MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008011	A	6	6	502261	502266	100 %	0 %	0 %	0 %	94986853
13502	NC_008011	TCC	2	6	502299	502304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986853
13503	NC_008011	AAT	2	6	502362	502367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986853
13504	NC_008011	GAAA	2	8	502452	502459	75 %	0 %	25 %	0 %	94986853
13505	NC_008011	AGT	2	6	502481	502486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986853
13506	NC_008011	GTA	2	6	502498	502503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986853
13507	NC_008011	AAT	2	6	502563	502568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986853
13508	NC_008011	AT	3	6	502576	502581	50 %	50 %	0 %	0 %	94986853
13509	NC_008011	ATG	2	6	502601	502606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986853
13510	NC_008011	A	6	6	502653	502658	100 %	0 %	0 %	0 %	94986853
13511	NC_008011	TCTTG	2	10	502668	502677	0 %	60 %	20 %	20 %	94986853
13512	NC_008011	T	6	6	502694	502699	0 %	100 %	0 %	0 %	94986853
13513	NC_008011	ATA	2	6	502737	502742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986853
13514	NC_008011	GCA	3	9	502758	502766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986853
13515	NC_008011	CAT	2	6	502786	502791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986853
13516	NC_008011	CT	3	6	502797	502802	0 %	50 %	0 %	50 %	94986853
13517	NC_008011	GAC	2	6	502832	502837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986853
13518	NC_008011	CCA	2	6	502887	502892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986853
13519	NC_008011	AAC	2	6	502894	502899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986853
13520	NC_008011	CAA	2	6	502900	502905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986853
13521	NC_008011	TTC	2	6	502937	502942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986853
13522	NC_008011	ATC	2	6	503022	503027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986853
13523	NC_008011	TC	3	6	503034	503039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13524	NC_008011	ATT	2	6	503051	503056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_008011	TTA	2	6	503057	503062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_008011	AT	3	6	503078	503083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_008011	A	6	6	503100	503105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_008011	GT	3	6	503196	503201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_008011	TCT	2	6	503246	503251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_008011	T	7	7	503264	503270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_008011	A	8	8	503379	503386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_008011	AG	3	6	503507	503512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_008011	CAAG	2	8	503528	503535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13534	NC_008011	CAA	2	6	503562	503567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_008011	TAA	2	6	503603	503608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_008011	TGA	2	6	503623	503628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_008011	ACAA	2	8	503644	503651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13538	NC_008011	TCTA	2	8	503676	503683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_008011	CAC	2	6	503735	503740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_008011	CTA	2	6	503789	503794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_008011	AAT	2	6	503806	503811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_008011	ATA	2	6	503849	503854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_008011	CAT	2	6	503920	503925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_008011	CCA	2	6	503939	503944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13545	NC_008011	CAA	2	6	503958	503963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_008011	ATT	2	6	503968	503973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_008011	A	6	6	504034	504039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_008011	TGC	2	6	504085	504090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_008011	ATG	2	6	504142	504147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_008011	TAA	2	6	504182	504187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_008011	CTA	2	6	504188	504193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_008011	TAA	2	6	504225	504230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_008011	GAT	2	6	504242	504247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_008011	ATT	2	6	504282	504287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_008011	CAA	2	6	504345	504350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_008011	CTT	2	6	504352	504357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_008011	AAT	2	6	504367	504372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_008011	GCT	2	6	504419	504424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_008011	GAT	2	6	504586	504591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986854
13560	NC_008011	CTC	2	6	504648	504653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986854
13561	NC_008011	TTG	2	6	504675	504680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986854
13562	NC_008011	ATA	2	6	504708	504713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986854
13563	NC_008011	TA	3	6	504735	504740	50 %	50 %	0 %	0 %	94986854
13564	NC_008011	TGT	2	6	504762	504767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986854
13565	NC_008011	AGCAT	2	10	504808	504817	40 %	20 %	20 %	20 %	94986854
13566	NC_008011	CTT	2	6	504830	504835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986854
