MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

< Previous12...3233343536373839404142...7980Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_007576	GGTGCA	2	12	856853	856864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	81428478
18003	NC_007576	ATT	2	6	856883	856888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428478
18004	NC_007576	TGGC	2	8	856947	856954	0 %	25 %	50 %	25 %	81428478
18005	NC_007576	GTC	2	6	856971	856976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428478
18006	NC_007576	GAA	2	6	856982	856987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428478
18007	NC_007576	TTG	2	6	857259	857264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428478
18008	NC_007576	A	6	6	857306	857311	100 %	0 %	0 %	0 %	81428478
18009	NC_007576	TTA	2	6	857375	857380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428478
18010	NC_007576	AGC	2	6	857490	857495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428480
18011	NC_007576	A	6	6	857567	857572	100 %	0 %	0 %	0 %	81428480
18012	NC_007576	GAT	2	6	857590	857595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428480
18013	NC_007576	TCAA	2	8	857612	857619	50 %	25 %	0 %	25 %	81428480
18014	NC_007576	ACAA	2	8	857625	857632	75 %	0 %	0 %	25 %	81428480
18015	NC_007576	CGG	2	6	857711	857716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428480
18016	NC_007576	ACCA	2	8	857765	857772	50 %	0 %	0 %	50 %	81428480
18017	NC_007576	AGA	2	6	857778	857783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428480
18018	NC_007576	ATT	2	6	857827	857832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428480
18019	NC_007576	CTG	2	6	857846	857851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428480
18020	NC_007576	CAG	2	6	857886	857891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428480
18021	NC_007576	CAA	2	6	857924	857929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428480
18022	NC_007576	TTG	2	6	857987	857992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428480
18023	NC_007576	AAT	2	6	858028	858033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428480
18024	NC_007576	CAAT	2	8	858039	858046	50 %	25 %	0 %	25 %	81428480
18025	NC_007576	TTG	2	6	858047	858052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428480
18026	NC_007576	AAG	2	6	858137	858142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428480
18027	NC_007576	GAA	2	6	858154	858159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428480
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18029	NC_007576	GAA	2	6	858388	858393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428480
18030	NC_007576	TTA	2	6	858505	858510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428480
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18032	NC_007576	TTGAAA	2	12	858596	858607	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	81428480
18033	NC_007576	ATT	2	6	858737	858742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428480
18034	NC_007576	AGC	2	6	858783	858788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428480
18035	NC_007576	GTC	2	6	858799	858804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428480
18036	NC_007576	TGG	2	6	858808	858813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428480
18037	NC_007576	TGT	2	6	858827	858832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428480
18038	NC_007576	TCT	2	6	858840	858845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428480
18039	NC_007576	TTA	4	12	859089	859100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428480
18040	NC_007576	TGG	2	6	859113	859118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428480
18041	NC_007576	AGT	2	6	859156	859161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428480
18042	NC_007576	TGC	2	6	859179	859184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428480
18043	NC_007576	GTG	2	6	859202	859207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428480
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18046	NC_007576	TGG	2	6	859245	859250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428480
18047	NC_007576	CGG	2	6	859257	859262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428480
18048	NC_007576	AACA	2	8	859274	859281	75 %	0 %	0 %	25 %	81428480
18049	NC_007576	TTA	2	6	859392	859397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428481
18050	NC_007576	AATT	2	8	859449	859456	50 %	50 %	0 %	0 %	81428481
18051	NC_007576	A	7	7	859457	859463	100 %	0 %	0 %	0 %	81428481
18052	NC_007576	GAT	2	6	859636	859641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428481
18053	NC_007576	ATT	2	6	859680	859685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428481
18054	NC_007576	GCA	2	6	859703	859708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428481
18055	NC_007576	GAT	2	6	859786	859791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428481
18056	NC_007576	GGC	2	6	859828	859833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428481
18057	NC_007576	ATT	2	6	859928	859933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428481
18058	NC_007576	G	6	6	859934	859939	0 %	0 %	100 %	0 %	81428481
18059	NC_007576	A	7	7	860027	860033	100 %	0 %	0 %	0 %	81428481
18060	NC_007576	TAAAT	2	10	860043	860052	60 %	40 %	0 %	0 %	81428481
18061	NC_007576	ATTA	2	8	860077	860084	50 %	50 %	0 %	0 %	81428482
18062	NC_007576	GCT	2	6	860099	860104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428482
