MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007576	A	7	7	618150	618156	100 %	0 %	0 %	0 %	81428231
13002	NC_007576	ATT	2	6	618166	618171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428231
13003	NC_007576	CTG	2	6	618189	618194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13004	NC_007576	T	6	6	618196	618201	0 %	100 %	0 %	0 %	81428231
13005	NC_007576	GGT	2	6	618227	618232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428231
13006	NC_007576	CAA	2	6	618233	618238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428231
13007	NC_007576	GCT	2	6	618266	618271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13008	NC_007576	ATT	2	6	618281	618286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428231
13009	NC_007576	AAC	2	6	618351	618356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428231
13010	NC_007576	ATC	2	6	618421	618426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428231
13011	NC_007576	ATGG	2	8	618440	618447	25 %	25 %	50 %	0 %	81428231
13012	NC_007576	ATCA	2	8	618609	618616	50 %	25 %	0 %	25 %	81428231
13013	NC_007576	ATTAA	2	10	618629	618638	60 %	40 %	0 %	0 %	81428231
13014	NC_007576	ACG	2	6	618646	618651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13015	NC_007576	GTT	2	6	618661	618666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428231
13016	NC_007576	GAC	2	6	618674	618679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13017	NC_007576	GCT	2	6	618685	618690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13018	NC_007576	CAT	2	6	618722	618727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428231
13019	NC_007576	CGA	2	6	618762	618767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13020	NC_007576	TGA	2	6	618856	618861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428231
13021	NC_007576	ACG	2	6	618912	618917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428231
13022	NC_007576	AGG	2	6	618959	618964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_007576	T	6	6	618981	618986	0 %	100 %	0 %	0 %	81428232
13024	NC_007576	TAGC	2	8	619133	619140	25 %	25 %	25 %	25 %	81428232
13025	NC_007576	TTA	2	6	619240	619245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428232
13026	NC_007576	GGGATG	2	12	619312	619323	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	81428232
13027	NC_007576	CGC	2	6	619325	619330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428232
13028	NC_007576	CAAT	2	8	619333	619340	50 %	25 %	0 %	25 %	81428232
13029	NC_007576	CGG	2	6	619397	619402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428232
13030	NC_007576	AT	3	6	619434	619439	50 %	50 %	0 %	0 %	81428232
13031	NC_007576	ATC	2	6	619501	619506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428232
13032	NC_007576	TTG	2	6	619537	619542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428232
13033	NC_007576	GTC	2	6	619559	619564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428232
13034	NC_007576	A	6	6	619568	619573	100 %	0 %	0 %	0 %	81428232
13035	NC_007576	AGG	2	6	619600	619605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_007576	TGG	2	6	619652	619657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428233
13037	NC_007576	TGG	2	6	619697	619702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428233
13038	NC_007576	ACG	2	6	619740	619745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428233
13039	NC_007576	GTCA	2	8	619770	619777	25 %	25 %	25 %	25 %	81428233
13040	NC_007576	ATTG	2	8	619778	619785	25 %	50 %	25 %	0 %	81428233
13041	NC_007576	TAA	2	6	619817	619822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428233
13042	NC_007576	TTC	2	6	619829	619834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428233
13043	NC_007576	CAA	2	6	619989	619994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428233
13044	NC_007576	TACG	2	8	620024	620031	25 %	25 %	25 %	25 %	81428233
13045	NC_007576	A	6	6	620047	620052	100 %	0 %	0 %	0 %	81428233
13046	NC_007576	A	6	6	620058	620063	100 %	0 %	0 %	0 %	81428233
13047	NC_007576	AAG	2	6	620193	620198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428233
13048	NC_007576	CGT	2	6	620255	620260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428233
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13050	NC_007576	CCA	2	6	620334	620339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428233
13051	NC_007576	ACA	2	6	620378	620383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428233
13052	NC_007576	CTG	2	6	620482	620487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428233
13053	NC_007576	TGG	2	6	620488	620493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428233
13054	NC_007576	CAA	2	6	620537	620542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428233
13055	NC_007576	TAT	2	6	620576	620581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428234
13056	NC_007576	TGG	2	6	620593	620598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428234
13057	NC_007576	CTT	2	6	620626	620631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428234
13058	NC_007576	CAT	2	6	620662	620667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428234
13059	NC_007576	A	7	7	620702	620708	100 %	0 %	0 %	0 %	81428234
