MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008011	AAT	2	6	521453	521458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_008011	A	6	6	521543	521548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_008011	TCA	2	6	521549	521554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_008011	AT	4	8	521579	521586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_008011	TA	3	6	521595	521600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_008011	TAT	2	6	521603	521608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_008011	AAG	2	6	521621	521626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_008011	TTTAT	2	10	521694	521703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_008011	A	6	6	521706	521711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_008011	TCT	3	9	521749	521757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_008011	T	8	8	521759	521766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_008011	TA	3	6	521797	521802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_008011	ATT	2	6	521836	521841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_008011	AT	3	6	521855	521860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_008011	ACA	2	6	521867	521872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_008011	AAAATA	2	12	521896	521907	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_008011	T	6	6	521914	521919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_008011	TAT	2	6	521942	521947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_008011	AG	3	6	521958	521963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_008011	TA	3	6	521980	521985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_008011	TAAT	2	8	522021	522028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_008011	AAAT	2	8	522035	522042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_008011	GGC	2	6	522156	522161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_008011	GCC	2	6	522221	522226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_008011	TAC	2	6	522270	522275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_008011	ATA	2	6	522278	522283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_008011	AT	3	6	522351	522356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_008011	ATT	2	6	522401	522406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_008011	A	6	6	522454	522459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_008011	TGCT	2	8	522460	522467	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14031	NC_008011	TCT	2	6	522481	522486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_008011	AAT	2	6	522501	522506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_008011	AATA	2	8	522508	522515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_008011	TA	3	6	522514	522519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_008011	GCA	2	6	522596	522601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986871
14036	NC_008011	AT	3	6	522630	522635	50 %	50 %	0 %	0 %	94986871
14037	NC_008011	GGA	2	6	522665	522670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986871
14038	NC_008011	CAT	2	6	522672	522677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986871
14039	NC_008011	TTC	2	6	522678	522683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986871
14040	NC_008011	TAT	2	6	522691	522696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986871
14041	NC_008011	TTG	2	6	522705	522710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986871
14042	NC_008011	A	6	6	522782	522787	100 %	0 %	0 %	0 %	94986871
14043	NC_008011	TTC	2	6	522790	522795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986871
14044	NC_008011	TGG	2	6	522803	522808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986871
14045	NC_008011	CT	3	6	522830	522835	0 %	50 %	0 %	50 %	94986871
14046	NC_008011	AT	3	6	522878	522883	50 %	50 %	0 %	0 %	94986871
14047	NC_008011	ACA	2	6	522920	522925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986871
14048	NC_008011	TGT	2	6	522931	522936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986871
14049	NC_008011	CTT	2	6	522959	522964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986871
14050	NC_008011	TAT	2	6	522984	522989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986871
14051	NC_008011	ATT	2	6	523004	523009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986871
14052	NC_008011	TTG	2	6	523011	523016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986871
14053	NC_008011	GTA	2	6	523113	523118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986871
14054	NC_008011	T	6	6	523217	523222	0 %	100 %	0 %	0 %	94986871
14055	NC_008011	GAT	2	6	523274	523279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986871
14056	NC_008011	TC	3	6	523336	523341	0 %	50 %	0 %	50 %	94986871
14057	NC_008011	AGT	2	6	523360	523365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986871
14058	NC_008011	CTG	2	6	523443	523448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986871
14059	NC_008011	T	6	6	523469	523474	0 %	100 %	0 %	0 %	94986871
14060	NC_008011	GCA	2	6	523481	523486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986871
14061	NC_008011	A	6	6	523564	523569	100 %	0 %	0 %	0 %	94986871
14062	NC_008011	TAC	2	6	523570	523575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986871
14063	NC_008011	ATT	3	9	523577	523585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986871
