MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_006814	CAT	2	6	1853221	1853226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338089
43002	NC_006814	ACAA	2	8	1853245	1853252	75 %	0 %	0 %	25 %	58338089
43003	NC_006814	TCT	2	6	1853259	1853264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338089
43004	NC_006814	ATC	2	6	1853287	1853292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338089
43005	NC_006814	TTA	2	6	1853312	1853317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338089
43006	NC_006814	GC	3	6	1853362	1853367	0 %	0 %	50 %	50 %	58338089
43007	NC_006814	CTTTT	2	10	1853401	1853410	0 %	80 %	0 %	20 %	58338089
43008	NC_006814	ATC	2	6	1853464	1853469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338089
43009	NC_006814	CTG	2	6	1853505	1853510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338089
43010	NC_006814	CTG	2	6	1853555	1853560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338089
43011	NC_006814	AGC	2	6	1853575	1853580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338089
43012	NC_006814	TGA	2	6	1853626	1853631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338089
43013	NC_006814	GAA	2	6	1853676	1853681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338089
43014	NC_006814	TTA	2	6	1853699	1853704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43015	NC_006814	AAT	2	6	1853718	1853723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43016	NC_006814	ATTT	2	8	1853764	1853771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43017	NC_006814	GA	4	8	1853855	1853862	50 %	0 %	50 %	0 %	58338090
43018	NC_006814	TAG	2	6	1853874	1853879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338090
43019	NC_006814	GAA	2	6	1853888	1853893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338090
43020	NC_006814	TTA	2	6	1853960	1853965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338090
43021	NC_006814	TACG	2	8	1854104	1854111	25 %	25 %	25 %	25 %	58338090
43022	NC_006814	T	7	7	1854135	1854141	0 %	100 %	0 %	0 %	58338090
43023	NC_006814	A	6	6	1854206	1854211	100 %	0 %	0 %	0 %	58338090
43024	NC_006814	GCT	2	6	1854230	1854235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338090
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43026	NC_006814	CAG	2	6	1854300	1854305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338090
43027	NC_006814	GGC	2	6	1854332	1854337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58338090
43028	NC_006814	TTTA	2	8	1854339	1854346	25 %	75 %	0 %	0 %	58338090
43029	NC_006814	TTG	2	6	1854411	1854416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338090
43030	NC_006814	AGT	2	6	1854430	1854435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338090
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43032	NC_006814	CTG	2	6	1854537	1854542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338090
43033	NC_006814	AAAATC	2	12	1854589	1854600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	58338091
43034	NC_006814	T	6	6	1854686	1854691	0 %	100 %	0 %	0 %	58338091
43035	NC_006814	CG	3	6	1854726	1854731	0 %	0 %	50 %	50 %	58338091
43036	NC_006814	T	6	6	1854770	1854775	0 %	100 %	0 %	0 %	58338091
43037	NC_006814	AT	3	6	1854839	1854844	50 %	50 %	0 %	0 %	58338091
43038	NC_006814	ATTA	2	8	1854859	1854866	50 %	50 %	0 %	0 %	58338091
43039	NC_006814	TAAA	2	8	1854882	1854889	75 %	25 %	0 %	0 %	58338091
43040	NC_006814	T	7	7	1855031	1855037	0 %	100 %	0 %	0 %	58338091
43041	NC_006814	GCTG	2	8	1855052	1855059	0 %	25 %	50 %	25 %	58338091
43042	NC_006814	ACT	2	6	1855172	1855177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338091
43043	NC_006814	AAT	3	9	1855324	1855332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338091
43044	NC_006814	TTTCA	2	10	1855333	1855342	20 %	60 %	0 %	20 %	58338091
43045	NC_006814	TAAAC	2	10	1855362	1855371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43046	NC_006814	AGG	2	6	1855384	1855389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43047	NC_006814	CTA	2	6	1855637	1855642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338092
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43049	NC_006814	TCTT	2	8	1855820	1855827	0 %	75 %	0 %	25 %	58338092
43050	NC_006814	AAT	2	6	1855828	1855833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338092
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43052	NC_006814	GAT	2	6	1855960	1855965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338092
43053	NC_006814	GAT	2	6	1856011	1856016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338092
43054	NC_006814	ATT	2	6	1856017	1856022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338092
43055	NC_006814	A	6	6	1856036	1856041	100 %	0 %	0 %	0 %	58338092
43056	NC_006814	TAG	2	6	1856050	1856055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43057	NC_006814	TATTT	2	10	1856067	1856076	20 %	80 %	0 %	0 %	58338093
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43069	NC_006814	CCT	2	6	1856508	1856513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58338093
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43102	NC_006814	ACT	2	6	1857742	1857747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338094
