MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 72610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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72502	NC_008508	AAT	2	6	3608610	3608615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72503	NC_008508	AGA	2	6	3608628	3608633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72504	NC_008508	AGG	2	6	3608644	3608649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72505	NC_008508	TTG	2	6	3608655	3608660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72506	NC_008508	GAT	2	6	3608735	3608740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72507	NC_008508	TCG	2	6	3608781	3608786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72508	NC_008508	ATT	2	6	3608812	3608817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72509	NC_008508	A	6	6	3608827	3608832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72510	NC_008508	A	6	6	3608839	3608844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72511	NC_008508	CT	3	6	3608883	3608888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72512	NC_008508	AAG	2	6	3608897	3608902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72513	NC_008508	AAG	2	6	3608906	3608911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72514	NC_008508	CAAAA	2	10	3608929	3608938	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72515	NC_008508	A	6	6	3608935	3608940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72516	NC_008508	TGA	2	6	3609048	3609053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72517	NC_008508	ATA	2	6	3609288	3609293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72518	NC_008508	ACTC	2	8	3609304	3609311	25 %	25 %	0 %	50 %	116329553
72519	NC_008508	ATT	2	6	3609318	3609323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329553
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72522	NC_008508	ATC	2	6	3609463	3609468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329553
72523	NC_008508	A	6	6	3609502	3609507	100 %	0 %	0 %	0 %	116329553
72524	NC_008508	TTG	2	6	3609534	3609539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116329553
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72538	NC_008508	A	8	8	3610273	3610280	100 %	0 %	0 %	0 %	116329553
72539	NC_008508	CT	3	6	3610472	3610477	0 %	50 %	0 %	50 %	116329553
72540	NC_008508	AAAAC	2	10	3610541	3610550	80 %	0 %	0 %	20 %	116329553
72541	NC_008508	TTTTTA	2	12	3610577	3610588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116329553
72542	NC_008508	CTT	2	6	3610613	3610618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329553
72543	NC_008508	CAAAGC	2	12	3610713	3610724	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116329553
72544	NC_008508	A	7	7	3610729	3610735	100 %	0 %	0 %	0 %	116329553
72545	NC_008508	AAG	2	6	3610823	3610828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72546	NC_008508	TTTG	2	8	3610830	3610837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72547	NC_008508	T	6	6	3610838	3610843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72548	NC_008508	GAT	2	6	3610889	3610894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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72553	NC_008508	GGAA	2	8	3611130	3611137	50 %	0 %	50 %	0 %	116329554
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72557	NC_008508	CTT	2	6	3611315	3611320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329554
72558	NC_008508	A	7	7	3611402	3611408	100 %	0 %	0 %	0 %	116329554
72559	NC_008508	GAA	2	6	3611440	3611445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329554
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72562	NC_008508	A	6	6	3611532	3611537	100 %	0 %	0 %	0 %	116329554
72563	NC_008508	AAACA	2	10	3611590	3611599	80 %	0 %	0 %	20 %	116329554
72564	NC_008508	A	6	6	3611615	3611620	100 %	0 %	0 %	0 %	116329554
72565	NC_008508	AAT	2	6	3611639	3611644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116329554
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72569	NC_008508	TCAA	2	8	3611920	3611927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72570	NC_008508	AGC	2	6	3611948	3611953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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72573	NC_008508	AAG	2	6	3612150	3612155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72574	NC_008508	TTAA	2	8	3612169	3612176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72584	NC_008508	GATT	2	8	3613025	3613032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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72586	NC_008508	AG	3	6	3613120	3613125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72587	NC_008508	ACAG	2	8	3613199	3613206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72588	NC_008508	CCGTC	2	10	3613266	3613275	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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72591	NC_008508	CTT	2	6	3613321	3613326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72592	NC_008508	ACT	2	6	3613357	3613362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72593	NC_008508	A	6	6	3613404	3613409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72594	NC_008508	ATA	2	6	3613422	3613427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72595	NC_008508	TTC	2	6	3613449	3613454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72596	NC_008508	T	6	6	3613542	3613547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72597	NC_008508	TTC	2	6	3613568	3613573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72598	NC_008508	GCT	2	6	3613795	3613800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72599	NC_008508	TCA	2	6	3613818	3613823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72600	NC_008508	GAT	2	6	3613834	3613839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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72602	NC_008508	GAA	2	6	3613873	3613878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72603	NC_008508	AAT	2	6	3613903	3613908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72605	NC_008508	A	6	6	3614001	3614006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72606	NC_008508	GTT	2	6	3614038	3614043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72607	NC_008508	AATT	2	8	3614048	3614055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72608	NC_008508	CAA	2	6	3614126	3614131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72609	NC_008508	TTG	2	6	3614137	3614142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72610	NC_008508	ACTC	2	8	3614206	3614213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.