MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006814	CTAC	2	8	172462	172469	25 %	25 %	0 %	50 %	58336521
4002	NC_006814	GCA	2	6	172473	172478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336521
4003	NC_006814	AAG	2	6	172494	172499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336521
4004	NC_006814	A	6	6	172530	172535	100 %	0 %	0 %	0 %	58336521
4005	NC_006814	GAA	2	6	172580	172585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336522
4006	NC_006814	TAA	2	6	172588	172593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336522
4007	NC_006814	A	6	6	172680	172685	100 %	0 %	0 %	0 %	58336522
4008	NC_006814	TA	3	6	172711	172716	50 %	50 %	0 %	0 %	58336522
4009	NC_006814	TAA	2	6	172745	172750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336522
4010	NC_006814	GGAA	2	8	172784	172791	50 %	0 %	50 %	0 %	58336522
4011	NC_006814	TGA	2	6	172808	172813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4012	NC_006814	ATTT	2	8	172842	172849	25 %	75 %	0 %	0 %	58336522
4013	NC_006814	TAAAG	2	10	172865	172874	60 %	20 %	20 %	0 %	58336522
4014	NC_006814	TGA	3	9	172895	172903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4015	NC_006814	TTCA	2	8	172971	172978	25 %	50 %	0 %	25 %	58336522
4016	NC_006814	TTA	2	6	173014	173019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336522
4017	NC_006814	ATG	2	6	173032	173037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4018	NC_006814	TGA	2	6	173093	173098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4019	NC_006814	GGA	2	6	173145	173150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336522
4020	NC_006814	AAGA	2	8	173286	173293	75 %	0 %	25 %	0 %	58336522
4021	NC_006814	ATG	2	6	173329	173334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4022	NC_006814	ATG	2	6	173344	173349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4023	NC_006814	AAG	2	6	173376	173381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336522
4024	NC_006814	TGG	2	6	173384	173389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336522
4025	NC_006814	TGT	3	9	173393	173401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336522
4026	NC_006814	AAT	2	6	173421	173426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336522
4027	NC_006814	AAG	2	6	173427	173432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336522
4028	NC_006814	TAC	2	6	173433	173438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336522
4029	NC_006814	AGT	2	6	173492	173497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336522
4030	NC_006814	TACT	2	8	173507	173514	25 %	50 %	0 %	25 %	58336522
4031	NC_006814	AAG	2	6	173556	173561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336522
4032	NC_006814	CA	3	6	173630	173635	50 %	0 %	0 %	50 %	58336522
4033	NC_006814	ATTT	2	8	173636	173643	25 %	75 %	0 %	0 %	58336522
4034	NC_006814	AAT	2	6	173659	173664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336522
4035	NC_006814	T	6	6	173696	173701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_006814	T	7	7	173741	173747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_006814	TGAA	2	8	173763	173770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_006814	AAT	2	6	173783	173788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336523
4039	NC_006814	GTC	2	6	173811	173816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4040	NC_006814	ATTTA	2	10	173921	173930	40 %	60 %	0 %	0 %	58336523
4041	NC_006814	ATT	2	6	173931	173936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336523
4042	NC_006814	T	6	6	173954	173959	0 %	100 %	0 %	0 %	58336523
4043	NC_006814	ATT	2	6	174155	174160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336523
4044	NC_006814	TGCT	2	8	174172	174179	0 %	50 %	25 %	25 %	58336523
4045	NC_006814	ATT	2	6	174183	174188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336523
4046	NC_006814	GTA	2	6	174210	174215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336523
4047	NC_006814	AAAGGA	2	12	174227	174238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336523
4048	NC_006814	CTT	3	9	174303	174311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336523
4049	NC_006814	ATCA	2	8	174326	174333	50 %	25 %	0 %	25 %	58336523
4050	NC_006814	TGG	2	6	174335	174340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336523
4051	NC_006814	CTG	2	6	174369	174374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4052	NC_006814	TTA	2	6	174393	174398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336523
4053	NC_006814	AGC	2	6	174409	174414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4054	NC_006814	CGA	2	6	174445	174450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4055	NC_006814	CTT	2	6	174539	174544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336523
4056	NC_006814	CTA	2	6	174564	174569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336523
4057	NC_006814	T	6	6	174618	174623	0 %	100 %	0 %	0 %	58336523
4058	NC_006814	TCA	2	6	174687	174692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336523
4059	NC_006814	TTA	2	6	174699	174704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336523
4060	NC_006814	TTA	2	6	174723	174728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336523
4061	NC_006814	TACGAT	2	12	174812	174823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58336523
4062	NC_006814	ATTT	2	8	174887	174894	25 %	75 %	0 %	0 %	58336523
4063	NC_006814	GCA	2	6	174897	174902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4064	NC_006814	GTAT	2	8	174909	174916	25 %	50 %	25 %	0 %	58336523
4065	NC_006814	AGA	2	6	174959	174964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336523
4066	NC_006814	AAG	2	6	174972	174977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336523
4067	NC_006814	CAATG	2	10	174998	175007	40 %	20 %	20 %	20 %	58336523
4068	NC_006814	AGA	2	6	175135	175140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336523
