25 %	0 %	116328483
43112	NC_008508	GAT	2	6	2134539	2134544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116328483
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43114	NC_008508	GA	3	6	2134647	2134652	50 %	0 %	50 %	0 %	116328483
43115	NC_008508	GAA	2	6	2134670	2134675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328483
43116	NC_008508	GGC	2	6	2134764	2134769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116328483
43117	NC_008508	TTC	2	6	2134793	2134798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328483
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43119	NC_008508	TTC	2	6	2134854	2134859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328483
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43353	NC_008508	CCTGA	2	10	2146366	2146375	20 %	20 %	20 %	40 %	116328494
43354	NC_008508	TTCT	2	8	2146376	2146383	0 %	75 %	0 %	25 %	116328494
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43356	NC_008508	TCGA	2	8	2146392	2146399	25 %	25 %	25 %	25 %	116328494
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43358	NC_008508	CGGAAC	2	12	2146588	2146599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116328494
43359	NC_008508	GTCC	2	8	2146657	2146664	0 %	25 %	25 %	50 %	116328494
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43364	NC_008508	T	7	7	2146858	2146864	0 %	100 %	0 %	0 %	116328494
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43372	NC_008508	GATT	2	8	2147355	2147362	25 %	50 %	25 %	0 %	116328494
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43383	NC_008508	ACT	2	6	2147891	2147896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328495
43384	NC_008508	TC	3	6	2147929	2147934	0 %	50 %	0 %	50 %	116328495
43385	NC_008508	A	8	8	2147950	2147957	100 %	0 %	0 %	0 %	116328495
43386	NC_008508	GA	3	6	2148008	2148013	50 %	0 %	50 %	0 %	116328495
43387	NC_008508	AAAT	2	8	2148109	2148116	75 %	25 %	0 %	0 %	116328495
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43392	NC_008508	CAC	2	6	2148344	2148349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116328495
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43395	NC_008508	TCT	3	9	2148401	2148409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328495
43396	NC_008508	GTTCG	2	10	2148424	2148433	0 %	40 %	40 %	20 %	116328495
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43410	NC_008508	CAAC	2	8	2148902	2148909	50 %	0 %	0 %	50 %	116328495
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43419	NC_008508	CGG	2	6	2149536	2149541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116328496
43420	NC_008508	A	6	6	2149575	2149580	100 %	0 %	0 %	0 %	116328496
43421	NC_008508	ACA	2	6	2149632	2149637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116328496
43422	NC_008508	TGAT	2	8	2149679	2149686	25 %	50 %	25 %	0 %	116328496
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43435	NC_008508	AAT	2	6	2150133	2150138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116328498
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43437	NC_008508	CGT	2	6	2150207	2150212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116328498
43438	NC_008508	CAT	2	6	2150292	2150297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328498
43439	NC_008508	AAAG	2	8	2150328	2150335	75 %	0 %	25 %	0 %	116328498
43440	NC_008508	A	7	7	2150412	2150418	100 %	0 %	0 %	0 %	116328498
43441	NC_008508	CAT	2	6	2150439	2150444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328498
43442	NC_008508	AAAG	2	8	2150584	2150591	75 %	0 %	25 %	0 %	116328498
43443	NC_008508	TC	3	6	2150599	2150604	0 %	50 %	0 %	50 %	116328498
43444	NC_008508	GGAATT	2	12	2150641	2150652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116328498
43445	NC_008508	A	6	6	2150668	2150673	100 %	0 %	0 %	0 %	116328498
43446	NC_008508	GAA	2	6	2150674	2150679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328498
43447	NC_008508	CGC	2	6	2150694	2150699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116328498
43448	NC_008508	GAA	2	6	2150756	2150761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43449	NC_008508	CAT	2	6	2150789	2150794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328499
43450	NC_008508	TCAAA	2	10	2150796	2150805	60 %	20 %	0 %	20 %	116328499
43451	NC_008508	CTT	2	6	2150851	2150856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328499
43452	NC_008508	GCCT	2	8	2150861	2150868	0 %	25 %	25 %	50 %	116328499
43453	NC_008508	T	6	6	2150895	2150900	0 %	100 %	0 %	0 %	116328499
43454	NC_008508	G	6	6	2150986	2150991	0 %	0 %	100 %	0 %	116328499
43455	NC_008508	TCTT	2	8	2151002	2151009	0 %	75 %	0 %	25 %	116328499
43456	NC_008508	TCCGTA	2	12	2151032	2151043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116328499
43457	NC_008508	GTT	2	6	2151120	2151125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116328499
43458	NC_008508	CAT	2	6	2151139	2151144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328499
43459	NC_008508	AGA	2	6	2151152	2151157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328499
43460	NC_008508	GAC	2	6	2151180	2151185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116328499
43461	NC_008508	CA	3	6	2151229	2151234	50 %	0 %	0 %	50 %	116328499
43462	NC_008508	AAC	2	6	2151253	2151258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116328499
43463	NC_008508	CAG	2	6	2151336	2151341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116328499
43464	NC_008508	TAT	2	6	2151342	2151347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116328499
43465	NC_008508	T	8	8	2151398	2151405	0 %	100 %	0 %	0 %	116328499
43466	NC_008508	AGA	2	6	2151448	2151453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328499
43467	NC_008508	T	6	6	2151466	2151471	0 %	100 %	0 %	0 %	116328499
43468	NC_008508	ACA	2	6	2151518	2151523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116328499
43469	NC_008508	CGAT	2	8	2151622	2151629	25 %	25 %	25 %	25 %	116328500
43470	NC_008508	ATG	2	6	2151754	2151759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116328500
43471	NC_008508	TTC	2	6	2151803	2151808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328500
43472	NC_008508	TCCCAT	2	12	2151936	2151947	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116328500
43473	NC_008508	TCCCAT	2	12	2151951	2151962	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116328500
43474	NC_008508	CCG	2	6	2151976	2151981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116328500
43475	NC_008508	CAA	2	6	2152008	2152013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116328500
43476	NC_008508	AGGA	2	8	2152055	2152062	50 %	0 %	50 %	0 %	116328500
43477	NC_008508	A	8	8	2152083	2152090	100 %	0 %	0 %	0 %	116328500
43478	NC_008508	CACCC	2	10	2152170	2152179	20 %	0 %	0 %	80 %	116328500
43479	NC_008508	CAT	2	6	2152287	2152292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116328500
43480	NC_008508	AAAAG	2	10	2152375	2152384	80 %	0 %	20 %	0 %	116328500
43481	NC_008508	AGA	2	6	2152452	2152457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328500
43482	NC_008508	GAA	2	6	2152504	2152509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328500
43483	NC_008508	AGA	2	6	2152510	2152515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116328500
43484	NC_008508	CTT	2	6	2152556	2152561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116328500
43485	NC_008508	TG	3	6	2152564	2152569	0 %	50 %	50 %	0 %	116328500
43486	NC_008508	T	7	7	2152723	2152729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43487	NC_008508	T	6	6	2152772	2152777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43488	NC_008508	AAAC	2	8	2152783	2152790	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43489	NC_008508	TGAG	2	8	2152807	2152814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43490	NC_008508	TGAA	2	8	2152885	2152892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43491	NC_008508	CTC	2	6	2152913	2152918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116328501
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43494	NC_008508	GTA	2	6	2153053	2153058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116328501
43495	NC_008508	TCC	2	6	2153070	2153075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116328501
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43499	NC_008508	AATC	2	8	2153183	2153190	50 %	25 %	0 %	25 %	116328501
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