MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 5697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008014	TAC	2	6	140391	140396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972481
4002	NC_008014	ATT	2	6	140454	140459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008014	ATAGTT	2	12	140461	140472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008014	ATGG	2	8	140492	140499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008014	T	7	7	140500	140506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008014	ATA	2	6	140508	140513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008014	A	9	9	140513	140521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008014	T	8	8	140540	140547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008014	AGA	2	6	140554	140559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008014	T	6	6	140567	140572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008014	T	6	6	140584	140589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008014	A	6	6	140591	140596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008014	TAA	2	6	140632	140637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972482
4014	NC_008014	AGA	2	6	140651	140656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972482
4015	NC_008014	TTA	2	6	140687	140692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972482
4016	NC_008014	T	6	6	140709	140714	0 %	100 %	0 %	0 %	94972482
4017	NC_008014	CTAT	2	8	140824	140831	25 %	50 %	0 %	25 %	94972482
4018	NC_008014	A	6	6	140904	140909	100 %	0 %	0 %	0 %	94972482
4019	NC_008014	AGC	2	6	140935	140940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972482
4020	NC_008014	TTG	2	6	140943	140948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972482
4021	NC_008014	T	6	6	140985	140990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008014	CAG	2	6	141003	141008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008014	CTC	2	6	141046	141051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_008014	AGT	2	6	141092	141097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972483
4025	NC_008014	GA	3	6	141102	141107	50 %	0 %	50 %	0 %	94972483
4026	NC_008014	AGAA	2	8	141141	141148	75 %	0 %	25 %	0 %	94972483
4027	NC_008014	T	6	6	141153	141158	0 %	100 %	0 %	0 %	94972483
4028	NC_008014	GAA	2	6	141164	141169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972483
4029	NC_008014	AAGGTT	2	12	141174	141185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972483
4030	NC_008014	T	6	6	141238	141243	0 %	100 %	0 %	0 %	94972483
4031	NC_008014	AGC	2	6	141252	141257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972483
4032	NC_008014	T	8	8	141295	141302	0 %	100 %	0 %	0 %	94972483
4033	NC_008014	TAG	2	6	141317	141322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972483
4034	NC_008014	T	6	6	141336	141341	0 %	100 %	0 %	0 %	94972483
4035	NC_008014	ATA	2	6	141345	141350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972483
4036	NC_008014	T	6	6	141382	141387	0 %	100 %	0 %	0 %	94972483
4037	NC_008014	ATA	2	6	141411	141416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972483
4038	NC_008014	TGGGAT	2	12	141423	141434	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	94972483
4039	NC_008014	GAT	2	6	141454	141459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972483
4040	NC_008014	TCT	2	6	141505	141510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972483
4041	NC_008014	AAG	2	6	141516	141521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972483
4042	NC_008014	CAA	2	6	141563	141568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972483
4043	NC_008014	GAA	2	6	141599	141604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972483
4044	NC_008014	AT	3	6	141614	141619	50 %	50 %	0 %	0 %	94972483
4045	NC_008014	C	6	6	141638	141643	0 %	0 %	0 %	100 %	94972483
4046	NC_008014	T	9	9	141654	141662	0 %	100 %	0 %	0 %	94972483
4047	NC_008014	ATT	2	6	141739	141744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972483
4048	NC_008014	ATC	2	6	141768	141773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972483
4049	NC_008014	AT	3	6	141790	141795	50 %	50 %	0 %	0 %	94972483
4050	NC_008014	AGC	2	6	141828	141833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972483
4051	NC_008014	GAA	2	6	141857	141862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972483
4052	NC_008014	TAG	2	6	141893	141898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972483
4053	NC_008014	TAT	2	6	141905	141910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972483
4054	NC_008014	CAT	2	6	141920	141925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972483
4055	NC_008014	AAT	2	6	141927	141932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972483
4056	NC_008014	AC	3	6	141965	141970	50 %	0 %	0 %	50 %	94972483
4057	NC_008014	TAGG	2	8	142006	142013	25 %	25 %	50 %	0 %	94972483
4058	NC_008014	TAA	2	6	142016	142021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972483
4059	NC_008014	ATT	2	6	142027	142032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972483
4060	NC_008014	GTTTG	2	10	142051	142060	0 %	60 %	40 %	0 %	94972484
4061	NC_008014	GCA	2	6	142101	142106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972484
4062	NC_008014	AAC	2	6	142213	142218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972484
4063	NC_008014	AAT	2	6	142223	142228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972484
4064	NC_008014	GT	3	6	142241	142246	0 %	50 %	50 %	0 %	94972484
4065	NC_008014	TTC	2	6	142259	142264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972484