4069	NC_006814	AAG	2	6	175231	175236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336523
4070	NC_006814	TGA	2	6	175289	175294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336523
4071	NC_006814	AGA	2	6	175303	175308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336523
4072	NC_006814	TGC	2	6	175340	175345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4073	NC_006814	TCG	2	6	175499	175504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336523
4074	NC_006814	TCT	2	6	175564	175569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336523
4075	NC_006814	ACGT	2	8	175594	175601	25 %	25 %	25 %	25 %	58336523
4076	NC_006814	TTA	2	6	175634	175639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_006814	T	6	6	175646	175651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_006814	A	6	6	175657	175662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_006814	AAT	2	6	175674	175679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_006814	ATT	2	6	175711	175716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336524
4081	NC_006814	TCA	2	6	175776	175781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336524
4082	NC_006814	ATCA	2	8	175802	175809	50 %	25 %	0 %	25 %	58336524
4083	NC_006814	CAA	2	6	175813	175818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336524
4084	NC_006814	TATT	2	8	175851	175858	25 %	75 %	0 %	0 %	58336524
4085	NC_006814	ATT	2	6	175904	175909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336524
4086	NC_006814	TAC	2	6	175939	175944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336524
4087	NC_006814	GCG	2	6	175992	175997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336524
4088	NC_006814	AAT	2	6	176100	176105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336524
4089	NC_006814	CTAA	2	8	176109	176116	50 %	25 %	0 %	25 %	58336524
4090	NC_006814	ACC	2	6	176150	176155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336524
4091	NC_006814	TCA	2	6	176202	176207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336524
4092	NC_006814	GAT	2	6	176324	176329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336524
4093	NC_006814	TCA	2	6	176340	176345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336524
4094	NC_006814	T	6	6	176360	176365	0 %	100 %	0 %	0 %	58336524
4095	NC_006814	GAA	2	6	176449	176454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336524
4096	NC_006814	TCG	2	6	176505	176510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336524
4097	NC_006814	GAG	2	6	176583	176588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336524
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4099	NC_006814	A	6	6	176631	176636	100 %	0 %	0 %	0 %	58336524
4100	NC_006814	ATA	2	6	176676	176681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336524
4101	NC_006814	TCT	2	6	176694	176699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336525
4102	NC_006814	TAT	2	6	176700	176705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336525
4103	NC_006814	AAG	2	6	176753	176758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336525
4104	NC_006814	ATT	2	6	176854	176859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336525
4105	NC_006814	ACT	2	6	176864	176869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336525
4106	NC_006814	T	6	6	176974	176979	0 %	100 %	0 %	0 %	58336525
4107	NC_006814	GTTT	2	8	177020	177027	0 %	75 %	25 %	0 %	58336525
4108	NC_006814	ATT	2	6	177085	177090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336525
4109	NC_006814	AT	3	6	177173	177178	50 %	50 %	0 %	0 %	58336525
4110	NC_006814	ATT	2	6	177181	177186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336525
4111	NC_006814	TTC	2	6	177199	177204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336525
4112	NC_006814	AGG	2	6	177210	177215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336525
4113	NC_006814	TAG	2	6	177228	177233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336525
4114	NC_006814	AAC	2	6	177370	177375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336525
4115	NC_006814	TTTA	2	8	177382	177389	25 %	75 %	0 %	0 %	58336525
4116	NC_006814	T	7	7	177404	177410	0 %	100 %	0 %	0 %	58336525
4117	NC_006814	GCT	2	6	177415	177420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336525
4118	NC_006814	T	6	6	177469	177474	0 %	100 %	0 %	0 %	58336525
4119	NC_006814	T	6	6	177485	177490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_006814	TAT	2	6	177511	177516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_006814	GTTT	2	8	177549	177556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_006814	ATTA	2	8	177557	177564	50 %	50 %	0 %	0 %	58336526
4123	NC_006814	TTA	2	6	177568	177573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336526
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4125	NC_006814	CAT	2	6	177677	177682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336526
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4251	NC_006814	TTC	2	6	182552	182557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
4252	NC_006814	TGA	2	6	182616	182621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4253	NC_006814	TTG	2	6	182636	182641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
4254	NC_006814	AAG	3	9	182693	182701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
4255	NC_006814	CTT	2	6	182773	182778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
4256	NC_006814	GAT	2	6	182986	182991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4257	NC_006814	ACT	2	6	182997	183002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
4258	NC_006814	CTT	2	6	183310	183315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
4259	NC_006814	AGT	2	6	183322	183327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4260	NC_006814	TGA	2	6	183408	183413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4261	NC_006814	TCA	2	6	183414	183419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
