MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007576	T	6	6	522903	522908	0 %	100 %	0 %	0 %	81428116
11002	NC_007576	CTT	2	6	522937	522942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428116
11003	NC_007576	TGGT	2	8	523176	523183	0 %	50 %	50 %	0 %	81428116
11004	NC_007576	TGT	2	6	523192	523197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428116
11005	NC_007576	CAA	2	6	523230	523235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428116
11006	NC_007576	GGC	2	6	523250	523255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428116
11007	NC_007576	TG	3	6	523283	523288	0 %	50 %	50 %	0 %	81428116
11008	NC_007576	TCA	2	6	523293	523298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428116
11009	NC_007576	CAT	2	6	523368	523373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428116
11010	NC_007576	AAC	2	6	523399	523404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428116
11011	NC_007576	GTT	2	6	523412	523417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428116
11012	NC_007576	AGC	2	6	523423	523428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428116
11013	NC_007576	TTA	3	9	523640	523648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428116
11014	NC_007576	TAT	2	6	523656	523661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428116
11015	NC_007576	TTA	2	6	523667	523672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428116
11016	NC_007576	A	7	7	523719	523725	100 %	0 %	0 %	0 %	81428117
11017	NC_007576	TAT	2	6	523778	523783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428117
11018	NC_007576	ATTC	2	8	523901	523908	25 %	50 %	0 %	25 %	81428117
11019	NC_007576	GTT	2	6	524050	524055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428117
11020	NC_007576	CTT	2	6	524067	524072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428117
11021	NC_007576	GCCTTA	2	12	524119	524130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	81428117
11022	NC_007576	ATT	2	6	524254	524259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428117
11023	NC_007576	ATT	2	6	524278	524283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428117
11024	NC_007576	GAT	2	6	524289	524294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428117
11025	NC_007576	GCCG	2	8	524302	524309	0 %	0 %	50 %	50 %	81428117
11026	NC_007576	GCT	2	6	524326	524331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428117
11027	NC_007576	CAG	2	6	524342	524347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428117
11028	NC_007576	CAG	2	6	524486	524491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428117
11029	NC_007576	TAT	2	6	524531	524536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428117
11030	NC_007576	CAG	2	6	524585	524590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428117
11031	NC_007576	A	6	6	524638	524643	100 %	0 %	0 %	0 %	81428118
11032	NC_007576	CTA	2	6	524694	524699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428118
11033	NC_007576	CG	3	6	524710	524715	0 %	0 %	50 %	50 %	81428118
11034	NC_007576	ATA	2	6	524822	524827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428118
11035	NC_007576	TGA	2	6	524883	524888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428118
11036	NC_007576	ACA	2	6	524966	524971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428118
11037	NC_007576	ACA	2	6	524988	524993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428118
11038	NC_007576	TGA	2	6	525018	525023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428118
11039	NC_007576	TCG	2	6	525026	525031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428118
11040	NC_007576	AAC	2	6	525033	525038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428118
11041	NC_007576	CAA	3	9	525112	525120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428118
11042	NC_007576	GATG	2	8	525168	525175	25 %	25 %	50 %	0 %	81428118
11043	NC_007576	CGGCTT	2	12	525179	525190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428118
11044	NC_007576	CAA	2	6	525203	525208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428118
11045	NC_007576	GAA	2	6	525217	525222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428118
11046	NC_007576	CAA	2	6	525277	525282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428118
11047	NC_007576	TGA	2	6	525339	525344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428118
11048	NC_007576	AGA	2	6	525384	525389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428118
11049	NC_007576	AGG	2	6	525421	525426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_007576	ATT	2	6	525447	525452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428119
11051	NC_007576	TGAT	2	8	525604	525611	25 %	50 %	25 %	0 %	81428119
11052	NC_007576	GGAA	2	8	525688	525695	50 %	0 %	50 %	0 %	81428119
11053	NC_007576	CAA	2	6	525711	525716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428119
11054	NC_007576	TGT	2	6	525749	525754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428119
11055	NC_007576	ATC	2	6	525784	525789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428119
11056	NC_007576	CAA	3	9	525891	525899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428119
11057	NC_007576	ATA	2	6	526048	526053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428119
11058	NC_007576	AATT	2	8	526105	526112	50 %	50 %	0 %	0 %	81428119
11059	NC_007576	GAA	2	6	526127	526132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428119
