MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_008011	TAT	2	6	1416453	1416458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38002	NC_008011	TTA	2	6	1416459	1416464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38003	NC_008011	TAT	2	6	1416468	1416473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38004	NC_008011	GTA	2	6	1416480	1416485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38005	NC_008011	GAG	2	6	1416506	1416511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987597
38006	NC_008011	CAG	2	6	1416580	1416585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987597
38007	NC_008011	AGT	2	6	1416735	1416740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987597
38008	NC_008011	TGGTAG	2	12	1416788	1416799	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	94987597
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38010	NC_008011	ATTG	2	8	1416834	1416841	25 %	50 %	25 %	0 %	94987597
38011	NC_008011	ATA	2	6	1416853	1416858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987597
38012	NC_008011	TGA	2	6	1416905	1416910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987597
38013	NC_008011	ATA	2	6	1416949	1416954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987597
38014	NC_008011	A	6	6	1416973	1416978	100 %	0 %	0 %	0 %	94987597
38015	NC_008011	ATT	2	6	1417120	1417125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_008011	A	6	6	1417137	1417142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38017	NC_008011	A	6	6	1417149	1417154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38018	NC_008011	T	6	6	1417160	1417165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38019	NC_008011	AGA	2	6	1417200	1417205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38020	NC_008011	TAA	3	9	1417213	1417221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38021	NC_008011	AGA	2	6	1417224	1417229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38022	NC_008011	AG	3	6	1417234	1417239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38023	NC_008011	ACA	2	6	1417243	1417248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38024	NC_008011	TATT	3	12	1417262	1417273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38025	NC_008011	A	6	6	1417311	1417316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38026	NC_008011	ACA	2	6	1417344	1417349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38027	NC_008011	ATA	2	6	1417368	1417373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38028	NC_008011	A	6	6	1417373	1417378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38029	NC_008011	ATT	2	6	1417440	1417445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38030	NC_008011	TAT	2	6	1417491	1417496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38031	NC_008011	TAA	2	6	1417504	1417509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38032	NC_008011	A	7	7	1417508	1417514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38033	NC_008011	TAT	2	6	1417545	1417550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38034	NC_008011	GTA	2	6	1417564	1417569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38035	NC_008011	TAA	2	6	1417579	1417584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38036	NC_008011	TATT	2	8	1417595	1417602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38037	NC_008011	TAGT	2	8	1417605	1417612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38038	NC_008011	TAT	2	6	1417616	1417621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38039	NC_008011	TAT	2	6	1417664	1417669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38040	NC_008011	ATATT	2	10	1417673	1417682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38041	NC_008011	TA	3	6	1417695	1417700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38042	NC_008011	TAT	2	6	1417713	1417718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38043	NC_008011	GTA	2	6	1417763	1417768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38044	NC_008011	AT	3	6	1417769	1417774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38045	NC_008011	GTA	2	6	1417806	1417811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38046	NC_008011	TA	3	6	1417810	1417815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38047	NC_008011	TAGT	2	8	1417834	1417841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38048	NC_008011	AACA	2	8	1417905	1417912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38049	NC_008011	CCTTA	2	10	1417931	1417940	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38050	NC_008011	ATAGTA	2	12	1417951	1417962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38051	NC_008011	A	7	7	1417967	1417973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38052	NC_008011	TTAG	2	8	1417998	1418005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38053	NC_008011	AAT	2	6	1418011	1418016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38054	NC_008011	GTG	2	6	1418022	1418027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987598
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38056	NC_008011	ATGAT	2	10	1418193	1418202	40 %	40 %	20 %	0 %	94987598
38057	NC_008011	TGG	3	9	1418242	1418250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987598
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38059	NC_008011	CTG	2	6	1418349	1418354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987598
38060	NC_008011	GTT	2	6	1418375	1418380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987598
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38067	NC_008011	TATTT	2	10	1418549	1418558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38068	NC_008011	TTTA	2	8	1418563	1418570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38069	NC_008011	TCA	2	6	1418578	1418583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38075	NC_008011	TATTT	2	10	1418738	1418747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38076	NC_008011	TAGTT	2	10	1418755	1418764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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38084	NC_008011	A	6	6	1418959	1418964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38093	NC_008011	TA	3	6	1419298	1419303	50 %	50 %	0 %	0 %	94987599
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38098	NC_008011	TC	3	6	1419647	1419652	0 %	50 %	0 %	50 %	94987599
38099	NC_008011	GGA	2	6	1419654	1419659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987599
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38492	NC_008011	TCA	2	6	1433572	1433577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987613
38493	NC_008011	CCT	2	6	1433722	1433727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987613
38494	NC_008011	CAT	2	6	1433741	1433746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987613
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