MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_008011	TAA	2	6	1248286	1248291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987454
33503	NC_008011	TGA	2	6	1248359	1248364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987454
33504	NC_008011	ACA	2	6	1248371	1248376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987454
33505	NC_008011	ATT	2	6	1248395	1248400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987454
33506	NC_008011	AGA	2	6	1248431	1248436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987454
33507	NC_008011	GA	3	6	1248442	1248447	50 %	0 %	50 %	0 %	94987454
33508	NC_008011	TTG	2	6	1248517	1248522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987454
33509	NC_008011	ATT	2	6	1248545	1248550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987454
33510	NC_008011	ATG	2	6	1248556	1248561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987454
33511	NC_008011	ACT	2	6	1248600	1248605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987454
33512	NC_008011	GAT	2	6	1248666	1248671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987454
33513	NC_008011	CTTT	2	8	1248753	1248760	0 %	75 %	0 %	25 %	94987454
33514	NC_008011	GGCA	2	8	1248815	1248822	25 %	0 %	50 %	25 %	94987454
33515	NC_008011	A	6	6	1248835	1248840	100 %	0 %	0 %	0 %	94987454
33516	NC_008011	TAG	2	6	1248886	1248891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987454
33517	NC_008011	GAA	2	6	1248906	1248911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987454
33518	NC_008011	ACA	2	6	1248939	1248944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987454
33519	NC_008011	GGA	2	6	1249047	1249052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987454
33520	NC_008011	ATT	2	6	1249053	1249058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987454
33521	NC_008011	GGT	2	6	1249083	1249088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987454
33522	NC_008011	A	6	6	1249149	1249154	100 %	0 %	0 %	0 %	94987454
33523	NC_008011	TGC	2	6	1249235	1249240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987454
33524	NC_008011	AATC	2	8	1249302	1249309	50 %	25 %	0 %	25 %	94987454
33525	NC_008011	T	7	7	1249355	1249361	0 %	100 %	0 %	0 %	94987454
33526	NC_008011	ATT	2	6	1249404	1249409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987454
33527	NC_008011	ATA	2	6	1249417	1249422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987454
33528	NC_008011	ATC	2	6	1249426	1249431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987454
33529	NC_008011	A	7	7	1249550	1249556	100 %	0 %	0 %	0 %	94987454
33530	NC_008011	GCAT	2	8	1249628	1249635	25 %	25 %	25 %	25 %	94987454
33531	NC_008011	A	8	8	1249652	1249659	100 %	0 %	0 %	0 %	94987454
33532	NC_008011	ATA	2	6	1249667	1249672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987454
33533	NC_008011	ACT	2	6	1249687	1249692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987455
33534	NC_008011	GTTA	2	8	1249733	1249740	25 %	50 %	25 %	0 %	94987455
33535	NC_008011	TTG	2	6	1249886	1249891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987455
33536	NC_008011	GAT	2	6	1249964	1249969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987455
33537	NC_008011	ATAG	2	8	1249977	1249984	50 %	25 %	25 %	0 %	94987455
33538	NC_008011	GAA	2	6	1250026	1250031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987455
33539	NC_008011	TCC	2	6	1250081	1250086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987455
33540	NC_008011	AAT	2	6	1250219	1250224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987455
33541	NC_008011	AGT	2	6	1250226	1250231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987455
33542	NC_008011	AAC	2	6	1250234	1250239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987455
33543	NC_008011	AAG	2	6	1250261	1250266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987455
33544	NC_008011	TCC	2	6	1250309	1250314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987455
33545	NC_008011	A	6	6	1250321	1250326	100 %	0 %	0 %	0 %	94987455
33546	NC_008011	CCAA	2	8	1250357	1250364	50 %	0 %	0 %	50 %	94987455
33547	NC_008011	AAT	2	6	1250403	1250408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987455
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33551	NC_008011	AAG	3	9	1250717	1250725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987455
33552	NC_008011	ATA	2	6	1250818	1250823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987455
33553	NC_008011	AT	3	6	1250892	1250897	50 %	50 %	0 %	0 %	94987455
33554	NC_008011	TAG	2	6	1250910	1250915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33555	NC_008011	TTG	2	6	1250917	1250922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33556	NC_008011	A	6	6	1250928	1250933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33557	NC_008011	ATT	2	6	1250960	1250965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33558	NC_008011	AATT	2	8	1250967	1250974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33559	NC_008011	T	6	6	1250984	1250989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33560	NC_008011	AGAT	2	8	1250999	1251006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_008011	ATA	2	6	1251013	1251018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33562	NC_008011	ATGA	2	8	1251041	1251048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33563	NC_008011	AT	3	6	1251053	1251058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33564	NC_008011	TTA	2	6	1251061	1251066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33565	NC_008011	AT	3	6	1251087	1251092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33566	NC_008011	GTTATA	2	12	1251115	1251126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33567	NC_008011	AGA	3	9	1251146	1251154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33568	NC_008011	TTA	2	6	1251158	1251163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33569	NC_008011	T	8	8	1251306	1251313	0 %	100 %	0 %	0 %	94987456
