MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008011	GGA	3	9	482131	482139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986834
13002	NC_008011	ATA	2	6	482143	482148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986834
13003	NC_008011	GCA	2	6	482179	482184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986834
13004	NC_008011	CCATAA	2	12	482216	482227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94986834
13005	NC_008011	TCA	2	6	482245	482250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986834
13006	NC_008011	A	7	7	482253	482259	100 %	0 %	0 %	0 %	94986834
13007	NC_008011	CATT	2	8	482261	482268	25 %	50 %	0 %	25 %	94986834
13008	NC_008011	CATCTG	2	12	482357	482368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94986834
13009	NC_008011	TAA	2	6	482369	482374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986834
13010	NC_008011	GAA	2	6	482426	482431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986834
13011	NC_008011	TTA	2	6	482446	482451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986834
13012	NC_008011	ATA	2	6	482497	482502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986834
13013	NC_008011	CAG	2	6	482507	482512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986834
13014	NC_008011	TGA	2	6	482557	482562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986834
13015	NC_008011	TTA	2	6	482585	482590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986834
13016	NC_008011	CT	3	6	482631	482636	0 %	50 %	0 %	50 %	94986834
13017	NC_008011	TTA	2	6	482665	482670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986834
13018	NC_008011	TTG	2	6	482700	482705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986834
13019	NC_008011	AAC	2	6	482760	482765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986834
13020	NC_008011	GAG	2	6	482804	482809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986834
13021	NC_008011	TGC	2	6	482817	482822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986834
13022	NC_008011	TGC	2	6	482835	482840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986834
13023	NC_008011	TCT	2	6	482872	482877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986834
13024	NC_008011	TCC	2	6	482916	482921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986834
13025	NC_008011	TCA	2	6	483103	483108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986834
13026	NC_008011	GAAC	2	8	483157	483164	50 %	0 %	25 %	25 %	94986834
13027	NC_008011	CTT	2	6	483191	483196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986834
13028	NC_008011	AAG	2	6	483246	483251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986834
13029	NC_008011	CAG	2	6	483296	483301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986834
13030	NC_008011	TTC	2	6	483324	483329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986834
13031	NC_008011	CTATT	2	10	483335	483344	20 %	60 %	0 %	20 %	94986834
13032	NC_008011	CTT	2	6	483352	483357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986834
13033	NC_008011	ATA	2	6	483358	483363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986834
13034	NC_008011	TTA	2	6	483373	483378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986834
13035	NC_008011	AAGT	2	8	483419	483426	50 %	25 %	25 %	0 %	94986834
13036	NC_008011	TAA	2	6	483450	483455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986834
13037	NC_008011	CTT	2	6	483488	483493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986834
13038	NC_008011	ATT	2	6	483539	483544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_008011	ATA	2	6	483545	483550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_008011	AAC	2	6	483620	483625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_008011	A	6	6	483626	483631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_008011	ATTT	2	8	483633	483640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_008011	ACA	2	6	483700	483705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986835
13044	NC_008011	TA	3	6	483797	483802	50 %	50 %	0 %	0 %	94986835
13045	NC_008011	CAA	3	9	483809	483817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986835
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13050	NC_008011	AACAT	2	10	483991	484000	60 %	20 %	0 %	20 %	94986835
13051	NC_008011	AAT	2	6	484035	484040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986835
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13053	NC_008011	TCA	2	6	484093	484098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986835
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13055	NC_008011	AGA	2	6	484245	484250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986835
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13057	NC_008011	TA	3	6	484308	484313	50 %	50 %	0 %	0 %	94986835
13058	NC_008011	AC	3	6	484415	484420	50 %	0 %	0 %	50 %	94986835
13059	NC_008011	CT	3	6	484443	484448	0 %	50 %	0 %	50 %	94986835
13060	NC_008011	CGA	2	6	484507	484512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986835
13061	NC_008011	ATT	2	6	484527	484532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986835
13062	NC_008011	CAG	2	6	484556	484561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_008011	ATTA	2	8	484604	484611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_008011	TGT	2	6	484752	484757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986836
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13086	NC_008011	ATAAA	2	10	485738	485747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13088	NC_008011	TTAT	2	8	485830	485837	25 %	75 %	0 %	0 %	94986837
13089	NC_008011	AGG	2	6	485840	485845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986837
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13094	NC_008011	AG	3	6	486039	486044	50 %	0 %	50 %	0 %	94986837
13095	NC_008011	GAGC	2	8	486063	486070	25 %	0 %	50 %	25 %	94986837
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13103	NC_008011	A	7	7	486337	486343	100 %	0 %	0 %	0 %	94986837
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13110	NC_008011	AGTGTG	2	12	486648	486659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	94986837
13111	NC_008011	TGG	2	6	486686	486691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986838
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13118	NC_008011	ATT	3	9	486818	486826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986838
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13124	NC_008011	TTA	2	6	486984	486989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986838
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13162	NC_008011	CATG	2	8	488760	488767	25 %	25 %	25 %	25 %	94986839
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13230	NC_008011	GTA	2	6	491523	491528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986843
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13243	NC_008011	CTT	2	6	491918	491923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986844
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13245	NC_008011	TGG	2	6	491989	491994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986844
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13248	NC_008011	TAT	2	6	492181	492186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986845
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13250	NC_008011	CTT	2	6	492312	492317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986845
13251	NC_008011	TGA	2	6	492320	492325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986845
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13496	NC_008011	TAT	2	6	502108	502113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986853
13497	NC_008011	TAA	2	6	502115	502120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986853
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13499	NC_008011	AC	3	6	502177	502182	50 %	0 %	0 %	50 %	94986853
13500	NC_008011	TTA	2	6	502207	502212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986853

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