MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_008011	ACA	2	6	1061432	1061437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28502	NC_008011	TAC	2	6	1061445	1061450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28503	NC_008011	ACA	2	6	1061488	1061493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28504	NC_008011	CTG	2	6	1061501	1061506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28505	NC_008011	AAG	2	6	1061529	1061534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28506	NC_008011	CAG	2	6	1061540	1061545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28507	NC_008011	CCA	2	6	1061583	1061588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28508	NC_008011	TAG	2	6	1061595	1061600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28509	NC_008011	ACA	2	6	1061618	1061623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28510	NC_008011	TTA	2	6	1061637	1061642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28511	NC_008011	GGTT	2	8	1061673	1061680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_008011	TAA	2	6	1061693	1061698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28513	NC_008011	TAC	2	6	1061699	1061704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28514	NC_008011	ATA	2	6	1061706	1061711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28515	NC_008011	TTA	2	6	1061720	1061725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28516	NC_008011	T	6	6	1061726	1061731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28517	NC_008011	AAT	2	6	1061733	1061738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28518	NC_008011	TA	3	6	1061754	1061759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28519	NC_008011	TAA	2	6	1061762	1061767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28520	NC_008011	ATT	2	6	1061778	1061783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28521	NC_008011	TGT	2	6	1061805	1061810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28522	NC_008011	AT	3	6	1061817	1061822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28523	NC_008011	AT	3	6	1061845	1061850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28524	NC_008011	TAAA	2	8	1061870	1061877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28525	NC_008011	TAT	2	6	1061905	1061910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28526	NC_008011	AT	3	6	1061909	1061914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28527	NC_008011	TTA	2	6	1061938	1061943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28528	NC_008011	TAG	3	9	1061949	1061957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28529	NC_008011	TA	3	6	1061959	1061964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28530	NC_008011	AT	3	6	1061977	1061982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28531	NC_008011	TAA	3	9	1061991	1061999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28532	NC_008011	T	7	7	1062012	1062018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28533	NC_008011	ATAG	2	8	1062039	1062046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28534	NC_008011	AAGA	2	8	1062058	1062065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28535	NC_008011	ATTA	2	8	1062087	1062094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28536	NC_008011	ATT	2	6	1062099	1062104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28537	NC_008011	AAT	2	6	1062108	1062113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28538	NC_008011	AGG	2	6	1062153	1062158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28539	NC_008011	TAG	2	6	1062198	1062203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28540	NC_008011	AGTT	2	8	1062256	1062263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28541	NC_008011	TTTAT	2	10	1062271	1062280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28542	NC_008011	TAT	2	6	1062294	1062299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28543	NC_008011	GTTG	2	8	1062314	1062321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28544	NC_008011	TGT	2	6	1062408	1062413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28545	NC_008011	T	8	8	1062430	1062437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28546	NC_008011	GA	3	6	1062450	1062455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28547	NC_008011	CTA	2	6	1062475	1062480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28548	NC_008011	TGT	2	6	1062488	1062493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28549	NC_008011	T	8	8	1062544	1062551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28550	NC_008011	TAA	2	6	1062575	1062580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28551	NC_008011	TTG	2	6	1062581	1062586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28552	NC_008011	GTA	2	6	1062596	1062601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28553	NC_008011	TAA	2	6	1062661	1062666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987296
28554	NC_008011	TCT	2	6	1062677	1062682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987296
28555	NC_008011	TTC	2	6	1062757	1062762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987296
28556	NC_008011	AT	3	6	1062776	1062781	50 %	50 %	0 %	0 %	94987296
28557	NC_008011	AT	3	6	1062824	1062829	50 %	50 %	0 %	0 %	94987296
28558	NC_008011	TGATCT	2	12	1062923	1062934	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94987296
28559	NC_008011	ATC	2	6	1063006	1063011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987296
28560	NC_008011	TA	3	6	1063029	1063034	50 %	50 %	0 %	0 %	94987296
28561	NC_008011	TAC	2	6	1063056	1063061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987296
28562	NC_008011	AAG	2	6	1063075	1063080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987296
28563	NC_008011	GTA	2	6	1063121	1063126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987296
28564	NC_008011	CAT	2	6	1063189	1063194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987296
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28569	NC_008011	CAT	2	6	1063417	1063422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987296
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28572	NC_008011	GGA	2	6	1063562	1063567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987296
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28575	NC_008011	ATAA	2	8	1063742	1063749	75 %	25 %	0 %	0 %	94987296
28576	NC_008011	GCA	2	6	1063781	1063786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987296
28577	NC_008011	TCA	2	6	1063802	1063807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987296
28578	NC_008011	AG	3	6	1063813	1063818	50 %	0 %	50 %	0 %	94987296
28579	NC_008011	CAAC	2	8	1063866	1063873	50 %	0 %	0 %	50 %	94987296
28580	NC_008011	ACT	2	6	1063877	1063882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987296
28581	NC_008011	TTTAC	2	10	1063886	1063895	20 %	60 %	0 %	20 %	94987296
28582	NC_008011	CTTT	2	8	1063916	1063923	0 %	75 %	0 %	25 %	94987296
28583	NC_008011	TTTAT	2	10	1063974	1063983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28584	NC_008011	TAT	2	6	1064028	1064033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987297
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28588	NC_008011	T	6	6	1064099	1064104	0 %	100 %	0 %	0 %	94987297
28589	NC_008011	AT	3	6	1064118	1064123	50 %	50 %	0 %	0 %	94987297
28590	NC_008011	ATG	2	6	1064152	1064157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987297
28591	NC_008011	GTT	2	6	1064173	1064178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987297
28592	NC_008011	AT	3	6	1064187	1064192	50 %	50 %	0 %	0 %	94987297
28593	NC_008011	AGTG	2	8	1064209	1064216	25 %	25 %	50 %	0 %	94987297
28594	NC_008011	TAG	2	6	1064241	1064246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987297
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28596	NC_008011	AGA	2	6	1064269	1064274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987297
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28603	NC_008011	T	6	6	1064442	1064447	0 %	100 %	0 %	0 %	94987297
28604	NC_008011	AGA	2	6	1064449	1064454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987297
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28615	NC_008011	ATA	2	6	1064862	1064867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987297
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