MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_007576	GAA	2	6	640665	640670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428252
13503	NC_007576	TTA	2	6	640671	640676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428252
13504	NC_007576	GAT	2	6	640716	640721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_007576	T	6	6	640735	640740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_007576	ATT	2	6	640793	640798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_007576	ATGG	2	8	640800	640807	25 %	25 %	50 %	0 %	81428253
13508	NC_007576	T	6	6	640842	640847	0 %	100 %	0 %	0 %	81428253
13509	NC_007576	TTG	2	6	640984	640989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428253
13510	NC_007576	GAT	2	6	640991	640996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428253
13511	NC_007576	ATG	3	9	641046	641054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428253
13512	NC_007576	ATTT	2	8	641135	641142	25 %	75 %	0 %	0 %	81428253
13513	NC_007576	GAA	2	6	641189	641194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428253
13514	NC_007576	ATG	2	6	641223	641228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428253
13515	NC_007576	ATT	3	9	641241	641249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428253
13516	NC_007576	CTT	2	6	641294	641299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428253
13517	NC_007576	ATT	2	6	641325	641330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428253
13518	NC_007576	TTAT	2	8	641454	641461	25 %	75 %	0 %	0 %	81428253
13519	NC_007576	GT	3	6	641512	641517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_007576	TGA	2	6	641563	641568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_007576	AAG	2	6	641648	641653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_007576	T	7	7	641690	641696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_007576	ATA	2	6	641716	641721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_007576	AGTAT	2	10	641730	641739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_007576	GAT	2	6	641753	641758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_007576	GTT	2	6	641785	641790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428254
13527	NC_007576	A	6	6	641816	641821	100 %	0 %	0 %	0 %	81428254
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13529	NC_007576	GGC	2	6	641992	641997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428254
13530	NC_007576	AATG	2	8	642017	642024	50 %	25 %	25 %	0 %	81428254
13531	NC_007576	AGC	3	9	642099	642107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428255
13532	NC_007576	GTGA	2	8	642124	642131	25 %	25 %	50 %	0 %	81428255
13533	NC_007576	TGC	2	6	642132	642137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428255
13534	NC_007576	ATT	2	6	642149	642154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428255
13535	NC_007576	ATTG	2	8	642162	642169	25 %	50 %	25 %	0 %	81428255
13536	NC_007576	GGC	2	6	642198	642203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428255
13537	NC_007576	TCA	2	6	642228	642233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428255
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13539	NC_007576	GTT	2	6	642321	642326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428255
13540	NC_007576	TGT	2	6	642356	642361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428255
13541	NC_007576	GGTT	2	8	642384	642391	0 %	50 %	50 %	0 %	81428255
13542	NC_007576	TTA	2	6	642394	642399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428255
13543	NC_007576	GGT	2	6	642421	642426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428255
13544	NC_007576	GCTG	2	8	642429	642436	0 %	25 %	50 %	25 %	81428255
13545	NC_007576	CAT	2	6	642444	642449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428255
13546	NC_007576	TGG	2	6	642450	642455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428255
13547	NC_007576	T	6	6	642470	642475	0 %	100 %	0 %	0 %	81428255
13548	NC_007576	AGT	2	6	642504	642509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428255
13549	NC_007576	ATG	2	6	642514	642519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428255
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13551	NC_007576	CGG	2	6	642564	642569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428255
13552	NC_007576	AT	3	6	642591	642596	50 %	50 %	0 %	0 %	81428255
13553	NC_007576	GGT	2	6	642623	642628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428255
13554	NC_007576	GAAT	2	8	642686	642693	50 %	25 %	25 %	0 %	81428256
13555	NC_007576	GATTG	2	10	642723	642732	20 %	40 %	40 %	0 %	81428256
13556	NC_007576	TGG	2	6	642759	642764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428256
13557	NC_007576	A	6	6	642835	642840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_007576	GCAC	2	8	642842	642849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_007576	CAA	2	6	642893	642898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428257
13560	NC_007576	GCT	2	6	642917	642922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428257
13561	NC_007576	ACCGA	2	10	642936	642945	40 %	0 %	20 %	40 %	81428257
13562	NC_007576	T	6	6	643034	643039	0 %	100 %	0 %	0 %	81428257
13563	NC_007576	GCG	2	6	643107	643112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428257
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13565	NC_007576	TTA	2	6	643263	643268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428257
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13567	NC_007576	TGT	2	6	643310	643315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428257
13568	NC_007576	T	7	7	643436	643442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_007576	A	7	7	643458	643464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13571	NC_007576	AGA	2	6	643565	643570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_007576	CTA	2	6	643592	643597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13574	NC_007576	TAT	2	6	643646	643651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_007576	A	7	7	643699	643705	100 %	0 %	0 %	0 %	81428258
13576	NC_007576	AAC	2	6	643731	643736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428258
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13582	NC_007576	GGCA	2	8	643929	643936	25 %	0 %	50 %	25 %	81428258
13583	NC_007576	ATTGC	2	10	643972	643981	20 %	40 %	20 %	20 %	81428258
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13586	NC_007576	TA	3	6	644381	644386	50 %	50 %	0 %	0 %	81428258
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13596	NC_007576	ATT	2	6	644710	644715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428258
13597	NC_007576	TCG	2	6	644733	644738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428258
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13599	NC_007576	TGG	2	6	644779	644784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428258
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13601	NC_007576	TGG	3	9	644930	644938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428258
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13603	NC_007576	A	6	6	645134	645139	100 %	0 %	0 %	0 %	81428258
13604	NC_007576	TGT	2	6	645150	645155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428258
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13607	NC_007576	GATT	2	8	645294	645301	25 %	50 %	25 %	0 %	81428258
13608	NC_007576	ATG	2	6	645310	645315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428258
13609	NC_007576	GTT	2	6	645336	645341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428258
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13611	NC_007576	AAG	2	6	645401	645406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428258
13612	NC_007576	GAT	2	6	645424	645429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428258
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13614	NC_007576	A	6	6	645550	645555	100 %	0 %	0 %	0 %	81428258
13615	NC_007576	GCT	2	6	645571	645576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428258
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13618	NC_007576	TTA	3	9	645625	645633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428258
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13620	NC_007576	TTG	2	6	645718	645723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428258
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13622	NC_007576	CAA	2	6	645796	645801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428258
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13993	NC_007576	CAA	2	6	662951	662956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428273
13994	NC_007576	CAA	2	6	663035	663040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428273
13995	NC_007576	GC	3	6	663054	663059	0 %	0 %	50 %	50 %	81428273
13996	NC_007576	ATT	2	6	663157	663162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428273
13997	NC_007576	GCT	2	6	663212	663217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428273
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