MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_008011	CATA	2	8	406230	406237	50 %	25 %	0 %	25 %	94986768
11003	NC_008011	TA	3	6	406251	406256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_008011	TCT	2	6	406277	406282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_008011	TAA	2	6	406294	406299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_008011	GTA	2	6	406331	406336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_008011	GAA	2	6	406360	406365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_008011	GCT	2	6	406403	406408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986769
11009	NC_008011	TTCC	2	8	406409	406416	0 %	50 %	0 %	50 %	94986769
11010	NC_008011	AT	3	6	406514	406519	50 %	50 %	0 %	0 %	94986769
11011	NC_008011	TAA	2	6	406555	406560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986769
11012	NC_008011	TTTGG	2	10	406563	406572	0 %	60 %	40 %	0 %	94986769
11013	NC_008011	AAT	2	6	406588	406593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986769
11014	NC_008011	TGT	2	6	406603	406608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986769
11015	NC_008011	CTA	2	6	406740	406745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
11016	NC_008011	CTT	3	9	406764	406772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986769
11017	NC_008011	TA	3	6	406824	406829	50 %	50 %	0 %	0 %	94986769
11018	NC_008011	ATT	2	6	406927	406932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986769
11019	NC_008011	CTGA	2	8	406959	406966	25 %	25 %	25 %	25 %	94986769
11020	NC_008011	A	7	7	407000	407006	100 %	0 %	0 %	0 %	94986769
11021	NC_008011	TCA	2	6	407087	407092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
11022	NC_008011	TAC	2	6	407151	407156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
11023	NC_008011	TCA	2	6	407171	407176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
11024	NC_008011	AAC	2	6	407179	407184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986769
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11026	NC_008011	CAT	2	6	407361	407366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
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11028	NC_008011	ATAC	2	8	407441	407448	50 %	25 %	0 %	25 %	94986769
11029	NC_008011	AAT	2	6	407545	407550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986769
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11033	NC_008011	GCTT	2	8	407624	407631	0 %	50 %	25 %	25 %	94986769
11034	NC_008011	TCA	2	6	407708	407713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
11035	NC_008011	ACT	2	6	407755	407760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986769
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11040	NC_008011	A	7	7	407836	407842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_008011	TCTTT	2	10	407864	407873	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11042	NC_008011	A	6	6	407881	407886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_008011	CTT	2	6	407891	407896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_008011	A	6	6	407909	407914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_008011	TCT	2	6	407922	407927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_008011	TATAA	2	10	407944	407953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_008011	TA	3	6	407997	408002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_008011	ATTA	2	8	408012	408019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_008011	A	6	6	408036	408041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11057	NC_008011	A	7	7	408243	408249	100 %	0 %	0 %	0 %	94986770
11058	NC_008011	TGG	2	6	408271	408276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986770
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11062	NC_008011	CAT	2	6	408411	408416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986770
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11075	NC_008011	A	7	7	408880	408886	100 %	0 %	0 %	0 %	94986770
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11095	NC_008011	AAG	2	6	409440	409445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11097	NC_008011	TAA	2	6	409491	409496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_008011	TTA	2	6	409520	409525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_008011	TGT	2	6	409594	409599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11101	NC_008011	A	6	6	409661	409666	100 %	0 %	0 %	0 %	94986771
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11103	NC_008011	ACTG	2	8	409763	409770	25 %	25 %	25 %	25 %	94986771
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11109	NC_008011	CGT	2	6	409929	409934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986771
11110	NC_008011	CAG	5	15	409960	409974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986771
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11114	NC_008011	A	6	6	410154	410159	100 %	0 %	0 %	0 %	94986771
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11116	NC_008011	A	6	6	410242	410247	100 %	0 %	0 %	0 %	94986771
11117	NC_008011	TAC	2	6	410248	410253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986771
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11122	NC_008011	AT	3	6	410309	410314	50 %	50 %	0 %	0 %	94986771
11123	NC_008011	TA	3	6	410393	410398	50 %	50 %	0 %	0 %	94986771
11124	NC_008011	ACAA	2	8	410438	410445	75 %	0 %	0 %	25 %	94986771
11125	NC_008011	AAT	2	6	410454	410459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986771
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11500	NC_008011	ATA	2	6	425821	425826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986782

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