MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008011	ATG	2	6	162005	162010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986576
4502	NC_008011	CAA	2	6	162011	162016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986576
4503	NC_008011	CAG	2	6	162154	162159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986576
4504	NC_008011	A	7	7	162197	162203	100 %	0 %	0 %	0 %	94986576
4505	NC_008011	TTAGT	2	10	162230	162239	20 %	60 %	20 %	0 %	94986576
4506	NC_008011	AGC	2	6	162345	162350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986576
4507	NC_008011	TCC	2	6	162450	162455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986576
4508	NC_008011	CAT	2	6	162461	162466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986576
4509	NC_008011	CTA	2	6	162479	162484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986576
4510	NC_008011	TGC	2	6	162528	162533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986576
4511	NC_008011	ATT	2	6	162565	162570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986576
4512	NC_008011	T	6	6	162569	162574	0 %	100 %	0 %	0 %	94986576
4513	NC_008011	ATT	2	6	162642	162647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986576
4514	NC_008011	CAA	2	6	162653	162658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986576
4515	NC_008011	GA	3	6	162670	162675	50 %	0 %	50 %	0 %	94986576
4516	NC_008011	TGTTC	2	10	162712	162721	0 %	60 %	20 %	20 %	94986576
4517	NC_008011	A	6	6	162759	162764	100 %	0 %	0 %	0 %	94986576
4518	NC_008011	T	6	6	162832	162837	0 %	100 %	0 %	0 %	94986576
4519	NC_008011	TAT	2	6	162854	162859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986576
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4521	NC_008011	AGA	2	6	162975	162980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986577
4522	NC_008011	TAC	2	6	162981	162986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986577
4523	NC_008011	TA	3	6	162989	162994	50 %	50 %	0 %	0 %	94986577
4524	NC_008011	TTA	2	6	163012	163017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986577
4525	NC_008011	TTA	2	6	163025	163030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986577
4526	NC_008011	TTCTT	2	10	163086	163095	0 %	80 %	0 %	20 %	94986577
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4537	NC_008011	TTA	2	6	163427	163432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986577
4538	NC_008011	TTG	2	6	163448	163453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986577
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4541	NC_008011	CA	3	6	163594	163599	50 %	0 %	0 %	50 %	94986577
4542	NC_008011	AGTT	2	8	163632	163639	25 %	50 %	25 %	0 %	94986577
4543	NC_008011	GTTAT	2	10	163651	163660	20 %	60 %	20 %	0 %	94986577
4544	NC_008011	TTA	2	6	163760	163765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986577
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4547	NC_008011	A	6	6	163948	163953	100 %	0 %	0 %	0 %	94986577
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4551	NC_008011	A	8	8	164043	164050	100 %	0 %	0 %	0 %	94986577
4552	NC_008011	TGG	3	9	164100	164108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986577
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4554	NC_008011	CTA	2	6	164156	164161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986577
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4557	NC_008011	GAA	2	6	164219	164224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986577
4558	NC_008011	A	6	6	164228	164233	100 %	0 %	0 %	0 %	94986577
4559	NC_008011	TAC	2	6	164286	164291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986577
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4561	NC_008011	AAT	2	6	164336	164341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986577
4562	NC_008011	AT	3	6	164340	164345	50 %	50 %	0 %	0 %	94986577
4563	NC_008011	AAT	2	6	164358	164363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008011	GAT	2	6	164380	164385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_008011	AT	3	6	164390	164395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008011	ATT	3	9	164456	164464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008011	TTTA	2	8	164493	164500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4570	NC_008011	TGCTAT	2	12	164587	164598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94986578
4571	NC_008011	CAG	2	6	164600	164605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986578
4572	NC_008011	AT	3	6	164616	164621	50 %	50 %	0 %	0 %	94986578
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4581	NC_008011	ATATT	2	10	164916	164925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_008011	GTTC	2	8	165407	165414	0 %	50 %	25 %	25 %	94986579
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4609	NC_008011	ATCA	2	8	165792	165799	50 %	25 %	0 %	25 %	94986579
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