MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_007576	CAC	2	6	1576068	1576073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33002	NC_007576	TTC	2	6	1576143	1576148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33003	NC_007576	CAGAC	2	10	1576376	1576385	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33004	NC_007576	GCC	2	6	1576387	1576392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33005	NC_007576	TTC	2	6	1576406	1576411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33006	NC_007576	AT	3	6	1576413	1576418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_007576	CTT	2	6	1576491	1576496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33008	NC_007576	GCT	2	6	1576597	1576602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33009	NC_007576	TTC	2	6	1576670	1576675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33010	NC_007576	CAA	2	6	1576678	1576683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33011	NC_007576	CTT	2	6	1576706	1576711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33012	NC_007576	CTG	2	6	1576765	1576770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33013	NC_007576	AACT	2	8	1576869	1576876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33014	NC_007576	CACT	2	8	1577028	1577035	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33015	NC_007576	ATCA	2	8	1577045	1577052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33016	NC_007576	CGC	2	6	1577108	1577113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33017	NC_007576	TTGTT	2	10	1577165	1577174	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33018	NC_007576	ATTT	2	8	1577180	1577187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33019	NC_007576	TGT	2	6	1577213	1577218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33020	NC_007576	TTAA	2	8	1577297	1577304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33021	NC_007576	AAC	2	6	1577317	1577322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33022	NC_007576	TTA	2	6	1577338	1577343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33023	NC_007576	T	6	6	1577347	1577352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33024	NC_007576	AATA	2	8	1577354	1577361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33025	NC_007576	ACA	2	6	1577415	1577420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33026	NC_007576	ACT	2	6	1577424	1577429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33027	NC_007576	CTAT	2	8	1577437	1577444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33028	NC_007576	TAT	2	6	1577459	1577464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33029	NC_007576	AAT	2	6	1577495	1577500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33030	NC_007576	A	8	8	1577583	1577590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33031	NC_007576	T	7	7	1577610	1577616	0 %	100 %	0 %	0 %	81429206
33032	NC_007576	TTC	2	6	1577621	1577626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429206
33033	NC_007576	CTTG	2	8	1577632	1577639	0 %	50 %	25 %	25 %	81429206
33034	NC_007576	TTG	2	6	1577650	1577655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429206
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33038	NC_007576	TCA	2	6	1577793	1577798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429206
33039	NC_007576	ATTCA	2	10	1577858	1577867	40 %	40 %	0 %	20 %	81429206
33040	NC_007576	CATG	2	8	1577893	1577900	25 %	25 %	25 %	25 %	81429206
33041	NC_007576	TTC	2	6	1577940	1577945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429206
33042	NC_007576	GTTG	2	8	1577988	1577995	0 %	50 %	50 %	0 %	81429206
33043	NC_007576	TTC	2	6	1578017	1578022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429206
33044	NC_007576	AAG	2	6	1578024	1578029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81429206
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33050	NC_007576	CAG	2	6	1578568	1578573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429206
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33052	NC_007576	CTTTAC	2	12	1578898	1578909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	81429206
33053	NC_007576	CAT	2	6	1578920	1578925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429206
33054	NC_007576	CTT	2	6	1578943	1578948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429206
33055	NC_007576	GTC	2	6	1578965	1578970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429206
33056	NC_007576	TTC	2	6	1578989	1578994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429206
33057	NC_007576	GCT	3	9	1579002	1579010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429206
33058	NC_007576	T	6	6	1579072	1579077	0 %	100 %	0 %	0 %	81429206
33059	NC_007576	TCAT	2	8	1579098	1579105	25 %	50 %	0 %	25 %	81429206
33060	NC_007576	TCC	2	6	1579141	1579146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33061	NC_007576	TTG	2	6	1579168	1579173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33062	NC_007576	CAA	2	6	1579234	1579239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81429207
33063	NC_007576	AGC	2	6	1579304	1579309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429207
33064	NC_007576	AGC	2	6	1579334	1579339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429207
33065	NC_007576	TTG	2	6	1579340	1579345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429207
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33068	NC_007576	CAAT	2	8	1579444	1579451	50 %	25 %	0 %	25 %	81429207
33069	NC_007576	AGC	2	6	1579505	1579510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429207
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33071	NC_007576	T	6	6	1579784	1579789	0 %	100 %	0 %	0 %	81429207
33072	NC_007576	CGTC	2	8	1579795	1579802	0 %	25 %	25 %	50 %	81429207
33073	NC_007576	TAA	2	6	1579838	1579843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429207
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33076	NC_007576	CCA	2	6	1579968	1579973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81429207
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33080	NC_007576	GAC	2	6	1580075	1580080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429207
33081	NC_007576	CGA	2	6	1580146	1580151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429207
33082	NC_007576	A	6	6	1580247	1580252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33091	NC_007576	TCAA	2	8	1580585	1580592	50 %	25 %	0 %	25 %	81429208
33092	NC_007576	ATC	2	6	1580596	1580601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429208
33093	NC_007576	ACC	2	6	1580629	1580634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81429208
33094	NC_007576	CTG	2	6	1580682	1580687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429208
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33099	NC_007576	TGA	2	6	1581037	1581042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81429208
33100	NC_007576	AAC	2	6	1581079	1581084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81429208
33101	NC_007576	TCT	2	6	1581122	1581127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429208
33102	NC_007576	AAT	2	6	1581144	1581149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429208
33103	NC_007576	TTTA	2	8	1581168	1581175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_007576	TCA	2	6	1581248	1581253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429209
33105	NC_007576	TCA	2	6	1581264	1581269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429209
33106	NC_007576	CAG	2	6	1581286	1581291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429209
33107	NC_007576	TGT	2	6	1581308	1581313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429209
33108	NC_007576	T	6	6	1581352	1581357	0 %	100 %	0 %	0 %	81429209
33109	NC_007576	CTT	2	6	1581361	1581366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429209
33110	NC_007576	T	6	6	1581380	1581385	0 %	100 %	0 %	0 %	81429209
33111	NC_007576	CTT	2	6	1581388	1581393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429209
33112	NC_007576	GCT	2	6	1581402	1581407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429209
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33117	NC_007576	TTG	2	6	1581560	1581565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429209
33118	NC_007576	TCG	2	6	1581573	1581578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429209
33119	NC_007576	CGA	2	6	1581585	1581590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429209
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33121	NC_007576	AGC	2	6	1581647	1581652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429209
33122	NC_007576	CGA	2	6	1581655	1581660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429209
33123	NC_007576	CTT	2	6	1581670	1581675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429209
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33133	NC_007576	TCTT	2	8	1582092	1582099	0 %	75 %	0 %	25 %	81429209
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33342	NC_007576	TGTTT	2	10	1592744	1592753	0 %	80 %	20 %	0 %	81429217
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33347	NC_007576	AAAT	2	8	1592921	1592928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33348	NC_007576	GAA	2	6	1592997	1593002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33351	NC_007576	A	6	6	1593160	1593165	100 %	0 %	0 %	0 %	81429218
33352	NC_007576	TGC	2	6	1593227	1593232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429218
33353	NC_007576	GTT	3	9	1593261	1593269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429218
33354	NC_007576	CTG	2	6	1593274	1593279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429218
33355	NC_007576	CAC	2	6	1593283	1593288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81429218
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