MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008011	A	7	7	425836	425842	100 %	0 %	0 %	0 %	94986782
11502	NC_008011	ACA	2	6	425863	425868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986782
11503	NC_008011	AAG	2	6	425916	425921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986782
11504	NC_008011	CAATAG	2	12	425969	425980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94986782
11505	NC_008011	TATG	2	8	426027	426034	25 %	50 %	25 %	0 %	94986782
11506	NC_008011	TAA	2	6	426146	426151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986782
11507	NC_008011	A	6	6	426159	426164	100 %	0 %	0 %	0 %	94986782
11508	NC_008011	TAG	2	6	426175	426180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_008011	AGTT	2	8	426205	426212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_008011	ATT	2	6	426223	426228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986783
11511	NC_008011	TCA	2	6	426252	426257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986783
11512	NC_008011	ATA	2	6	426260	426265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11513	NC_008011	TCA	2	6	426300	426305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986783
11514	NC_008011	TAAA	2	8	426353	426360	75 %	25 %	0 %	0 %	94986783
11515	NC_008011	AAT	2	6	426404	426409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11516	NC_008011	T	6	6	426470	426475	0 %	100 %	0 %	0 %	94986783
11517	NC_008011	A	6	6	426485	426490	100 %	0 %	0 %	0 %	94986783
11518	NC_008011	AGG	2	6	426527	426532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986783
11519	NC_008011	A	8	8	426537	426544	100 %	0 %	0 %	0 %	94986783
11520	NC_008011	AGC	2	6	426554	426559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986783
11521	NC_008011	TAT	2	6	426589	426594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986783
11522	NC_008011	TTG	2	6	426595	426600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986783
11523	NC_008011	TAA	2	6	426653	426658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11524	NC_008011	A	7	7	426684	426690	100 %	0 %	0 %	0 %	94986783
11525	NC_008011	TGT	2	6	426704	426709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986783
11526	NC_008011	A	6	6	426764	426769	100 %	0 %	0 %	0 %	94986783
11527	NC_008011	ACA	2	6	426771	426776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986783
11528	NC_008011	T	8	8	426785	426792	0 %	100 %	0 %	0 %	94986783
11529	NC_008011	TC	3	6	426798	426803	0 %	50 %	0 %	50 %	94986783
11530	NC_008011	AAG	2	6	426832	426837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986783
11531	NC_008011	GTA	2	6	426847	426852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986783
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11533	NC_008011	A	6	6	426932	426937	100 %	0 %	0 %	0 %	94986783
11534	NC_008011	TAA	2	6	427009	427014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11535	NC_008011	AAT	2	6	427055	427060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11536	NC_008011	AGC	2	6	427091	427096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986783
11537	NC_008011	TGC	2	6	427100	427105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986783
11538	NC_008011	CAT	2	6	427123	427128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986783
11539	NC_008011	AAT	2	6	427133	427138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11540	NC_008011	ATT	2	6	427172	427177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986783
11541	NC_008011	TAA	2	6	427190	427195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11542	NC_008011	AT	3	6	427300	427305	50 %	50 %	0 %	0 %	94986783
11543	NC_008011	TAA	2	6	427322	427327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986783
11544	NC_008011	TTC	2	6	427341	427346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986783
11545	NC_008011	TA	3	6	427361	427366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_008011	AAC	2	6	427377	427382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_008011	A	6	6	427391	427396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_008011	ATA	2	6	427412	427417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_008011	CATATT	2	12	427418	427429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11550	NC_008011	T	6	6	427428	427433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_008011	AT	3	6	427456	427461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_008011	TA	3	6	427478	427483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_008011	ATA	2	6	427500	427505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_008011	T	6	6	427512	427517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_008011	TAA	2	6	427546	427551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_008011	AT	3	6	427624	427629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_008011	AATC	2	8	427643	427650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11558	NC_008011	ATT	2	6	427657	427662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_008011	AAT	2	6	427663	427668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_008011	TTTCGT	2	12	427816	427827	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	94986784
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11562	NC_008011	A	6	6	427959	427964	100 %	0 %	0 %	0 %	94986784
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11566	NC_008011	A	7	7	428019	428025	100 %	0 %	0 %	0 %	94986784
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11576	NC_008011	AACA	2	8	428444	428451	75 %	0 %	0 %	25 %	94986784
11577	NC_008011	CA	3	6	428458	428463	50 %	0 %	0 %	50 %	94986784
11578	NC_008011	TTGT	2	8	428501	428508	0 %	75 %	25 %	0 %	94986784
11579	NC_008011	ATT	2	6	428509	428514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986784
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11582	NC_008011	GTAG	2	8	428533	428540	25 %	25 %	50 %	0 %	94986784
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11584	NC_008011	TAC	2	6	428722	428727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_008011	TTCT	2	8	428774	428781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11588	NC_008011	ATT	2	6	428811	428816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_008011	TTTA	2	8	428842	428849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_008011	TAT	2	6	428863	428868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_008011	TA	3	6	428874	428879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_008011	ATTA	2	8	428919	428926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_008011	CAT	2	6	428934	428939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11597	NC_008011	TAT	2	6	429231	429236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986785
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11599	NC_008011	GTG	2	6	429395	429400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986785
11600	NC_008011	GTA	2	6	429476	429481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986785
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11604	NC_008011	TGC	2	6	429549	429554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986785
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11607	NC_008011	A	7	7	429586	429592	100 %	0 %	0 %	0 %	94986785
11608	NC_008011	AAG	2	6	429620	429625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986785
11609	NC_008011	TAC	2	6	429690	429695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_008011	TAT	2	6	429755	429760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_008011	TTAAT	2	10	429773	429782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_008011	AT	3	6	429781	429786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_008011	GAA	2	6	429821	429826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986786
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11615	NC_008011	ATT	2	6	429878	429883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986786
11616	NC_008011	TATC	2	8	429933	429940	25 %	50 %	0 %	25 %	94986786
11617	NC_008011	CTT	2	6	430004	430009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986786
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11625	NC_008011	T	7	7	430174	430180	0 %	100 %	0 %	0 %	94986786
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