4066	NC_008014	TGA	2	6	142367	142372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972484
4067	NC_008014	AAT	2	6	142477	142482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972484
4068	NC_008014	TCA	2	6	142515	142520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972484
4069	NC_008014	CTA	2	6	142548	142553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972484
4070	NC_008014	TTG	2	6	142579	142584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972484
4071	NC_008014	TGG	2	6	142605	142610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972484
4072	NC_008014	AGC	2	6	142625	142630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972484
4073	NC_008014	T	6	6	142661	142666	0 %	100 %	0 %	0 %	94972484
4074	NC_008014	GAT	2	6	142668	142673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972484
4075	NC_008014	TAT	2	6	142675	142680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972484
4076	NC_008014	TAT	2	6	142684	142689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972484
4077	NC_008014	T	6	6	142760	142765	0 %	100 %	0 %	0 %	94972484
4078	NC_008014	ACC	2	6	142798	142803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972484
4079	NC_008014	GGA	2	6	142806	142811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972484
4080	NC_008014	ATT	2	6	142823	142828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972484
4081	NC_008014	GAT	2	6	142835	142840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972484
4082	NC_008014	T	6	6	142856	142861	0 %	100 %	0 %	0 %	94972484
4083	NC_008014	ATT	2	6	142871	142876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972484
4084	NC_008014	T	8	8	142896	142903	0 %	100 %	0 %	0 %	94972484
4085	NC_008014	CTA	2	6	142978	142983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972484
4086	NC_008014	AAT	2	6	142985	142990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972484
4087	NC_008014	GTT	2	6	143007	143012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972484
4088	NC_008014	ATG	2	6	143044	143049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972484
4089	NC_008014	AAT	2	6	143072	143077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972484
4090	NC_008014	AGT	2	6	143162	143167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008014	ATC	2	6	143226	143231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008014	TAAA	2	8	143274	143281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008014	A	8	8	143285	143292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008014	ATTA	2	8	143296	143303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008014	ATA	2	6	143327	143332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008014	T	9	9	143362	143370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008014	ATCAA	2	10	143440	143449	60 %	20 %	0 %	20 %	94972485
4098	NC_008014	TA	3	6	143467	143472	50 %	50 %	0 %	0 %	94972485
4099	NC_008014	TGA	2	6	143479	143484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972485
4100	NC_008014	TGG	2	6	143499	143504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972485
4101	NC_008014	GAA	2	6	143592	143597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972485
4102	NC_008014	TTA	2	6	143610	143615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972485
4103	NC_008014	TTG	2	6	143638	143643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972485
4104	NC_008014	CAG	2	6	143647	143652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972485
4105	NC_008014	CTG	2	6	143662	143667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972485
4106	NC_008014	TA	4	8	143680	143687	50 %	50 %	0 %	0 %	94972485
4107	NC_008014	TA	3	6	143849	143854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008014	CTG	2	6	143874	143879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_008014	ATC	2	6	143895	143900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008014	TTA	2	6	144015	144020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008014	GTT	2	6	144041	144046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008014	CA	3	6	144055	144060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_008014	AAC	2	6	144091	144096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_008014	TGT	2	6	144103	144108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972486
4115	NC_008014	GTT	2	6	144158	144163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972486
4116	NC_008014	TTG	2	6	144222	144227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972486
4117	NC_008014	CCT	2	6	144230	144235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972486
4118	NC_008014	CTT	2	6	144257	144262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972486
4119	NC_008014	GGT	2	6	144272	144277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972486
4120	NC_008014	CTT	2	6	144314	144319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972486
4121	NC_008014	CCA	2	6	144335	144340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972486
4122	NC_008014	GGA	3	9	144341	144349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972486
4123	NC_008014	TTA	2	6	144447	144452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972486
4124	NC_008014	TGT	2	6	144541	144546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972486
4125	NC_008014	TGC	2	6	144550	144555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972486
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4127	NC_008014	ACA	2	6	144646	144651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972486
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