MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008011	ATT	2	6	559422	559427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_008011	TAT	2	6	559475	559480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986906
15003	NC_008011	TC	3	6	559532	559537	0 %	50 %	0 %	50 %	94986906
15004	NC_008011	ATA	2	6	559560	559565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15005	NC_008011	T	7	7	559615	559621	0 %	100 %	0 %	0 %	94986906
15006	NC_008011	TCC	2	6	559663	559668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986906
15007	NC_008011	A	6	6	559688	559693	100 %	0 %	0 %	0 %	94986906
15008	NC_008011	AGT	2	6	559696	559701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986906
15009	NC_008011	TTCT	2	8	559724	559731	0 %	75 %	0 %	25 %	94986906
15010	NC_008011	TAA	2	6	559738	559743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15011	NC_008011	GAAAA	2	10	559746	559755	80 %	0 %	20 %	0 %	94986906
15012	NC_008011	ACTT	2	8	559756	559763	25 %	50 %	0 %	25 %	94986906
15013	NC_008011	GCT	2	6	559781	559786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986906
15014	NC_008011	TAA	2	6	559798	559803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15015	NC_008011	ATT	2	6	559846	559851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986906
15016	NC_008011	TAAA	2	8	559860	559867	75 %	25 %	0 %	0 %	94986906
15017	NC_008011	TG	3	6	559883	559888	0 %	50 %	50 %	0 %	94986906
15018	NC_008011	AAAT	2	8	559902	559909	75 %	25 %	0 %	0 %	94986906
15019	NC_008011	ACAA	2	8	559976	559983	75 %	0 %	0 %	25 %	94986906
15020	NC_008011	TGC	2	6	559984	559989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986906
15021	NC_008011	ATT	2	6	560008	560013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986906
15022	NC_008011	TAA	2	6	560046	560051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15023	NC_008011	GAT	2	6	560052	560057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986906
15024	NC_008011	ATA	2	6	560096	560101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15025	NC_008011	CA	3	6	560168	560173	50 %	0 %	0 %	50 %	94986906
15026	NC_008011	CA	3	6	560248	560253	50 %	0 %	0 %	50 %	94986906
15027	NC_008011	GGTT	2	8	560281	560288	0 %	50 %	50 %	0 %	94986906
15028	NC_008011	ATA	2	6	560339	560344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15029	NC_008011	A	6	6	560417	560422	100 %	0 %	0 %	0 %	94986906
15030	NC_008011	ATAA	2	8	560427	560434	75 %	25 %	0 %	0 %	94986906
15031	NC_008011	TA	3	6	560469	560474	50 %	50 %	0 %	0 %	94986906
15032	NC_008011	TTTC	2	8	560480	560487	0 %	75 %	0 %	25 %	94986906
15033	NC_008011	TAA	2	6	560494	560499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15034	NC_008011	ATC	2	6	560518	560523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986906
15035	NC_008011	TGAG	2	8	560542	560549	25 %	25 %	50 %	0 %	94986906
15036	NC_008011	AAT	2	6	560623	560628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986906
15037	NC_008011	GCTGTT	2	12	560643	560654	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94986906
15038	NC_008011	TCC	2	6	560686	560691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986906
15039	NC_008011	T	6	6	560730	560735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_008011	CTC	2	6	560852	560857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986907
15041	NC_008011	CTG	2	6	560858	560863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986907
15042	NC_008011	GCA	2	6	560908	560913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986907
15043	NC_008011	TCC	2	6	560922	560927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986907
15044	NC_008011	CAA	2	6	560930	560935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986907
15045	NC_008011	CATT	2	8	561044	561051	25 %	50 %	0 %	25 %	94986907
15046	NC_008011	TCA	2	6	561103	561108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986907
15047	NC_008011	ATC	2	6	561117	561122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986907
15048	NC_008011	TAT	2	6	561132	561137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986907
15049	NC_008011	GAT	2	6	561196	561201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986907
15050	NC_008011	TCT	2	6	561214	561219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986907
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15052	NC_008011	C	6	6	561340	561345	0 %	0 %	0 %	100 %	94986907
15053	NC_008011	TC	3	6	561379	561384	0 %	50 %	0 %	50 %	94986907
15054	NC_008011	TGC	2	6	561393	561398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986907
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15056	NC_008011	CAA	2	6	561482	561487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986907
15057	NC_008011	TTG	2	6	561533	561538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986907
15058	NC_008011	AAT	2	6	561555	561560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986907
15059	NC_008011	CTA	2	6	561563	561568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986907
15060	NC_008011	GAT	2	6	561572	561577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986907
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15062	NC_008011	CAG	2	6	561614	561619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986907
15063	NC_008011	CATG	2	8	561637	561644	25 %	25 %	25 %	25 %	94986907
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15065	NC_008011	TTTTC	2	10	561761	561770	0 %	80 %	0 %	20 %	94986907
15066	NC_008011	CA	3	6	561794	561799	50 %	0 %	0 %	50 %	94986907
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15073	NC_008011	TAAGT	2	10	562089	562098	40 %	40 %	20 %	0 %	94986907
15074	NC_008011	TCT	2	6	562126	562131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_008011	TTA	2	6	562135	562140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_008011	CTAAT	2	10	562194	562203	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15077	NC_008011	ATA	2	6	562214	562219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_008011	A	6	6	562242	562247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_008011	ACTT	2	8	562257	562264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15081	NC_008011	CTT	2	6	562291	562296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_008011	A	6	6	562304	562309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_008011	TAG	2	6	562317	562322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15086	NC_008011	ATA	2	6	562369	562374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_008011	TA	3	6	562373	562378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_008011	A	6	6	562378	562383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_008011	AATA	2	8	562404	562411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_008011	T	6	6	562431	562436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_008011	T	6	6	562480	562485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15104	NC_008011	AT	3	6	563001	563006	50 %	50 %	0 %	0 %	94986908
15105	NC_008011	GGTTA	2	10	563024	563033	20 %	40 %	40 %	0 %	94986908
15106	NC_008011	A	8	8	563043	563050	100 %	0 %	0 %	0 %	94986908
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15112	NC_008011	TGT	2	6	563244	563249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986908
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15114	NC_008011	TCTG	2	8	563274	563281	0 %	50 %	25 %	25 %	94986908
15115	NC_008011	TA	3	6	563324	563329	50 %	50 %	0 %	0 %	94986908
15116	NC_008011	A	6	6	563365	563370	100 %	0 %	0 %	0 %	94986908
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15500	NC_008011	ACT	2	6	577941	577946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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