4262	NC_006814	ATG	2	6	183422	183427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4263	NC_006814	GTT	2	6	183428	183433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
4264	NC_006814	ATT	2	6	183447	183452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336532
4265	NC_006814	CTTT	2	8	183501	183508	0 %	75 %	0 %	25 %	58336532
4266	NC_006814	ATA	2	6	183516	183521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336532
4267	NC_006814	GTT	2	6	183569	183574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
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4269	NC_006814	TTGA	2	8	183635	183642	25 %	50 %	25 %	0 %	58336532
4270	NC_006814	TAC	2	6	183667	183672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
4271	NC_006814	TCT	2	6	183696	183701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
4272	NC_006814	ATT	2	6	183725	183730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336532
4273	NC_006814	ACA	2	6	183779	183784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
4274	NC_006814	CAA	2	6	183798	183803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
4275	NC_006814	TTGG	2	8	183825	183832	0 %	50 %	50 %	0 %	58336532
4276	NC_006814	CAA	2	6	183841	183846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
4277	NC_006814	GTG	2	6	183864	183869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336532
4278	NC_006814	TGA	2	6	183892	183897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4279	NC_006814	ACA	2	6	183934	183939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
4280	NC_006814	TCTT	2	8	183990	183997	0 %	75 %	0 %	25 %	58336532
4281	NC_006814	AAG	2	6	184016	184021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
4282	NC_006814	CGT	2	6	184037	184042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336532
4283	NC_006814	ATG	2	6	184098	184103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4284	NC_006814	ATA	2	6	184137	184142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336532
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4287	NC_006814	TTG	2	6	184365	184370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
4288	NC_006814	CAAT	2	8	184433	184440	50 %	25 %	0 %	25 %	58336532
4289	NC_006814	GCA	2	6	184461	184466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336532
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4291	NC_006814	TACT	2	8	184648	184655	25 %	50 %	0 %	25 %	58336532
4292	NC_006814	AGA	2	6	184666	184671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
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4299	NC_006814	CTG	3	9	184920	184928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336532
4300	NC_006814	AAG	2	6	184985	184990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
4301	NC_006814	AGT	2	6	185029	185034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
4302	NC_006814	TGAC	2	8	185166	185173	25 %	25 %	25 %	25 %	58336532
4303	NC_006814	ACTA	2	8	185177	185184	50 %	25 %	0 %	25 %	58336532
4304	NC_006814	ATG	2	6	185210	185215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
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4306	NC_006814	AAG	2	6	185357	185362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
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4310	NC_006814	A	6	6	185548	185553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4311	NC_006814	A	7	7	185580	185586	100 %	0 %	0 %	0 %	58336533
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4314	NC_006814	A	6	6	185777	185782	100 %	0 %	0 %	0 %	58336533
4315	NC_006814	ATGGA	2	10	185787	185796	40 %	20 %	40 %	0 %	58336533
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4319	NC_006814	ACG	2	6	186028	186033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336533
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4324	NC_006814	AGT	2	6	186207	186212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336533
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4331	NC_006814	TTG	2	6	186583	186588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336533
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4337	NC_006814	TAT	2	6	186831	186836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336533
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4340	NC_006814	AGT	2	6	187014	187019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4341	NC_006814	GTGG	2	8	187140	187147	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4342	NC_006814	AGA	2	6	187160	187165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4343	NC_006814	GTC	2	6	187172	187177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4344	NC_006814	T	6	6	187186	187191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_006814	T	6	6	187203	187208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4346	NC_006814	AGA	2	6	187242	187247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336534
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4354	NC_006814	TAAC	2	8	187535	187542	50 %	25 %	0 %	25 %	58336534
4355	NC_006814	GAA	2	6	187548	187553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336534
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4358	NC_006814	AAC	2	6	187657	187662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336534
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4362	NC_006814	TTAC	2	8	187721	187728	25 %	50 %	0 %	25 %	58336534
4363	NC_006814	GAT	2	6	187768	187773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336534
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4372	NC_006814	GAAG	2	8	188160	188167	50 %	0 %	50 %	0 %	58336534
4373	NC_006814	GAA	2	6	188241	188246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336534
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