MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007576	TAA	2	6	548488	548493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_007576	AT	3	6	548563	548568	50 %	50 %	0 %	0 %	81428142
11503	NC_007576	TAT	2	6	548580	548585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428142
11504	NC_007576	GGTTG	2	10	548801	548810	0 %	40 %	60 %	0 %	81428142
11505	NC_007576	TGA	3	9	548827	548835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428142
11506	NC_007576	AGCA	2	8	548862	548869	50 %	0 %	25 %	25 %	81428142
11507	NC_007576	TTG	2	6	549064	549069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_007576	TTTA	2	8	549131	549138	25 %	75 %	0 %	0 %	81428143
11509	NC_007576	TTC	2	6	549163	549168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428143
11510	NC_007576	TCA	2	6	549182	549187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428143
11511	NC_007576	GAT	2	6	549205	549210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428143
11512	NC_007576	CAA	2	6	549249	549254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428143
11513	NC_007576	TAT	2	6	549273	549278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428143
11514	NC_007576	T	6	6	549351	549356	0 %	100 %	0 %	0 %	81428143
11515	NC_007576	GGTA	2	8	549410	549417	25 %	25 %	50 %	0 %	81428143
11516	NC_007576	ATC	2	6	549445	549450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428143
11517	NC_007576	TGA	2	6	549471	549476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428143
11518	NC_007576	TCG	2	6	549478	549483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428143
11519	NC_007576	CAA	2	6	549573	549578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428143
11520	NC_007576	TAA	2	6	549642	549647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428143
11521	NC_007576	CAT	2	6	549658	549663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428143
11522	NC_007576	CCT	2	6	549668	549673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_007576	GCA	2	6	549701	549706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_007576	A	6	6	549706	549711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_007576	TCAAAG	2	12	549856	549867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11526	NC_007576	TGGT	2	8	549890	549897	0 %	50 %	50 %	0 %	81428144
11527	NC_007576	GTC	2	6	549908	549913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428144
11528	NC_007576	CTT	2	6	549934	549939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428144
11529	NC_007576	AGC	2	6	550052	550057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428144
11530	NC_007576	ATTTCA	2	12	550059	550070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	81428144
11531	NC_007576	TTG	2	6	550073	550078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428144
11532	NC_007576	CAC	2	6	550087	550092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428144
11533	NC_007576	AGC	2	6	550181	550186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428144
11534	NC_007576	TGA	2	6	550219	550224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428144
11535	NC_007576	ACC	2	6	550265	550270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428144
11536	NC_007576	ATG	2	6	550380	550385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428144
11537	NC_007576	AATA	2	8	550408	550415	75 %	25 %	0 %	0 %	81428144
11538	NC_007576	TGTT	2	8	550439	550446	0 %	75 %	25 %	0 %	81428144
11539	NC_007576	CCT	2	6	550476	550481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_007576	TA	3	6	550482	550487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_007576	TCC	2	6	550526	550531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_007576	AAT	2	6	550533	550538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_007576	ATTA	2	8	550599	550606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_007576	TTA	2	6	550644	550649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_007576	GTA	2	6	550670	550675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_007576	AGT	2	6	550726	550731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_007576	GGC	2	6	550739	550744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_007576	ATTA	2	8	550918	550925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_007576	CAT	2	6	551016	551021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428145
11550	NC_007576	T	6	6	551050	551055	0 %	100 %	0 %	0 %	81428145
11551	NC_007576	AG	3	6	551198	551203	50 %	0 %	50 %	0 %	81428145
11552	NC_007576	AAT	2	6	551217	551222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428145
11553	NC_007576	TGG	2	6	551229	551234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428145
11554	NC_007576	ATT	2	6	551242	551247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428145
11555	NC_007576	GGT	2	6	551260	551265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428145
11556	NC_007576	ATT	2	6	551311	551316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428145
11557	NC_007576	AAT	2	6	551356	551361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428145
11558	NC_007576	ATA	3	9	551372	551380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428145
11559	NC_007576	T	8	8	551398	551405	0 %	100 %	0 %	0 %	81428145
11560	NC_007576	T	7	7	551433	551439	0 %	100 %	0 %	0 %	81428145
11561	NC_007576	TTC	2	6	551464	551469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428145
11562	NC_007576	ACT	2	6	551545	551550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428145
