MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_008011	ATA	2	6	351412	351417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986725
9503	NC_008011	T	6	6	351469	351474	0 %	100 %	0 %	0 %	94986725
9504	NC_008011	TTA	2	6	351568	351573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986725
9505	NC_008011	AGT	2	6	351588	351593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986725
9506	NC_008011	GAAC	2	8	351617	351624	50 %	0 %	25 %	25 %	94986725
9507	NC_008011	CTG	2	6	351720	351725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986725
9508	NC_008011	CCA	2	6	351729	351734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986725
9509	NC_008011	GAA	2	6	351776	351781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986725
9510	NC_008011	A	6	6	351850	351855	100 %	0 %	0 %	0 %	94986725
9511	NC_008011	TTC	2	6	351867	351872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986725
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9513	NC_008011	CAAA	2	8	351935	351942	75 %	0 %	0 %	25 %	94986725
9514	NC_008011	TAA	2	6	351972	351977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986725
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9517	NC_008011	TAA	2	6	352163	352168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986725
9518	NC_008011	CAT	2	6	352175	352180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986725
9519	NC_008011	CAA	2	6	352232	352237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986725
9520	NC_008011	ACT	2	6	352301	352306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9523	NC_008011	TCA	2	6	352500	352505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986726
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9526	NC_008011	A	8	8	352635	352642	100 %	0 %	0 %	0 %	94986726
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9534	NC_008011	ATCC	2	8	352948	352955	25 %	25 %	0 %	50 %	94986727
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9539	NC_008011	ACTT	2	8	353085	353092	25 %	50 %	0 %	25 %	94986727
9540	NC_008011	TA	3	6	353123	353128	50 %	50 %	0 %	0 %	94986727
9541	NC_008011	ATT	2	6	353148	353153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986727
9542	NC_008011	GCA	2	6	353173	353178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986727
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9545	NC_008011	TCCT	2	8	353342	353349	0 %	50 %	0 %	50 %	94986727
9546	NC_008011	ATCT	2	8	353376	353383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9547	NC_008011	TA	3	6	353393	353398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9551	NC_008011	TAA	5	15	353492	353506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_008011	ACT	2	6	353515	353520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986728
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9555	NC_008011	ATT	2	6	353633	353638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986728
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9597	NC_008011	ATAC	2	8	355187	355194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9616	NC_008011	ACCC	2	8	355982	355989	25 %	0 %	0 %	75 %	94986729
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