13567	NC_008011	GGA	2	6	504838	504843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986854
13568	NC_008011	GCT	2	6	504874	504879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986854
13569	NC_008011	GAA	2	6	504890	504895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986854
13570	NC_008011	GTAA	2	8	504930	504937	50 %	25 %	25 %	0 %	94986854
13571	NC_008011	TTA	2	6	504971	504976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986854
13572	NC_008011	TAT	2	6	505092	505097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986854
13573	NC_008011	ATA	2	6	505123	505128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986854
13574	NC_008011	TTG	2	6	505133	505138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986854
13575	NC_008011	ATA	2	6	505165	505170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986854
13576	NC_008011	TGC	2	6	505203	505208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986854
13577	NC_008011	TCC	2	6	505223	505228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986855
13578	NC_008011	AAT	2	6	505360	505365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986855
13579	NC_008011	CTT	2	6	505404	505409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986855
13580	NC_008011	GTC	2	6	505528	505533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986855
13581	NC_008011	AC	3	6	505563	505568	50 %	0 %	0 %	50 %	94986855
13582	NC_008011	CCA	2	6	505577	505582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986855
13583	NC_008011	ACC	2	6	505621	505626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986855
13584	NC_008011	TAC	2	6	505692	505697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986855
13585	NC_008011	CCA	2	6	505700	505705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986855
13586	NC_008011	TCA	2	6	505733	505738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986855
13587	NC_008011	GAT	2	6	505774	505779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986855
13588	NC_008011	TAG	2	6	505841	505846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986855
13589	NC_008011	CTGC	2	8	505923	505930	0 %	25 %	25 %	50 %	94986855
13590	NC_008011	TAC	2	6	505957	505962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986855
13591	NC_008011	TGC	2	6	505970	505975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986855
13592	NC_008011	ACA	2	6	506003	506008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986855
13593	NC_008011	GTTGCA	2	12	506036	506047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94986855
13594	NC_008011	TAT	2	6	506127	506132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986855
13595	NC_008011	TG	3	6	506149	506154	0 %	50 %	50 %	0 %	94986855
13596	NC_008011	CT	4	8	506164	506171	0 %	50 %	0 %	50 %	94986855
13597	NC_008011	AT	3	6	506176	506181	50 %	50 %	0 %	0 %	94986855
13598	NC_008011	CAC	2	6	506187	506192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986855
13599	NC_008011	AGTG	2	8	506247	506254	25 %	25 %	50 %	0 %	94986855
13600	NC_008011	CAC	2	6	506358	506363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986855
13601	NC_008011	T	6	6	506383	506388	0 %	100 %	0 %	0 %	94986855
13602	NC_008011	TAGC	2	8	506425	506432	25 %	25 %	25 %	25 %	94986856
13603	NC_008011	TTC	2	6	506453	506458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986856
13604	NC_008011	TGC	2	6	506504	506509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986856
13605	NC_008011	ATT	2	6	506522	506527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986856
13606	NC_008011	ACC	2	6	506600	506605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986856
13607	NC_008011	GAT	2	6	506691	506696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986856
13608	NC_008011	AT	3	6	506753	506758	50 %	50 %	0 %	0 %	94986856
13609	NC_008011	GATCA	2	10	506762	506771	40 %	20 %	20 %	20 %	94986856
13610	NC_008011	CATCT	2	10	506792	506801	20 %	40 %	0 %	40 %	94986856
13611	NC_008011	AAT	2	6	506806	506811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986856
13612	NC_008011	TGC	2	6	506939	506944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986856
13613	NC_008011	TCT	2	6	506955	506960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986856
13614	NC_008011	AC	3	6	506994	506999	50 %	0 %	0 %	50 %	94986856
13615	NC_008011	TCA	2	6	507044	507049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986857
13616	NC_008011	CAT	2	6	507087	507092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986857
13617	NC_008011	TATC	2	8	507113	507120	25 %	50 %	0 %	25 %	94986857
13618	NC_008011	TA	3	6	507153	507158	50 %	50 %	0 %	0 %	94986857
13619	NC_008011	ATT	2	6	507213	507218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986857
13620	NC_008011	AAT	2	6	507225	507230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986857
13621	NC_008011	GAG	2	6	507233	507238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986857
13622	NC_008011	CAT	2	6	507269	507274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986857
13623	NC_008011	AAT	2	6	507311	507316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986857
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13625	NC_008011	AAG	2	6	507346	507351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986857
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13740	NC_008011	TAA	2	6	512703	512708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13746	NC_008011	T	6	6	512896	512901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13747	NC_008011	TA	3	6	512941	512946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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