MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_006814	AAT	2	6	1830937	1830942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338065
42503	NC_006814	GAT	2	6	1830969	1830974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338065
42504	NC_006814	CTT	2	6	1831174	1831179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338065
42505	NC_006814	TCA	2	6	1831184	1831189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338065
42506	NC_006814	TTC	2	6	1831240	1831245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338065
42507	NC_006814	CAT	2	6	1831285	1831290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338065
42508	NC_006814	TCA	2	6	1831325	1831330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338065
42509	NC_006814	AAT	2	6	1831335	1831340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338065
42510	NC_006814	AGA	2	6	1831416	1831421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338065
42511	NC_006814	CAT	2	6	1831473	1831478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338065
42512	NC_006814	AAT	2	6	1831497	1831502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338065
42513	NC_006814	GAT	2	6	1831527	1831532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338065
42514	NC_006814	GCC	2	6	1831573	1831578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58338065
42515	NC_006814	AAT	2	6	1831579	1831584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338065
42516	NC_006814	A	6	6	1831588	1831593	100 %	0 %	0 %	0 %	58338065
42517	NC_006814	TAC	2	6	1831605	1831610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42519	NC_006814	CAT	2	6	1831750	1831755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338066
42520	NC_006814	CAT	2	6	1831777	1831782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338066
42521	NC_006814	CAATT	2	10	1831802	1831811	40 %	40 %	0 %	20 %	58338066
42522	NC_006814	TTC	2	6	1831850	1831855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338066
42523	NC_006814	ATC	2	6	1831886	1831891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338066
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42529	NC_006814	CAA	3	9	1832065	1832073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338066
42530	NC_006814	ATG	2	6	1832181	1832186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338066
42531	NC_006814	CTT	2	6	1832255	1832260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338066
42532	NC_006814	AAC	2	6	1832280	1832285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338066
42533	NC_006814	TTTC	2	8	1832296	1832303	0 %	75 %	0 %	25 %	58338066
42534	NC_006814	TCT	2	6	1832367	1832372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338066
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42540	NC_006814	CTTGA	2	10	1832611	1832620	20 %	40 %	20 %	20 %	58338066
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42552	NC_006814	ATAA	2	8	1833007	1833014	75 %	25 %	0 %	0 %	58338066
42553	NC_006814	CTTGA	2	10	1833123	1833132	20 %	40 %	20 %	20 %	58338066
42554	NC_006814	T	6	6	1833184	1833189	0 %	100 %	0 %	0 %	58338066
42555	NC_006814	CTC	2	6	1833190	1833195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42556	NC_006814	AAT	2	6	1833273	1833278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338067
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42559	NC_006814	ACC	2	6	1833369	1833374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338067
42560	NC_006814	TA	3	6	1833563	1833568	50 %	50 %	0 %	0 %	58338067
42561	NC_006814	TCAATA	2	12	1833628	1833639	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	58338067
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42563	NC_006814	AATA	2	8	1833692	1833699	75 %	25 %	0 %	0 %	58338067
42564	NC_006814	AAAT	2	8	1833753	1833760	75 %	25 %	0 %	0 %	58338067
42565	NC_006814	TTG	2	6	1833816	1833821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58338067
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42571	NC_006814	ACT	2	6	1833997	1834002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338067
42572	NC_006814	AATT	2	8	1834028	1834035	50 %	50 %	0 %	0 %	58338067
42573	NC_006814	TGA	2	6	1834099	1834104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338067
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42580	NC_006814	T	6	6	1834377	1834382	0 %	100 %	0 %	0 %	58338067
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42584	NC_006814	GAA	2	6	1834725	1834730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58338068
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42589	NC_006814	AGT	2	6	1834945	1834950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338068