11060	NC_007576	TCT	2	6	526135	526140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428119
11061	NC_007576	AAGA	2	8	526192	526199	75 %	0 %	25 %	0 %	81428119
11062	NC_007576	TGAAT	2	10	526230	526239	40 %	40 %	20 %	0 %	81428120
11063	NC_007576	CGTT	2	8	526248	526255	0 %	50 %	25 %	25 %	81428120
11064	NC_007576	ATG	2	6	526270	526275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428120
11065	NC_007576	GAT	2	6	526351	526356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428120
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11067	NC_007576	CAA	2	6	526417	526422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428120
11068	NC_007576	CAT	2	6	526455	526460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428120
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11071	NC_007576	GAA	2	6	526660	526665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428120
11072	NC_007576	GTT	2	6	526741	526746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428120
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11074	NC_007576	TTG	2	6	526766	526771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428120
11075	NC_007576	GTC	2	6	526846	526851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428120
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11077	NC_007576	GTT	2	6	526894	526899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_007576	GTT	2	6	526954	526959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_007576	GAG	2	6	526961	526966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_007576	TAA	2	6	527011	527016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_007576	A	6	6	527029	527034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_007576	TAA	2	6	527080	527085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_007576	TGG	2	6	527156	527161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428121
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11086	NC_007576	GTT	2	6	527341	527346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428121
11087	NC_007576	TGA	2	6	527361	527366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428121
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11089	NC_007576	TGTT	2	8	527423	527430	0 %	75 %	25 %	0 %	81428121
11090	NC_007576	GT	3	6	527490	527495	0 %	50 %	50 %	0 %	81428121
11091	NC_007576	T	6	6	527626	527631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_007576	CTT	2	6	527638	527643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_007576	TTAC	2	8	527732	527739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11094	NC_007576	CAT	2	6	527801	527806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428122
11095	NC_007576	TAA	2	6	527904	527909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428122
11096	NC_007576	GCG	2	6	527944	527949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428122
11097	NC_007576	GCT	2	6	527956	527961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428122
11098	NC_007576	TCA	2	6	528021	528026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428122
11099	NC_007576	GGC	2	6	528066	528071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428122
11100	NC_007576	CAG	2	6	528116	528121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428122
11101	NC_007576	TGA	2	6	528122	528127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428122
11102	NC_007576	ATG	2	6	528134	528139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428122
11103	NC_007576	AGA	2	6	528240	528245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428122
11104	NC_007576	GGC	2	6	528255	528260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428122
11105	NC_007576	ATGG	2	8	528316	528323	25 %	25 %	50 %	0 %	81428122
11106	NC_007576	TTAC	2	8	528377	528384	25 %	50 %	0 %	25 %	81428122
11107	NC_007576	TGA	2	6	528387	528392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428122
11108	NC_007576	AAGAT	2	10	528452	528461	60 %	20 %	20 %	0 %	81428122
11109	NC_007576	GGT	2	6	528505	528510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428122
11110	NC_007576	CAT	2	6	528578	528583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428122
11111	NC_007576	GCT	2	6	528601	528606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428122
11112	NC_007576	ATT	2	6	528674	528679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428122
11113	NC_007576	TGA	2	6	528753	528758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428122
11114	NC_007576	AGG	2	6	528955	528960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_007576	GTT	2	6	528990	528995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428123
11116	NC_007576	GACCA	2	10	529077	529086	40 %	0 %	20 %	40 %	81428123
11117	NC_007576	AC	3	6	529176	529181	50 %	0 %	0 %	50 %	81428123
11118	NC_007576	TCAT	2	8	529182	529189	25 %	50 %	0 %	25 %	81428123
11119	NC_007576	ATT	2	6	529198	529203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428123
11120	NC_007576	CAG	2	6	529206	529211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428123
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11122	NC_007576	ATA	2	6	529350	529355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428124
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11242	NC_007576	ATT	2	6	534684	534689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428131
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