MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

< Previous12...81828384858687888990919293Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_006814	ATC	2	6	1986711	1986716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338213
46002	NC_006814	GAC	2	6	1986731	1986736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46003	NC_006814	TCA	2	6	1986784	1986789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338213
46004	NC_006814	TTG	2	6	1986796	1986801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338213
46005	NC_006814	TCA	2	6	1986838	1986843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338213
46006	NC_006814	GCT	2	6	1986895	1986900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46007	NC_006814	GTG	2	6	1986908	1986913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58338213
46008	NC_006814	CTT	2	6	1986919	1986924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338213
46009	NC_006814	CTT	2	6	1986932	1986937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338213
46010	NC_006814	TTA	2	6	1987078	1987083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338213
46011	NC_006814	AAC	2	6	1987092	1987097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338213
46012	NC_006814	CTT	2	6	1987118	1987123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338213
46013	NC_006814	TGC	2	6	1987125	1987130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46014	NC_006814	ATG	2	6	1987202	1987207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338213
46015	NC_006814	ATA	2	6	1987210	1987215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338213
46016	NC_006814	CTT	2	6	1987247	1987252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338213
46017	NC_006814	TAG	2	6	1987286	1987291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338213
46018	NC_006814	CTT	2	6	1987374	1987379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338213
46019	NC_006814	CTG	2	6	1987439	1987444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46020	NC_006814	TCA	2	6	1987477	1987482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338213
46021	NC_006814	TAG	2	6	1987592	1987597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338213
46022	NC_006814	AGCA	2	8	1987614	1987621	50 %	0 %	25 %	25 %	58338213
46023	NC_006814	CAT	2	6	1987643	1987648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338213
46024	NC_006814	AGC	2	6	1987668	1987673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46025	NC_006814	CTG	2	6	1987682	1987687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46026	NC_006814	GAA	2	6	1987729	1987734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338213
46027	NC_006814	GCA	2	6	1987735	1987740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338213
46028	NC_006814	CTT	2	6	1987751	1987756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338213
46029	NC_006814	TAT	2	6	1987949	1987954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46030	NC_006814	AAT	2	6	1988024	1988029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46031	NC_006814	TA	3	6	1988043	1988048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46032	NC_006814	ATT	2	6	1988050	1988055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46033	NC_006814	TTA	2	6	1988058	1988063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46034	NC_006814	ATT	2	6	1988104	1988109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46035	NC_006814	CA	3	6	1988120	1988125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46036	NC_006814	TA	4	8	1988128	1988135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46037	NC_006814	TTAT	2	8	1988145	1988152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46038	NC_006814	A	6	6	1988155	1988160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46039	NC_006814	TAA	2	6	1988163	1988168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46040	NC_006814	T	6	6	1988173	1988178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46041	NC_006814	ATT	2	6	1988180	1988185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46042	NC_006814	ATT	2	6	1988192	1988197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46043	NC_006814	T	6	6	1988218	1988223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46044	NC_006814	TATT	2	8	1988270	1988277	25 %	75 %	0 %	0 %	58338214
46045	NC_006814	T	6	6	1988382	1988387	0 %	100 %	0 %	0 %	58338214
46046	NC_006814	CTT	2	6	1988460	1988465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338214
46047	NC_006814	TCT	2	6	1988492	1988497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338214
46048	NC_006814	TAACG	2	10	1988544	1988553	40 %	20 %	20 %	20 %	58338214
46049	NC_006814	T	6	6	1988565	1988570	0 %	100 %	0 %	0 %	58338214
46050	NC_006814	GAC	2	6	1988610	1988615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46051	NC_006814	GAA	2	6	1988616	1988621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338214
46052	NC_006814	CTTG	2	8	1988720	1988727	0 %	50 %	25 %	25 %	58338214
46053	NC_006814	GCTT	2	8	1988741	1988748	0 %	50 %	25 %	25 %	58338214
46054	NC_006814	T	7	7	1988747	1988753	0 %	100 %	0 %	0 %	58338214
46055	NC_006814	ATC	2	6	1988773	1988778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338214
46056	NC_006814	ATC	2	6	1988908	1988913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338214
46057	NC_006814	CAT	2	6	1988934	1988939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338214
46058	NC_006814	AGC	2	6	1988980	1988985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46059	NC_006814	CTT	2	6	1989018	1989023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338214
46060	NC_006814	CAG	2	6	1989051	1989056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46061	NC_006814	CAT	2	6	1989145	1989150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338214
46062	NC_006814	TGAA	2	8	1989175	1989182	50 %	25 %	25 %	0 %	58338214
46063	NC_006814	CTT	2	6	1989198	1989203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338214
46064	NC_006814	GTT	2	6	1989245	1989250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338214
46065	NC_006814	AAT	2	6	1989522	1989527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338214
46066	NC_006814	ACG	2	6	1989571	1989576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46067	NC_006814	AGT	2	6	1989625	1989630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338214
46068	NC_006814	TGA	2	6	1989643	1989648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338214
46069	NC_006814	GAT	2	6	1989664	1989669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338214
46070	NC_006814	AGC	2	6	1989682	1989687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46071	NC_006814	ACA	2	6	1989704	1989709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338214
46072	NC_006814	TAA	2	6	1989741	1989746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338214
