MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008011	AGC	2	6	239253	239258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986633
6502	NC_008011	ATT	2	6	239278	239283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986633
6503	NC_008011	AACCT	2	10	239309	239318	40 %	20 %	0 %	40 %	94986633
6504	NC_008011	GAA	2	6	239419	239424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986633
6505	NC_008011	TTA	2	6	239425	239430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986633
6506	NC_008011	TTC	2	6	239434	239439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986633
6507	NC_008011	TTA	2	6	239456	239461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986633
6508	NC_008011	GAAA	2	8	239516	239523	75 %	0 %	25 %	0 %	94986633
6509	NC_008011	A	6	6	239521	239526	100 %	0 %	0 %	0 %	94986633
6510	NC_008011	ATA	2	6	239539	239544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986633
6511	NC_008011	GA	3	6	239557	239562	50 %	0 %	50 %	0 %	94986633
6512	NC_008011	TA	4	8	239585	239592	50 %	50 %	0 %	0 %	94986633
6513	NC_008011	TC	3	6	239595	239600	0 %	50 %	0 %	50 %	94986633
6514	NC_008011	T	6	6	239611	239616	0 %	100 %	0 %	0 %	94986633
6515	NC_008011	T	6	6	239623	239628	0 %	100 %	0 %	0 %	94986633
6516	NC_008011	TGA	2	6	239649	239654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986633
6517	NC_008011	ATC	2	6	239702	239707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986633
6518	NC_008011	ATG	2	6	239714	239719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986633
6519	NC_008011	ATA	2	6	239790	239795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_008011	ACTT	2	8	239867	239874	25 %	50 %	0 %	25 %	94986634
6521	NC_008011	ACATT	2	10	239876	239885	40 %	40 %	0 %	20 %	94986634
6522	NC_008011	TTAT	2	8	239897	239904	25 %	75 %	0 %	0 %	94986634
6523	NC_008011	TTA	2	6	239914	239919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986634
6524	NC_008011	CTTATT	2	12	239965	239976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94986634
6525	NC_008011	TTA	2	6	240019	240024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986634
6526	NC_008011	TC	3	6	240040	240045	0 %	50 %	0 %	50 %	94986634
6527	NC_008011	ATT	3	9	240055	240063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986634
6528	NC_008011	ATG	2	6	240071	240076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986634
6529	NC_008011	GAA	2	6	240120	240125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986634
6530	NC_008011	AAAG	2	8	240126	240133	75 %	0 %	25 %	0 %	94986634
6531	NC_008011	ATA	2	6	240155	240160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986634
6532	NC_008011	AG	3	6	240220	240225	50 %	0 %	50 %	0 %	94986634
6533	NC_008011	ATG	2	6	240241	240246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986634
6534	NC_008011	AAG	2	6	240248	240253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986634
6535	NC_008011	ATTCT	2	10	240266	240275	20 %	60 %	0 %	20 %	94986634
6536	NC_008011	ACT	2	6	240285	240290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986634
6537	NC_008011	T	6	6	240299	240304	0 %	100 %	0 %	0 %	94986634
6538	NC_008011	ATG	2	6	240323	240328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986634
6539	NC_008011	TTA	2	6	240335	240340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986634
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6541	NC_008011	TGC	2	6	240357	240362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986634
6542	NC_008011	AAGT	2	8	240443	240450	50 %	25 %	25 %	0 %	94986634
6543	NC_008011	TTG	2	6	240464	240469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986634
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6546	NC_008011	AG	3	6	240546	240551	50 %	0 %	50 %	0 %	94986634
6547	NC_008011	AGAA	2	8	240664	240671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_008011	GTTAG	2	10	240680	240689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_008011	TAA	2	6	240736	240741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_008011	ATC	2	6	240855	240860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986635
6551	NC_008011	ATT	2	6	240892	240897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986635
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6553	NC_008011	AAG	2	6	240941	240946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986635
6554	NC_008011	TCT	2	6	240976	240981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986635
6555	NC_008011	T	6	6	240983	240988	0 %	100 %	0 %	0 %	94986635
6556	NC_008011	AGA	2	6	241005	241010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986635
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6558	NC_008011	GTG	2	6	241043	241048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986635
6559	NC_008011	TCA	2	6	241063	241068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986635
6560	NC_008011	ATT	2	6	241098	241103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986635
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6563	NC_008011	CGT	2	6	241210	241215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986635
6564	NC_008011	AGA	2	6	241248	241253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986635
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6566	NC_008011	AGA	2	6	241374	241379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986635
6567	NC_008011	CAG	3	9	241433	241441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986635
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6571	NC_008011	TTG	2	6	241506	241511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_008011	GCA	2	6	241612	241617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986636
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6579	NC_008011	AT	3	6	242001	242006	50 %	50 %	0 %	0 %	94986636
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6587	NC_008011	GAAA	2	8	242415	242422	75 %	0 %	25 %	0 %	94986636
6588	NC_008011	A	8	8	242420	242427	100 %	0 %	0 %	0 %	94986636
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6592	NC_008011	TAC	2	6	242756	242761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986636
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6595	NC_008011	AT	3	6	243010	243015	50 %	50 %	0 %	0 %	94986637
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6599	NC_008011	GA	3	6	243151	243156	50 %	0 %	50 %	0 %	94986637
6600	NC_008011	TGTC	2	8	243215	243222	0 %	50 %	25 %	25 %	94986637
6601	NC_008011	TGA	2	6	243282	243287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986637
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6604	NC_008011	TAT	2	6	243429	243434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986637
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6608	NC_008011	TGG	2	6	243588	243593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986637
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6615	NC_008011	ATT	3	9	243807	243815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_008011	ATGA	2	8	243833	243840	50 %	25 %	25 %	0 %	94986638
6617	NC_008011	TAT	2	6	243858	243863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986638
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