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42591	NC_006814	ATC	3	9	1835047	1835055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338068
42592	NC_006814	AAC	2	6	1835056	1835061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338068
42593	NC_006814	A	7	7	1835193	1835199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42594	NC_006814	T	6	6	1835234	1835239	0 %	100 %	0 %	0 %	58338069
42595	NC_006814	TA	3	6	1835245	1835250	50 %	50 %	0 %	0 %	58338069
42596	NC_006814	GTA	2	6	1835255	1835260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338069
42597	NC_006814	TTTC	2	8	1835269	1835276	0 %	75 %	0 %	25 %	58338069
42598	NC_006814	ATG	2	6	1835304	1835309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338069
42599	NC_006814	TCA	2	6	1835457	1835462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338069
42600	NC_006814	AGT	2	6	1835508	1835513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338069
42601	NC_006814	CCATCA	2	12	1835541	1835552	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	58338069
42602	NC_006814	GCT	2	6	1835613	1835618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338069
42603	NC_006814	CAT	3	9	1835626	1835634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338069
42604	NC_006814	ATA	2	6	1835670	1835675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338069
42605	NC_006814	GT	3	6	1835690	1835695	0 %	50 %	50 %	0 %	58338069
42606	NC_006814	ATC	2	6	1835729	1835734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338069
42607	NC_006814	T	6	6	1835735	1835740	0 %	100 %	0 %	0 %	58338069
42608	NC_006814	GTAA	2	8	1835765	1835772	50 %	25 %	25 %	0 %	58338069
42609	NC_006814	TGA	2	6	1835901	1835906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338069
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42612	NC_006814	TCA	2	6	1836018	1836023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338069
42613	NC_006814	TC	3	6	1836086	1836091	0 %	50 %	0 %	50 %	58338069
42614	NC_006814	GCA	2	6	1836222	1836227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58338069
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42616	NC_006814	TTC	2	6	1836416	1836421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338069
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42853	NC_006814	A	7	7	1846872	1846878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42976	NC_006814	CAA	2	6	1851962	1851967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338087
42977	NC_006814	T	6	6	1851975	1851980	0 %	100 %	0 %	0 %	58338087
42978	NC_006814	ACT	2	6	1852035	1852040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338087
42979	NC_006814	T	6	6	1852071	1852076	0 %	100 %	0 %	0 %	58338087
42980	NC_006814	AGT	2	6	1852084	1852089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338087
42981	NC_006814	ATAA	2	8	1852101	1852108	75 %	25 %	0 %	0 %	58338087
42982	NC_006814	ACT	2	6	1852168	1852173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338087
42983	NC_006814	TCT	2	6	1852228	1852233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58338087
42984	NC_006814	TTA	2	6	1852273	1852278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58338087
42985	NC_006814	T	6	6	1852286	1852291	0 %	100 %	0 %	0 %	58338087
42986	NC_006814	ATG	2	6	1852346	1852351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58338087
42987	NC_006814	ACA	2	6	1852352	1852357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58338087
42988	NC_006814	ATCC	2	8	1852452	1852459	25 %	25 %	0 %	50 %	58338088
42989	NC_006814	ATTA	2	8	1852536	1852543	50 %	50 %	0 %	0 %	58338088
42990	NC_006814	TCA	2	6	1852658	1852663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338088
42991	NC_006814	AT	3	6	1852795	1852800	50 %	50 %	0 %	0 %	58338088
42992	NC_006814	ATC	2	6	1852812	1852817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58338088
42993	NC_006814	CAC	2	6	1852835	1852840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58338088
42994	NC_006814	T	6	6	1852854	1852859	0 %	100 %	0 %	0 %	58338088
42995	NC_006814	TAA	2	6	1852911	1852916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58338088
42996	NC_006814	TACGTT	2	12	1852928	1852939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58338088
42997	NC_006814	ATC	2	6	1852980	1852985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42998	NC_006814	C	6	6	1852985	1852990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42999	NC_006814	A	7	7	1853066	1853072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43000	NC_006814	TGC	2	6	1853215	1853220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58338089

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