MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_008011	T	6	6	1322204	1322209	0 %	100 %	0 %	0 %	94987518
35503	NC_008011	CATA	2	8	1322305	1322312	50 %	25 %	0 %	25 %	94987518
35504	NC_008011	TTA	3	9	1322376	1322384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987518
35505	NC_008011	TTA	2	6	1322400	1322405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987518
35506	NC_008011	TAA	2	6	1322438	1322443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987518
35507	NC_008011	AAGAC	2	10	1322468	1322477	60 %	0 %	20 %	20 %	94987518
35508	NC_008011	ATA	2	6	1322527	1322532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987518
35509	NC_008011	T	7	7	1322537	1322543	0 %	100 %	0 %	0 %	94987518
35510	NC_008011	ATA	2	6	1322544	1322549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987518
35511	NC_008011	AC	3	6	1322613	1322618	50 %	0 %	0 %	50 %	94987518
35512	NC_008011	ATT	2	6	1322655	1322660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987518
35513	NC_008011	TGT	2	6	1322661	1322666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987518
35514	NC_008011	TAG	2	6	1322671	1322676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987518
35515	NC_008011	AG	3	6	1322740	1322745	50 %	0 %	50 %	0 %	94987518
35516	NC_008011	ACC	2	6	1322762	1322767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987518
35517	NC_008011	GCA	2	6	1322775	1322780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987518
35518	NC_008011	CTC	2	6	1322802	1322807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35519	NC_008011	A	6	6	1322809	1322814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35520	NC_008011	TA	3	6	1322837	1322842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35521	NC_008011	ATT	2	6	1322845	1322850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35522	NC_008011	AAT	2	6	1322858	1322863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35523	NC_008011	TAAT	2	8	1322916	1322923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35524	NC_008011	AAT	2	6	1322925	1322930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35525	NC_008011	AGG	2	6	1322953	1322958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987519
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35527	NC_008011	AGG	2	6	1323020	1323025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987519
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35533	NC_008011	T	7	7	1323228	1323234	0 %	100 %	0 %	0 %	94987519
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35542	NC_008011	T	7	7	1323515	1323521	0 %	100 %	0 %	0 %	94987519
35543	NC_008011	TTC	2	6	1323524	1323529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987519
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35545	NC_008011	T	8	8	1323536	1323543	0 %	100 %	0 %	0 %	94987519
35546	NC_008011	TAAGTC	2	12	1323553	1323564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94987519
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35555	NC_008011	TCG	2	6	1323818	1323823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35557	NC_008011	GGA	4	12	1323832	1323843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35593	NC_008011	T	7	7	1324631	1324637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35598	NC_008011	GATA	2	8	1324706	1324713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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35602	NC_008011	AT	3	6	1324812	1324817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35603	NC_008011	TA	3	6	1324820	1324825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35604	NC_008011	ATT	2	6	1324837	1324842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35994	NC_008011	AT	3	6	1338828	1338833	50 %	50 %	0 %	0 %	94987531
35995	NC_008011	ATT	2	6	1338847	1338852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987531
35996	NC_008011	ATG	2	6	1338863	1338868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987531
35997	NC_008011	ATT	2	6	1338877	1338882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987531
35998	NC_008011	T	7	7	1338885	1338891	0 %	100 %	0 %	0 %	94987531
35999	NC_008011	AGA	2	6	1338906	1338911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987531
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