MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_008011	AGTA	2	8	1228775	1228782	50 %	25 %	25 %	0 %	94987438
33003	NC_008011	TAT	2	6	1228802	1228807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_008011	TGAT	2	8	1228825	1228832	25 %	50 %	25 %	0 %	94987439
33005	NC_008011	GAT	2	6	1228947	1228952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987439
33006	NC_008011	TGAT	2	8	1228981	1228988	25 %	50 %	25 %	0 %	94987439
33007	NC_008011	CAT	2	6	1229022	1229027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987439
33008	NC_008011	CAA	2	6	1229263	1229268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987439
33009	NC_008011	T	7	7	1229291	1229297	0 %	100 %	0 %	0 %	94987439
33010	NC_008011	TACA	2	8	1229378	1229385	50 %	25 %	0 %	25 %	94987439
33011	NC_008011	CAG	2	6	1229509	1229514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987439
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33013	NC_008011	A	8	8	1229625	1229632	100 %	0 %	0 %	0 %	94987439
33014	NC_008011	TGC	2	6	1229690	1229695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987439
33015	NC_008011	TCAT	2	8	1229735	1229742	25 %	50 %	0 %	25 %	94987439
33016	NC_008011	TAA	2	6	1229755	1229760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987439
33017	NC_008011	TTC	2	6	1229830	1229835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987439
33018	NC_008011	TTTAT	2	10	1229873	1229882	20 %	80 %	0 %	0 %	94987439
33019	NC_008011	GTC	2	6	1229923	1229928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987439
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33025	NC_008011	TG	3	6	1230177	1230182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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33039	NC_008011	TTATA	2	10	1230818	1230827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33040	NC_008011	TA	3	6	1230835	1230840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33041	NC_008011	T	7	7	1230854	1230860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33042	NC_008011	TCTT	2	8	1230872	1230879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33043	NC_008011	T	7	7	1230878	1230884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33044	NC_008011	TA	3	6	1230954	1230959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33051	NC_008011	ATT	2	6	1231081	1231086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33052	NC_008011	TTTA	2	8	1231087	1231094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33053	NC_008011	TAA	2	6	1231096	1231101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33101	NC_008011	ATT	2	6	1233024	1233029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33103	NC_008011	AAT	2	6	1233088	1233093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_008011	A	7	7	1233098	1233104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_008011	AACA	2	8	1233106	1233113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33106	NC_008011	TAAA	2	8	1233124	1233131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33107	NC_008011	ATA	2	6	1233149	1233154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33108	NC_008011	TAA	2	6	1233160	1233165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33109	NC_008011	AAC	2	6	1233189	1233194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33110	NC_008011	TAT	2	6	1233204	1233209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33111	NC_008011	AT	3	6	1233251	1233256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33112	NC_008011	TA	4	8	1233257	1233264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33113	NC_008011	AT	3	6	1233265	1233270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33114	NC_008011	A	6	6	1233283	1233288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33115	NC_008011	TAT	3	9	1233297	1233305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33116	NC_008011	ATA	2	6	1233316	1233321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33117	NC_008011	ATA	2	6	1233335	1233340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33118	NC_008011	TAT	2	6	1233341	1233346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33119	NC_008011	ATA	2	6	1233347	1233352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33120	NC_008011	TAT	2	6	1233356	1233361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33121	NC_008011	AAT	2	6	1233380	1233385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33122	NC_008011	TTA	2	6	1233457	1233462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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