33570	NC_008011	CTC	2	6	1251314	1251319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987456
33571	NC_008011	A	6	6	1251365	1251370	100 %	0 %	0 %	0 %	94987456
33572	NC_008011	GTA	2	6	1251430	1251435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987456
33573	NC_008011	TATG	2	8	1251446	1251453	25 %	50 %	25 %	0 %	94987456
33574	NC_008011	TCT	2	6	1251481	1251486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987456
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33579	NC_008011	TTA	2	6	1251676	1251681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987456
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33587	NC_008011	GAAA	2	8	1252214	1252221	75 %	0 %	25 %	0 %	94987457
33588	NC_008011	ACATCT	2	12	1252236	1252247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987457
33589	NC_008011	CTTG	2	8	1252320	1252327	0 %	50 %	25 %	25 %	94987457
33590	NC_008011	ATG	2	6	1252468	1252473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987457
33591	NC_008011	TAT	2	6	1252477	1252482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987457
33592	NC_008011	T	6	6	1252482	1252487	0 %	100 %	0 %	0 %	94987457
33593	NC_008011	CAA	2	6	1252588	1252593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987457
33594	NC_008011	TTG	2	6	1252686	1252691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987457
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33596	NC_008011	GGA	2	6	1252746	1252751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987457
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33600	NC_008011	TGGT	2	8	1252924	1252931	0 %	50 %	50 %	0 %	94987457
33601	NC_008011	GTT	2	6	1253023	1253028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987457
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33603	NC_008011	GAA	2	6	1253058	1253063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987457
33604	NC_008011	AT	3	6	1253127	1253132	50 %	50 %	0 %	0 %	94987457
33605	NC_008011	AAAG	2	8	1253154	1253161	75 %	0 %	25 %	0 %	94987457
33606	NC_008011	TAA	2	6	1253234	1253239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987457
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33608	NC_008011	CTT	2	6	1253316	1253321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33609	NC_008011	GGAA	2	8	1253346	1253353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33610	NC_008011	TGA	2	6	1253432	1253437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33611	NC_008011	ATT	2	6	1253449	1253454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33612	NC_008011	GCT	2	6	1253481	1253486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33613	NC_008011	TTTA	2	8	1253499	1253506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33614	NC_008011	ATAA	2	8	1253529	1253536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33615	NC_008011	A	6	6	1253543	1253548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33616	NC_008011	T	7	7	1253549	1253555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33617	NC_008011	TTTA	4	16	1253561	1253576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33618	NC_008011	GAG	2	6	1253592	1253597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33620	NC_008011	TGT	2	6	1253694	1253699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987458
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33980	NC_008011	CTT	2	6	1267304	1267309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987469
33981	NC_008011	GA	4	8	1267395	1267402	50 %	0 %	50 %	0 %	94987469
33982	NC_008011	AG	3	6	1267520	1267525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33983	NC_008011	TAC	2	6	1267557	1267562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33984	NC_008011	T	7	7	1267591	1267597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33985	NC_008011	TAATT	2	10	1267653	1267662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33986	NC_008011	T	9	9	1267674	1267682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33987	NC_008011	AATG	2	8	1267690	1267697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33988	NC_008011	AAG	2	6	1267767	1267772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33989	NC_008011	TTAAG	2	10	1267835	1267844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33990	NC_008011	GTCC	2	8	1267909	1267916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33991	NC_008011	TAT	2	6	1267935	1267940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33992	NC_008011	TAA	2	6	1267957	1267962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33993	NC_008011	TAG	2	6	1268213	1268218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33994	NC_008011	T	7	7	1268300	1268306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33995	NC_008011	T	8	8	1268309	1268316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33996	NC_008011	ATA	3	9	1268322	1268330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33997	NC_008011	T	7	7	1268384	1268390	0 %	100 %	0 %	0 %	94987470
33998	NC_008011	TAT	2	6	1268402	1268407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987470
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