14064	NC_008011	TTTC	2	8	523666	523673	0 %	75 %	0 %	25 %	94986871
14065	NC_008011	TCC	2	6	523691	523696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986871
14066	NC_008011	AGG	2	6	523714	523719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986871
14067	NC_008011	AACA	2	8	523754	523761	75 %	0 %	0 %	25 %	94986871
14068	NC_008011	ATGC	2	8	523769	523776	25 %	25 %	25 %	25 %	94986871
14069	NC_008011	CTT	2	6	523820	523825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986871
14070	NC_008011	TTA	2	6	523854	523859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986871
14071	NC_008011	ATTT	2	8	523887	523894	25 %	75 %	0 %	0 %	94986871
14072	NC_008011	AT	4	8	523897	523904	50 %	50 %	0 %	0 %	94986871
14073	NC_008011	TTAA	2	8	523905	523912	50 %	50 %	0 %	0 %	94986871
14074	NC_008011	ACTT	2	8	523986	523993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14075	NC_008011	A	7	7	524008	524014	100 %	0 %	0 %	0 %	94986872
14076	NC_008011	A	8	8	524111	524118	100 %	0 %	0 %	0 %	94986872
14077	NC_008011	AAAC	2	8	524137	524144	75 %	0 %	0 %	25 %	94986872
14078	NC_008011	AGA	2	6	524145	524150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986872
14079	NC_008011	ATAA	2	8	524181	524188	75 %	25 %	0 %	0 %	94986872
14080	NC_008011	AAT	2	6	524194	524199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986872
14081	NC_008011	TGT	2	6	524349	524354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986872
14082	NC_008011	AT	3	6	524390	524395	50 %	50 %	0 %	0 %	94986872
14083	NC_008011	CAA	2	6	524414	524419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986872
14084	NC_008011	CTG	2	6	524492	524497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986872
14085	NC_008011	CCTAA	2	10	524530	524539	40 %	20 %	0 %	40 %	94986872
14086	NC_008011	CAG	2	6	524543	524548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986872
14087	NC_008011	ATA	2	6	524549	524554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986872
14088	NC_008011	CTT	2	6	524567	524572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986872
14089	NC_008011	TAA	2	6	524573	524578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986872
14090	NC_008011	TGT	2	6	524581	524586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986872
14091	NC_008011	AGTA	2	8	524676	524683	50 %	25 %	25 %	0 %	94986872
14092	NC_008011	TAG	2	6	524708	524713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986872
14093	NC_008011	GTAG	2	8	524788	524795	25 %	25 %	50 %	0 %	94986872
14094	NC_008011	CCA	2	6	524809	524814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986872
14095	NC_008011	T	7	7	524857	524863	0 %	100 %	0 %	0 %	94986872
14096	NC_008011	T	6	6	524865	524870	0 %	100 %	0 %	0 %	94986872
14097	NC_008011	TCC	2	6	524919	524924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986872
14098	NC_008011	TGTT	2	8	524937	524944	0 %	75 %	25 %	0 %	94986872
14099	NC_008011	A	7	7	524992	524998	100 %	0 %	0 %	0 %	94986872
14100	NC_008011	T	7	7	525019	525025	0 %	100 %	0 %	0 %	94986872
14101	NC_008011	GGAA	2	8	525044	525051	50 %	0 %	50 %	0 %	94986872
14102	NC_008011	TACA	2	8	525070	525077	50 %	25 %	0 %	25 %	94986872
14103	NC_008011	AT	3	6	525093	525098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_008011	TCAAA	2	10	525151	525160	60 %	20 %	0 %	20 %	94986873
14105	NC_008011	T	6	6	525170	525175	0 %	100 %	0 %	0 %	94986873
14106	NC_008011	A	9	9	525188	525196	100 %	0 %	0 %	0 %	94986873
14107	NC_008011	CAACA	2	10	525284	525293	60 %	0 %	0 %	40 %	94986873
14108	NC_008011	TAT	2	6	525345	525350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986873
14109	NC_008011	GCT	2	6	525424	525429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986873
14110	NC_008011	AAG	2	6	525434	525439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986873
14111	NC_008011	ATC	2	6	525518	525523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986873
14112	NC_008011	GATA	2	8	525531	525538	50 %	25 %	25 %	0 %	94986873
14113	NC_008011	ATT	2	6	525572	525577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986873
14114	NC_008011	TATT	2	8	525592	525599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_008011	TTC	2	6	525612	525617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_008011	ACTA	2	8	525668	525675	50 %	25 %	0 %	25 %	94986874
14117	NC_008011	A	6	6	525703	525708	100 %	0 %	0 %	0 %	94986874
14118	NC_008011	AAC	2	6	525714	525719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986874
14119	NC_008011	TATC	2	8	525754	525761	25 %	50 %	0 %	25 %	94986874
14120	NC_008011	ATA	2	6	525784	525789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986874
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14123	NC_008011	TAA	2	6	525935	525940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986874
14124	NC_008011	AGA	2	6	525966	525971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_008011	TAA	2	6	525976	525981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_008011	TAAT	2	8	526011	526018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_008011	AGG	2	6	526064	526069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14495	NC_008011	TA	3	6	539680	539685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14499	NC_008011	A	6	6	539761	539766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_008011	ACA	2	6	539768	539773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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