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43110	NC_006814	TTA	2	6	1858215	1858220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338094
43111	NC_006814	T	7	7	1858258	1858264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43112	NC_006814	TAAA	2	8	1858274	1858281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43113	NC_006814	T	6	6	1858292	1858297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43114	NC_006814	TAA	2	6	1858314	1858319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338095
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43223	NC_006814	TATT	2	8	1862754	1862761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43226	NC_006814	TAAA	2	8	1862884	1862891	75 %	25 %	0 %	0 %	58338098
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43231	NC_006814	T	7	7	1863311	1863317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43239	NC_006814	ATC	2	6	1863678	1863683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338100
43240	NC_006814	ATA	2	6	1863699	1863704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338100
43241	NC_006814	TAC	2	6	1863721	1863726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338100
43242	NC_006814	TCA	2	6	1863727	1863732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338100
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43244	NC_006814	ATA	2	6	1863827	1863832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338100
43245	NC_006814	ACC	2	6	1863833	1863838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338100
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43260	NC_006814	GAA	2	6	1864458	1864463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43261	NC_006814	ACT	2	6	1864532	1864537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338101
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43264	NC_006814	TA	4	8	1864852	1864859	50 %	50 %	0 %	0 %	58338101
43265	NC_006814	GTT	2	6	1864862	1864867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338101
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43292	NC_006814	TAT	2	6	1866060	1866065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43293	NC_006814	TG	3	6	1866067	1866072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43294	NC_006814	ATGG	2	8	1866073	1866080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43295	NC_006814	T	6	6	1866099	1866104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43296	NC_006814	TGTTA	2	10	1866153	1866162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43297	NC_006814	AATA	2	8	1866205	1866212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43340	NC_006814	TAA	2	6	1867923	1867928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43341	NC_006814	TCT	2	6	1867934	1867939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43342	NC_006814	A	6	6	1867956	1867961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43343	NC_006814	GAA	2	6	1867987	1867992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43344	NC_006814	TTA	2	6	1867998	1868003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43350	NC_006814	TTTTAT	2	12	1868168	1868179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	58338105
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43352	NC_006814	ATTTT	2	10	1868203	1868212	20 %	80 %	0 %	0 %	58338105
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43425	NC_006814	T	6	6	1871690	1871695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43480	NC_006814	TTG	2	6	1874148	1874153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338111
43481	NC_006814	TAA	2	6	1874179	1874184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338111
43482	NC_006814	TTC	2	6	1874236	1874241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338111
43483	NC_006814	ACC	2	6	1874260	1874265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338111
43484	NC_006814	TTG	2	6	1874292	1874297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338111
43485	NC_006814	ATAA	2	8	1874320	1874327	75 %	25 %	0 %	0 %	58338111
43486	NC_006814	GCA	2	6	1874414	1874419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338111
43487	NC_006814	T	6	6	1874431	1874436	0 %	100 %	0 %	0 %	58338111
43488	NC_006814	TTA	2	6	1874441	1874446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338111
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43490	NC_006814	AAT	2	6	1874509	1874514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338111
43491	NC_006814	TTGT	2	8	1874548	1874555	0 %	75 %	25 %	0 %	58338111
43492	NC_006814	TAC	2	6	1874568	1874573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338111
43493	NC_006814	CTT	2	6	1874681	1874686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43494	NC_006814	CTT	2	6	1874986	1874991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338112
43495	NC_006814	CAAT	2	8	1874998	1875005	50 %	25 %	0 %	25 %	58338112
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43499	NC_006814	TCT	2	6	1875175	1875180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338112
43500	NC_006814	CTT	2	6	1875230	1875235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338112

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