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18065	NC_007576	ATC	2	6	860280	860285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428482
18066	NC_007576	ACG	2	6	860291	860296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428482
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18070	NC_007576	AAG	2	6	860490	860495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428482
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18072	NC_007576	TAAT	2	8	860623	860630	50 %	50 %	0 %	0 %	81428482
18073	NC_007576	TCA	2	6	860644	860649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428482
18074	NC_007576	T	7	7	860665	860671	0 %	100 %	0 %	0 %	81428482
18075	NC_007576	TTC	2	6	860738	860743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428482
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18077	NC_007576	AAT	2	6	860804	860809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428482
18078	NC_007576	GCT	2	6	860841	860846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428482
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18081	NC_007576	GCG	2	6	860976	860981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_007576	A	7	7	860988	860994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_007576	TAAT	2	8	860999	861006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_007576	T	6	6	861076	861081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_007576	GAGGG	2	10	861113	861122	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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18087	NC_007576	TCG	2	6	861177	861182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428483
18088	NC_007576	TACAA	2	10	861210	861219	60 %	20 %	0 %	20 %	81428483
18089	NC_007576	AGC	2	6	861279	861284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428483
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18091	NC_007576	TAAC	2	8	861428	861435	50 %	25 %	0 %	25 %	81428484
18092	NC_007576	TCT	2	6	861463	861468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428484
18093	NC_007576	GAA	2	6	861472	861477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428484
18094	NC_007576	TAT	2	6	861485	861490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428484
18095	NC_007576	AACA	2	8	861560	861567	75 %	0 %	0 %	25 %	81428484
18096	NC_007576	CTTA	2	8	861593	861600	25 %	50 %	0 %	25 %	81428484
18097	NC_007576	TTG	2	6	861635	861640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428484
18098	NC_007576	TCAA	2	8	861743	861750	50 %	25 %	0 %	25 %	81428484
18099	NC_007576	T	7	7	861807	861813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_007576	AATA	2	8	861886	861893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_007576	GAAT	2	8	861934	861941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_007576	AGA	2	6	862080	862085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428485
18103	NC_007576	GCT	2	6	862120	862125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428485
18104	NC_007576	GAA	2	6	862162	862167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428485
18105	NC_007576	ATTG	2	8	862182	862189	25 %	50 %	25 %	0 %	81428485
18106	NC_007576	TGA	2	6	862194	862199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428485
18107	NC_007576	AG	3	6	862254	862259	50 %	0 %	50 %	0 %	81428485
18108	NC_007576	TTA	2	6	862270	862275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428485
18109	NC_007576	CGA	2	6	862316	862321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428485
18110	NC_007576	TCA	2	6	862376	862381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428485
18111	NC_007576	CCAA	2	8	862395	862402	50 %	0 %	0 %	50 %	81428485
18112	NC_007576	AT	3	6	862431	862436	50 %	50 %	0 %	0 %	81428485
18113	NC_007576	ATG	2	6	862454	862459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428485
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18115	NC_007576	TGC	2	6	862521	862526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428485
18116	NC_007576	A	6	6	862531	862536	100 %	0 %	0 %	0 %	81428485
18117	NC_007576	TAT	2	6	862551	862556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428485
18118	NC_007576	CGGC	2	8	862564	862571	0 %	0 %	50 %	50 %	81428485
18119	NC_007576	AAAAG	2	10	862614	862623	80 %	0 %	20 %	0 %	81428485
18120	NC_007576	GAA	2	6	862753	862758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428485
18121	NC_007576	TAA	2	6	862881	862886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428485
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18492	NC_007576	CG	3	6	881281	881286	0 %	0 %	50 %	50 %	81428504
18493	NC_007576	TTG	2	6	881348	881353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428504
18494	NC_007576	AAC	2	6	881460	881465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428504
18495	NC_007576	TTA	2	6	881531	881536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428504
18496	NC_007576	ATT	2	6	881548	881553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428504
18497	NC_007576	TTTA	2	8	881604	881611	25 %	75 %	0 %	0 %	81428504
18498	NC_007576	TTAATT	2	12	881779	881790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428505
18499	NC_007576	AAC	2	6	881811	881816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428505
18500	NC_007576	CAT	2	6	881836	881841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428505

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