MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007576	GGC	2	6	663343	663348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428273
14002	NC_007576	GAA	2	6	663382	663387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428274
14003	NC_007576	CCAA	2	8	663422	663429	50 %	0 %	0 %	50 %	81428274
14004	NC_007576	AAG	2	6	663470	663475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428274
14005	NC_007576	ATCGCG	2	12	663518	663529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81428274
14006	NC_007576	CGG	2	6	663614	663619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428274
14007	NC_007576	CTT	2	6	663648	663653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428274
14008	NC_007576	GGT	2	6	663853	663858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428274
14009	NC_007576	TGT	2	6	663957	663962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428274
14010	NC_007576	TTC	2	6	664066	664071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428274
14011	NC_007576	AT	3	6	664107	664112	50 %	50 %	0 %	0 %	81428274
14012	NC_007576	GGC	2	6	664188	664193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428274
14013	NC_007576	GTCG	2	8	664315	664322	0 %	25 %	50 %	25 %	81428274
14014	NC_007576	GTT	2	6	664381	664386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428274
14015	NC_007576	TGA	2	6	664422	664427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428274
14016	NC_007576	ACT	2	6	664444	664449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428274
14017	NC_007576	GAAG	2	8	664473	664480	50 %	0 %	50 %	0 %	81428274
14018	NC_007576	CAC	2	6	664514	664519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428274
14019	NC_007576	GAA	2	6	664564	664569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428274
14020	NC_007576	CAA	2	6	664582	664587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428274
14021	NC_007576	TG	3	6	664601	664606	0 %	50 %	50 %	0 %	81428274
14022	NC_007576	AAG	2	6	664643	664648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428274
14023	NC_007576	TGAT	2	8	664652	664659	25 %	50 %	25 %	0 %	81428274
14024	NC_007576	TATG	2	8	664697	664704	25 %	50 %	25 %	0 %	81428274
14025	NC_007576	CGC	2	6	664730	664735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428274
14026	NC_007576	A	8	8	664861	664868	100 %	0 %	0 %	0 %	81428275
14027	NC_007576	GATT	2	8	665021	665028	25 %	50 %	25 %	0 %	81428275
14028	NC_007576	TG	3	6	665038	665043	0 %	50 %	50 %	0 %	81428275
14029	NC_007576	TTG	2	6	665053	665058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428275
14030	NC_007576	CTT	2	6	665081	665086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428275
14031	NC_007576	TCG	2	6	665134	665139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428275
14032	NC_007576	GCAA	2	8	665158	665165	50 %	0 %	25 %	25 %	81428275
14033	NC_007576	GTAT	2	8	665209	665216	25 %	50 %	25 %	0 %	81428275
14034	NC_007576	GATTG	2	10	665312	665321	20 %	40 %	40 %	0 %	81428275
14035	NC_007576	CATT	2	8	665333	665340	25 %	50 %	0 %	25 %	81428275
14036	NC_007576	T	6	6	665370	665375	0 %	100 %	0 %	0 %	81428275
14037	NC_007576	AAT	2	6	665382	665387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428275
14038	NC_007576	TTA	2	6	665442	665447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428275
14039	NC_007576	CTA	2	6	665452	665457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428275
14040	NC_007576	CAA	2	6	665490	665495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428275
14041	NC_007576	GTG	2	6	665527	665532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428275
14042	NC_007576	ACA	2	6	665627	665632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428275
14043	NC_007576	GAAATG	2	12	665649	665660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	81428275
14044	NC_007576	AGC	2	6	665711	665716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428275
14045	NC_007576	CAA	2	6	665787	665792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428275
14046	NC_007576	GCG	2	6	665793	665798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428275
14047	NC_007576	ACA	2	6	665887	665892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428276
14048	NC_007576	AGC	2	6	665935	665940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428276
14049	NC_007576	CGG	2	6	665960	665965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428276
14050	NC_007576	CAC	2	6	665988	665993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428276
14051	NC_007576	AGCA	2	8	666021	666028	50 %	0 %	25 %	25 %	81428276
14052	NC_007576	CGAT	2	8	666054	666061	25 %	25 %	25 %	25 %	81428276
14053	NC_007576	TAT	2	6	666064	666069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428276
14054	NC_007576	ATT	2	6	666128	666133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428276
14055	NC_007576	AGTG	2	8	666202	666209	25 %	25 %	50 %	0 %	81428276
14056	NC_007576	A	7	7	666375	666381	100 %	0 %	0 %	0 %	81428276
14057	NC_007576	TAG	2	6	666466	666471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428277
14058	NC_007576	ATT	2	6	666486	666491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428277
14059	NC_007576	GGC	2	6	666498	666503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428277
14060	NC_007576	GCA	2	6	666654	666659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428277
14061	NC_007576	TGG	2	6	666776	666781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428277
14062	NC_007576	CGT	2	6	666827	666832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428277
14063	NC_007576	CAA	2	6	666873	666878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428277
14064	NC_007576	GAT	2	6	666879	666884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428277
14065	NC_007576	CCG	2	6	666893	666898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428277
14066	NC_007576	CCG	2	6	666928	666933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428277
14067	NC_007576	CGTTA	2	10	667024	667033	20 %	40 %	20 %	20 %	81428277
14068	NC_007576	TCA	2	6	667046	667051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428277
14069	NC_007576	TGC	3	9	667097	667105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428277
14070	NC_007576	ACA	2	6	667135	667140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428277
14071	NC_007576	GATGCA	2	12	667149	667160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	81428277
