MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_008011	TTTA	2	8	1284830	1284837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34502	NC_008011	TA	3	6	1284892	1284897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34503	NC_008011	TAT	2	6	1284901	1284906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34504	NC_008011	TAAT	2	8	1284915	1284922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34505	NC_008011	ATTT	2	8	1284946	1284953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34506	NC_008011	AAG	2	6	1284992	1284997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34507	NC_008011	CTT	2	6	1285062	1285067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987484
34508	NC_008011	TAC	2	6	1285084	1285089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987484
34509	NC_008011	TAC	2	6	1285134	1285139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987484
34510	NC_008011	T	6	6	1285180	1285185	0 %	100 %	0 %	0 %	94987484
34511	NC_008011	CTT	2	6	1285188	1285193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987484
34512	NC_008011	AT	3	6	1285200	1285205	50 %	50 %	0 %	0 %	94987484
34513	NC_008011	TAA	2	6	1285218	1285223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987484
34514	NC_008011	GATA	3	12	1285230	1285241	50 %	25 %	25 %	0 %	94987484
34515	NC_008011	TTG	2	6	1285284	1285289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987484
34516	NC_008011	CTG	2	6	1285290	1285295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987484
34517	NC_008011	TCT	2	6	1285331	1285336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987484
34518	NC_008011	AAAT	2	8	1285392	1285399	75 %	25 %	0 %	0 %	94987484
34519	NC_008011	TGT	2	6	1285424	1285429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987484
34520	NC_008011	GAAT	2	8	1285453	1285460	50 %	25 %	25 %	0 %	94987484
34521	NC_008011	AGT	2	6	1285555	1285560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987484
34522	NC_008011	AGC	2	6	1285714	1285719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987484
34523	NC_008011	CTTT	2	8	1285760	1285767	0 %	75 %	0 %	25 %	94987484
34524	NC_008011	GCA	2	6	1285856	1285861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987484
34525	NC_008011	AAT	2	6	1285864	1285869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987484
34526	NC_008011	TTTG	2	8	1285895	1285902	0 %	75 %	25 %	0 %	94987484
34527	NC_008011	TAC	3	9	1285965	1285973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987484
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34530	NC_008011	ATT	2	6	1286041	1286046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34531	NC_008011	TTATA	2	10	1286052	1286061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34532	NC_008011	TAT	2	6	1286066	1286071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34533	NC_008011	AT	3	6	1286087	1286092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34534	NC_008011	TAT	2	6	1286105	1286110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_008011	TA	3	6	1286115	1286120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34536	NC_008011	ATA	2	6	1286126	1286131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34537	NC_008011	AT	6	12	1286141	1286152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34538	NC_008011	ATT	2	6	1286157	1286162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34539	NC_008011	ATA	2	6	1286176	1286181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34540	NC_008011	ATT	2	6	1286206	1286211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34541	NC_008011	TTTTTA	2	12	1286212	1286223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34542	NC_008011	AT	4	8	1286228	1286235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34543	NC_008011	CTATAA	2	12	1286251	1286262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34544	NC_008011	AAT	2	6	1286269	1286274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34545	NC_008011	TAG	2	6	1286298	1286303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34547	NC_008011	AAGAA	2	10	1286322	1286331	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34548	NC_008011	TAAA	2	8	1286355	1286362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34549	NC_008011	CCAT	3	12	1286411	1286422	25 %	25 %	0 %	50 %	94987485
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34554	NC_008011	TAA	3	9	1286643	1286651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987485
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34558	NC_008011	GAAA	2	8	1286770	1286777	75 %	0 %	25 %	0 %	94987485
34559	NC_008011	GGT	2	6	1286792	1286797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987485
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34571	NC_008011	TG	3	6	1287562	1287567	0 %	50 %	50 %	0 %	94987486
34572	NC_008011	TG	3	6	1287578	1287583	0 %	50 %	50 %	0 %	94987486
34573	NC_008011	TGA	2	6	1287586	1287591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987486
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34590	NC_008011	GATT	2	8	1288315	1288322	25 %	50 %	25 %	0 %	94987487
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34597	NC_008011	TGTGT	2	10	1288543	1288552	0 %	60 %	40 %	0 %	94987487
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34605	NC_008011	A	8	8	1288914	1288921	100 %	0 %	0 %	0 %	94987487
34606	NC_008011	TAA	2	6	1288931	1288936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987487
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34989	NC_008011	T	7	7	1303929	1303935	0 %	100 %	0 %	0 %	94987501
34990	NC_008011	T	7	7	1304020	1304026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34991	NC_008011	A	6	6	1304032	1304037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34992	NC_008011	T	6	6	1304060	1304065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34993	NC_008011	AT	3	6	1304101	1304106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34994	NC_008011	GCT	2	6	1304127	1304132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987502
34995	NC_008011	TC	3	6	1304140	1304145	0 %	50 %	0 %	50 %	94987502
34996	NC_008011	CAG	3	9	1304212	1304220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987502
34997	NC_008011	GAA	2	6	1304229	1304234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987502
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