MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008011	CAA	2	6	577982	577987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15502	NC_008011	AGC	2	6	578061	578066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_008011	AGCA	2	8	578088	578095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15504	NC_008011	TCT	2	6	578110	578115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_008011	CTA	2	6	578123	578128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_008011	ATGG	2	8	578146	578153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_008011	AGA	2	6	578160	578165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_008011	ATTG	2	8	578179	578186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_008011	TGG	2	6	578251	578256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_008011	CAG	2	6	578275	578280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_008011	ATAAA	2	10	578331	578340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_008011	A	7	7	578422	578428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_008011	TTA	2	6	578432	578437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_008011	TAA	2	6	578451	578456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_008011	A	6	6	578455	578460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_008011	AT	4	8	578464	578471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_008011	TA	3	6	578473	578478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_008011	AAT	2	6	578529	578534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_008011	TAA	2	6	578554	578559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_008011	ATAC	2	8	578596	578603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15521	NC_008011	TAAAA	2	10	578642	578651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_008011	AAT	2	6	578675	578680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_008011	TCA	2	6	578705	578710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_008011	AGA	2	6	578731	578736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_008011	TTA	2	6	578866	578871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_008011	GAT	2	6	578939	578944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_008011	ACC	2	6	578967	578972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15528	NC_008011	TAC	2	6	578980	578985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_008011	ACAAA	2	10	578999	579008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15530	NC_008011	A	6	6	579006	579011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_008011	TTAT	2	8	579014	579021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_008011	TACT	2	8	579037	579044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15533	NC_008011	TA	3	6	579067	579072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_008011	ATA	2	6	579084	579089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_008011	AAAG	2	8	579105	579112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_008011	AAAT	2	8	579166	579173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_008011	AAC	2	6	579179	579184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_008011	TA	3	6	579227	579232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_008011	ATT	2	6	579258	579263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_008011	A	6	6	579284	579289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_008011	T	6	6	579327	579332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_008011	TTACT	2	10	579340	579349	20 %	60 %	0 %	20 %	94986917
15543	NC_008011	A	6	6	579437	579442	100 %	0 %	0 %	0 %	94986917
15544	NC_008011	A	7	7	579492	579498	100 %	0 %	0 %	0 %	94986917
15545	NC_008011	GTT	2	6	579563	579568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986917
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15548	NC_008011	CAAA	2	8	579623	579630	75 %	0 %	0 %	25 %	94986917
15549	NC_008011	AT	3	6	579641	579646	50 %	50 %	0 %	0 %	94986917
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15552	NC_008011	CT	3	6	579775	579780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15553	NC_008011	A	6	6	579810	579815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_008011	CAAA	2	8	579849	579856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15555	NC_008011	AATTA	2	10	579864	579873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_008011	GTT	2	6	579904	579909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15562	NC_008011	TGC	2	6	580281	580286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986918
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15567	NC_008011	CTA	2	6	580391	580396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15569	NC_008011	TA	4	8	580490	580497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_008011	ATA	2	6	580511	580516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_008011	TA	3	6	580515	580520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_008011	ATA	3	9	580527	580535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_008011	TTA	3	9	580564	580572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_008011	ATATT	2	10	580574	580583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_008011	ATA	2	6	580595	580600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_008011	ATA	3	9	580614	580622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15581	NC_008011	TAA	2	6	580711	580716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_008011	TAAA	2	8	580730	580737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_008011	TAGC	2	8	580739	580746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15584	NC_008011	AT	3	6	580754	580759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15594	NC_008011	TATAT	2	10	581143	581152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_008011	CTAT	2	8	581164	581171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15602	NC_008011	TTA	2	6	581402	581407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986919
15603	NC_008011	CA	3	6	581415	581420	50 %	0 %	0 %	50 %	94986919
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15607	NC_008011	CA	3	6	581617	581622	50 %	0 %	0 %	50 %	94986919
15608	NC_008011	AT	3	6	581633	581638	50 %	50 %	0 %	0 %	94986919
15609	NC_008011	TTC	2	6	581670	581675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986919
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15612	NC_008011	TA	3	6	581735	581740	50 %	50 %	0 %	0 %	94986919
15613	NC_008011	CT	3	6	581742	581747	0 %	50 %	0 %	50 %	94986919
15614	NC_008011	CT	3	6	581752	581757	0 %	50 %	0 %	50 %	94986919
15615	NC_008011	GCAC	2	8	581758	581765	25 %	0 %	25 %	50 %	94986919
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