11563	NC_007576	GTA	2	6	551610	551615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_007576	ATA	2	6	551632	551637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_007576	AAT	2	6	551644	551649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_007576	TAAA	2	8	551688	551695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_007576	AAT	2	6	551702	551707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_007576	GTT	2	6	551734	551739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_007576	AGTT	2	8	551760	551767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_007576	A	8	8	551770	551777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_007576	AGG	2	6	551793	551798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_007576	AC	3	6	551811	551816	50 %	0 %	0 %	50 %	81428146
11573	NC_007576	TTTAGA	2	12	551825	551836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	81428146
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11575	NC_007576	AATT	2	8	551893	551900	50 %	50 %	0 %	0 %	81428146
11576	NC_007576	GTC	2	6	551943	551948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428146
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11578	NC_007576	TTTA	2	8	551995	552002	25 %	75 %	0 %	0 %	81428146
11579	NC_007576	CAA	2	6	552156	552161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428146
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11581	NC_007576	AGC	2	6	552338	552343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428146
11582	NC_007576	AAG	2	6	552417	552422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428146
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11584	NC_007576	ATT	2	6	552484	552489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428146
11585	NC_007576	GCAGTG	2	12	552552	552563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	81428146
11586	NC_007576	CG	3	6	552628	552633	0 %	0 %	50 %	50 %	81428146
11587	NC_007576	AAT	2	6	552763	552768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428146
11588	NC_007576	ATT	2	6	552788	552793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_007576	T	6	6	552855	552860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_007576	T	7	7	552867	552873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_007576	TAA	2	6	552879	552884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_007576	TTA	3	9	553019	553027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428147
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11594	NC_007576	CTTCA	2	10	553278	553287	20 %	40 %	0 %	40 %	81428147
11595	NC_007576	GTT	2	6	553295	553300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428147
11596	NC_007576	GGT	2	6	553301	553306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428147
11597	NC_007576	CAG	2	6	553428	553433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428147
11598	NC_007576	TGA	2	6	553447	553452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428147
11599	NC_007576	CCA	2	6	553564	553569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428147
11600	NC_007576	AGCG	2	8	553666	553673	25 %	0 %	50 %	25 %	81428147
11601	NC_007576	GGT	2	6	553706	553711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428147
11602	NC_007576	CAA	2	6	553716	553721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428147
11603	NC_007576	TTA	2	6	553748	553753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428147
11604	NC_007576	ACG	2	6	553778	553783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428147
11605	NC_007576	AGC	3	9	553819	553827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428147
11606	NC_007576	TAA	2	6	553831	553836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428147
11607	NC_007576	CAG	2	6	553848	553853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428147
11608	NC_007576	AAG	2	6	553875	553880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428147
11609	NC_007576	ATG	2	6	553935	553940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428147
11610	NC_007576	ACA	2	6	553979	553984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428147
11611	NC_007576	CAC	2	6	554026	554031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428147
11612	NC_007576	GAT	2	6	554054	554059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428147
11613	NC_007576	GTG	2	6	554150	554155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428147
11614	NC_007576	AAAG	2	8	554177	554184	75 %	0 %	25 %	0 %	81428147
11615	NC_007576	ATG	2	6	554241	554246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428147
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11618	NC_007576	CGGA	2	8	554361	554368	25 %	0 %	50 %	25 %	81428147
11619	NC_007576	GTG	2	6	554379	554384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428147
11620	NC_007576	ACG	2	6	554393	554398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428147
11621	NC_007576	CAA	2	6	554463	554468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428147
11622	NC_007576	TCA	2	6	554519	554524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428147
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11995	NC_007576	GAT	2	6	573582	573587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428167
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11997	NC_007576	TAA	2	6	573664	573669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428168
11998	NC_007576	ATT	2	6	573688	573693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428168
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