13060	NC_007576	CGT	2	6	620754	620759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428234
13061	NC_007576	ATC	2	6	620774	620779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428234
13062	NC_007576	GTTAGG	2	12	620782	620793	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	81428234
13063	NC_007576	TTA	2	6	620837	620842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428234
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13065	NC_007576	ATT	2	6	620932	620937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428234
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13068	NC_007576	CAT	2	6	621194	621199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428234
13069	NC_007576	A	6	6	621210	621215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_007576	T	6	6	621251	621256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_007576	CTTT	2	8	621303	621310	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13072	NC_007576	GTA	2	6	621413	621418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428235
13073	NC_007576	GTG	2	6	621425	621430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428235
13074	NC_007576	ATC	2	6	621687	621692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428235
13075	NC_007576	T	7	7	621721	621727	0 %	100 %	0 %	0 %	81428235
13076	NC_007576	CAAT	2	8	621773	621780	50 %	25 %	0 %	25 %	81428235
13077	NC_007576	TTG	2	6	621834	621839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428235
13078	NC_007576	CAG	2	6	621911	621916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428235
13079	NC_007576	TTG	2	6	621919	621924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428235
13080	NC_007576	TCG	2	6	621937	621942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428235
13081	NC_007576	CG	3	6	622059	622064	0 %	0 %	50 %	50 %	81428235
13082	NC_007576	AAG	2	6	622102	622107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428235
13083	NC_007576	T	6	6	622115	622120	0 %	100 %	0 %	0 %	81428235
13084	NC_007576	T	8	8	622188	622195	0 %	100 %	0 %	0 %	81428235
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13087	NC_007576	ATT	2	6	622272	622277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_007576	TTGG	2	8	622387	622394	0 %	50 %	50 %	0 %	81428236
13089	NC_007576	T	7	7	622405	622411	0 %	100 %	0 %	0 %	81428236
13090	NC_007576	CAA	2	6	622572	622577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428236
13091	NC_007576	A	6	6	622589	622594	100 %	0 %	0 %	0 %	81428236
13092	NC_007576	GCGG	2	8	622600	622607	0 %	0 %	75 %	25 %	81428236
13093	NC_007576	CGC	2	6	622741	622746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428236
13094	NC_007576	TCA	2	6	622762	622767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428236
13095	NC_007576	G	6	6	622784	622789	0 %	0 %	100 %	0 %	81428236
13096	NC_007576	CAG	2	6	622802	622807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428236
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13098	NC_007576	A	6	6	622901	622906	100 %	0 %	0 %	0 %	81428236
13099	NC_007576	AAT	2	6	622928	622933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428236
13100	NC_007576	TGC	2	6	623032	623037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428236
13101	NC_007576	CGG	2	6	623096	623101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428236
13102	NC_007576	TAC	2	6	623225	623230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428236
13103	NC_007576	TGA	2	6	623233	623238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428236
13104	NC_007576	TGAA	2	8	623244	623251	50 %	25 %	25 %	0 %	81428236
13105	NC_007576	GAA	2	6	623276	623281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428236
13106	NC_007576	ATCA	2	8	623322	623329	50 %	25 %	0 %	25 %	81428236
13107	NC_007576	CAA	2	6	623330	623335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428236
13108	NC_007576	GTT	2	6	623368	623373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428236
13109	NC_007576	TGG	2	6	623389	623394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428236
13110	NC_007576	CCATTG	2	12	623415	623426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	81428236
13111	NC_007576	GGT	2	6	623438	623443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428236
13112	NC_007576	GT	3	6	623442	623447	0 %	50 %	50 %	0 %	81428236
13113	NC_007576	GTT	2	6	623453	623458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428236
13114	NC_007576	GCG	2	6	623466	623471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428236
13115	NC_007576	CGA	2	6	623526	623531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428236
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13117	NC_007576	TTC	2	6	623584	623589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428236
13118	NC_007576	AAG	3	9	623600	623608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428236
13119	NC_007576	TAA	2	6	623620	623625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428236
13120	NC_007576	CCAA	2	8	623633	623640	50 %	0 %	0 %	50 %	81428236
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13122	NC_007576	GTT	2	6	623716	623721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428236
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