MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_008011	TAA	2	6	615616	615621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986945
16503	NC_008011	CTTTA	2	10	615635	615644	20 %	60 %	0 %	20 %	94986945
16504	NC_008011	GGA	2	6	615747	615752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986945
16505	NC_008011	A	6	6	615798	615803	100 %	0 %	0 %	0 %	94986945
16506	NC_008011	A	6	6	615805	615810	100 %	0 %	0 %	0 %	94986945
16507	NC_008011	AAAT	2	8	615838	615845	75 %	25 %	0 %	0 %	94986945
16508	NC_008011	TAAT	2	8	615856	615863	50 %	50 %	0 %	0 %	94986945
16509	NC_008011	GAG	2	6	615885	615890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986945
16510	NC_008011	GGT	3	9	615897	615905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986945
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16513	NC_008011	ACT	2	6	616072	616077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986946
16514	NC_008011	TTTC	2	8	616083	616090	0 %	75 %	0 %	25 %	94986946
16515	NC_008011	ATT	2	6	616109	616114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986946
16516	NC_008011	CTGAC	2	10	616142	616151	20 %	20 %	20 %	40 %	94986946
16517	NC_008011	TAA	2	6	616155	616160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986946
16518	NC_008011	A	6	6	616246	616251	100 %	0 %	0 %	0 %	94986946
16519	NC_008011	TGT	2	6	616261	616266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986946
16520	NC_008011	ATTG	2	8	616274	616281	25 %	50 %	25 %	0 %	94986946
16521	NC_008011	TTA	2	6	616372	616377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_008011	ATA	2	6	616434	616439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_008011	AAT	2	6	616441	616446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_008011	A	7	7	616447	616453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_008011	ACC	2	6	616475	616480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16526	NC_008011	AATA	2	8	616487	616494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_008011	AAT	2	6	616520	616525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_008011	TA	3	6	616558	616563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_008011	TTC	2	6	616581	616586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16530	NC_008011	ACAA	2	8	616621	616628	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16531	NC_008011	GACCCT	2	12	616645	616656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16532	NC_008011	TAC	2	6	616676	616681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16533	NC_008011	ATA	2	6	616694	616699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16534	NC_008011	TATG	2	8	616710	616717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_008011	TCCA	2	8	616729	616736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16536	NC_008011	T	6	6	616748	616753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_008011	TATC	2	8	616759	616766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16538	NC_008011	ATA	2	6	616773	616778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_008011	TAT	2	6	616807	616812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_008011	CTT	2	6	616841	616846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16541	NC_008011	TTA	2	6	616875	616880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_008011	A	7	7	616884	616890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_008011	CTA	2	6	616905	616910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16545	NC_008011	GAA	2	6	616934	616939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_008011	TTG	2	6	616965	616970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_008011	TA	3	6	616989	616994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_008011	T	6	6	617008	617013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16557	NC_008011	TCTT	2	8	617209	617216	0 %	75 %	0 %	25 %	94986947
16558	NC_008011	TACAA	2	10	617227	617236	60 %	20 %	0 %	20 %	94986947
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16563	NC_008011	GCA	3	9	617477	617485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986947
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16568	NC_008011	TTCT	2	8	617819	617826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16599	NC_008011	CAA	2	6	619263	619268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986949
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16608	NC_008011	TTA	2	6	619615	619620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16609	NC_008011	TTA	2	6	619644	619649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986950
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16622	NC_008011	A	6	6	620392	620397	100 %	0 %	0 %	0 %	94986950
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