46073	NC_006814	CAG	2	6	1989885	1989890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46074	NC_006814	ACA	2	6	1989980	1989985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338214
46075	NC_006814	ACC	2	6	1990000	1990005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338214
46076	NC_006814	AGC	2	6	1990093	1990098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338214
46077	NC_006814	CAA	2	6	1990125	1990130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338214
46078	NC_006814	CAT	2	6	1990134	1990139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338214
46079	NC_006814	ATT	2	6	1990166	1990171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338214
46080	NC_006814	AAT	2	6	1990205	1990210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338215
46081	NC_006814	TTA	2	6	1990215	1990220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338215
46082	NC_006814	AATC	2	8	1990278	1990285	50 %	25 %	0 %	25 %	58338215
46083	NC_006814	CAT	2	6	1990308	1990313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338215
46084	NC_006814	TTA	2	6	1990430	1990435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338215
46085	NC_006814	TTC	2	6	1990441	1990446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338215
46086	NC_006814	TCT	2	6	1990463	1990468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338215
46087	NC_006814	T	6	6	1990507	1990512	0 %	100 %	0 %	0 %	58338215
46088	NC_006814	T	6	6	1990530	1990535	0 %	100 %	0 %	0 %	58338215
46089	NC_006814	ATA	2	6	1990559	1990564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338215
46090	NC_006814	T	6	6	1990570	1990575	0 %	100 %	0 %	0 %	58338215
46091	NC_006814	CAA	2	6	1990636	1990641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338215
46092	NC_006814	ATC	2	6	1990705	1990710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338215
46093	NC_006814	AATT	2	8	1990735	1990742	50 %	50 %	0 %	0 %	58338215
46094	NC_006814	TTC	2	6	1990771	1990776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338215
46095	NC_006814	TAA	2	6	1990843	1990848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338215
46096	NC_006814	TGA	2	6	1990849	1990854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338215
46097	NC_006814	TAA	2	6	1990930	1990935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338215
46098	NC_006814	T	6	6	1990944	1990949	0 %	100 %	0 %	0 %	58338215
46099	NC_006814	CAT	2	6	1991001	1991006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338215
46100	NC_006814	TTC	2	6	1991181	1991186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338215
46101	NC_006814	AAG	2	6	1991248	1991253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338215
46102	NC_006814	ACC	2	6	1991281	1991286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338215
46103	NC_006814	GC	4	8	1991331	1991338	0 %	0 %	50 %	50 %	58338215
46104	NC_006814	TCA	2	6	1991357	1991362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338215
46105	NC_006814	AAT	2	6	1991386	1991391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338215
46106	NC_006814	TGC	2	6	1991527	1991532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338215
46107	NC_006814	A	7	7	1991586	1991592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46108	NC_006814	ATT	2	6	1991597	1991602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46109	NC_006814	CCA	2	6	1991603	1991608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46110	NC_006814	ATG	2	6	1991618	1991623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46111	NC_006814	ACT	2	6	1991638	1991643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46112	NC_006814	TATT	2	8	1991678	1991685	25 %	75 %	0 %	0 %	58338216
46113	NC_006814	CCA	2	6	1991874	1991879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338216
46114	NC_006814	CAT	2	6	1991896	1991901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338216
46115	NC_006814	GAC	2	6	1991924	1991929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338216
46116	NC_006814	AT	3	6	1991951	1991956	50 %	50 %	0 %	0 %	58338216
46117	NC_006814	CTTA	2	8	1992013	1992020	25 %	50 %	0 %	25 %	58338216
46118	NC_006814	TCCA	2	8	1992023	1992030	25 %	25 %	0 %	50 %	58338216
46119	NC_006814	CATA	2	8	1992084	1992091	50 %	25 %	0 %	25 %	58338216
46120	NC_006814	CTT	2	6	1992144	1992149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338216
46121	NC_006814	TTA	2	6	1992158	1992163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338216
46122	NC_006814	TTG	2	6	1992169	1992174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338216
46123	NC_006814	TAA	2	6	1992175	1992180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338216
46124	NC_006814	ATTT	2	8	1992226	1992233	25 %	75 %	0 %	0 %	58338216
46125	NC_006814	TGT	2	6	1992256	1992261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338216
46126	NC_006814	TCGAA	2	10	1992265	1992274	40 %	20 %	20 %	20 %	58338216
46127	NC_006814	AAT	2	6	1992307	1992312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338216
46128	NC_006814	TAG	2	6	1992386	1992391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338216
46129	NC_006814	CCA	2	6	1992406	1992411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338216
46130	NC_006814	AAG	2	6	1992511	1992516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338216
46131	NC_006814	CTT	2	6	1992580	1992585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338217
46132	NC_006814	AAT	2	6	1992587	1992592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338217
46133	NC_006814	A	6	6	1992675	1992680	100 %	0 %	0 %	0 %	58338217
46134	NC_006814	TCA	2	6	1992711	1992716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338217
46135	NC_006814	GACC	2	8	1992766	1992773	25 %	0 %	25 %	50 %	58338217
46136	NC_006814	TAG	2	6	1992940	1992945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46137	NC_006814	A	7	7	1992949	1992955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46138	NC_006814	CTT	2	6	1993082	1993087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338218
46139	NC_006814	TTA	2	6	1993159	1993164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46140	NC_006814	TATT	2	8	1993195	1993202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46141	NC_006814	A	7	7	1993205	1993211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46142	NC_006814	TG	3	6	1993255	1993260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46143	NC_006814	T	6	6	1993277	1993282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46144	NC_006814	CAT	2	6	1993312	1993317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46145	NC_006814	TCA	2	6	1993476	1993481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46146	NC_006814	TTG	2	6	1993497	1993502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46147	NC_006814	TAT	2	6	1993511	1993516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46148	NC_006814	T	6	6	1993516	1993521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...81828384858687888990919293Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.