14072	NC_007576	CGC	2	6	667172	667177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428277
14073	NC_007576	GTG	2	6	667197	667202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428277
14074	NC_007576	GGC	2	6	667299	667304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428277
14075	NC_007576	ATT	2	6	667358	667363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428277
14076	NC_007576	GAAAA	2	10	667416	667425	80 %	0 %	20 %	0 %	81428277
14077	NC_007576	TGA	2	6	667438	667443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428277
14078	NC_007576	GGT	2	6	667500	667505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428277
14079	NC_007576	AAGA	2	8	667516	667523	75 %	0 %	25 %	0 %	81428277
14080	NC_007576	CAC	2	6	667562	667567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428277
14081	NC_007576	AAG	2	6	667591	667596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428277
14082	NC_007576	GTG	2	6	667617	667622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428277
14083	NC_007576	TTG	2	6	667645	667650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428277
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14086	NC_007576	TGG	2	6	667844	667849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428277
14087	NC_007576	ACT	2	6	668005	668010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428278
14088	NC_007576	A	6	6	668129	668134	100 %	0 %	0 %	0 %	81428278
14089	NC_007576	AAC	2	6	668166	668171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428278
14090	NC_007576	GCG	2	6	668204	668209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428278
14091	NC_007576	CGA	2	6	668229	668234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428278
14092	NC_007576	ATG	2	6	668279	668284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428278
14093	NC_007576	CGTT	2	8	668360	668367	0 %	50 %	25 %	25 %	81428278
14094	NC_007576	CGG	2	6	668453	668458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428278
14095	NC_007576	TTC	2	6	668459	668464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428278
14096	NC_007576	CGT	2	6	668474	668479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428278
14097	NC_007576	GAG	2	6	668510	668515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81428278
14098	NC_007576	GAT	2	6	668540	668545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428278
14099	NC_007576	TGG	2	6	668614	668619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428278
14100	NC_007576	GTG	2	6	668822	668827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428278
14101	NC_007576	ATT	2	6	668869	668874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428278
14102	NC_007576	TGG	2	6	668931	668936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428278
14103	NC_007576	CAA	2	6	669039	669044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428278
14104	NC_007576	TGG	2	6	669064	669069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428278
14105	NC_007576	TA	3	6	669075	669080	50 %	50 %	0 %	0 %	81428278
14106	NC_007576	CCG	2	6	669169	669174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428278
14107	NC_007576	AAAG	2	8	669265	669272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_007576	ATT	2	6	669278	669283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_007576	AGA	2	6	669403	669408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428279
14110	NC_007576	TCAA	2	8	669441	669448	50 %	25 %	0 %	25 %	81428279
14111	NC_007576	AAG	2	6	669449	669454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428279
14112	NC_007576	CA	3	6	669496	669501	50 %	0 %	0 %	50 %	81428279
14113	NC_007576	CAC	2	6	669683	669688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428280
14114	NC_007576	TTC	2	6	669691	669696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428280
14115	NC_007576	ATT	2	6	669772	669777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428280
14116	NC_007576	CAAA	2	8	669823	669830	75 %	0 %	0 %	25 %	81428280
14117	NC_007576	AGC	2	6	669861	669866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428280
14118	NC_007576	GCT	2	6	669916	669921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428280
14119	NC_007576	AGA	2	6	669939	669944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428280
14120	NC_007576	CA	3	6	669966	669971	50 %	0 %	0 %	50 %	81428280
14121	NC_007576	GTC	2	6	670067	670072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428280
14122	NC_007576	CTT	2	6	670091	670096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428280
14123	NC_007576	CAA	2	6	670120	670125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428280
14124	NC_007576	ATC	2	6	670144	670149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428280
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14126	NC_007576	TCG	2	6	670164	670169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428280
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14131	NC_007576	CTTT	2	8	670423	670430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14133	NC_007576	GTG	2	6	670496	670501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_007576	GTT	2	6	670562	670567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428282
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14150	NC_007576	A	7	7	671263	671269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14229	NC_007576	T	7	7	674917	674923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14230	NC_007576	T	7	7	674930	674936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14231	NC_007576	A	8	8	674970	674977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14232	NC_007576	ACT	2	6	674980	674985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_007576	ATC	2	6	675000	675005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14235	NC_007576	AC	3	6	675073	675078	50 %	0 %	0 %	50 %	81428291
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14238	NC_007576	TGA	2	6	675150	675155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428291
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14241	NC_007576	ATTGCC	2	12	675318	675329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	81428291
14242	NC_007576	A	6	6	675373	675378	100 %	0 %	0 %	0 %	81428291
14243	NC_007576	CAAC	2	8	675423	675430	50 %	0 %	0 %	50 %	81428291
14244	NC_007576	TTA	2	6	675469	675474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428291
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