MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006814	TTCA	2	8	45075	45082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_006814	TTG	2	6	45089	45094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_006814	TTA	2	6	45111	45116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_006814	TCAA	2	8	45125	45132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_006814	T	6	6	45133	45138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_006814	A	6	6	45149	45154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006814	TAAT	2	8	45161	45168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_006814	AAGGA	2	10	45181	45190	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_006814	ATT	2	6	45215	45220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336400
1010	NC_006814	TGA	2	6	45229	45234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336400
1011	NC_006814	TAT	2	6	45238	45243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336400
1012	NC_006814	GCA	2	6	45251	45256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336400
1013	NC_006814	TTTGC	2	10	45266	45275	0 %	60 %	20 %	20 %	58336400
1014	NC_006814	CCA	2	6	45292	45297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336400
1015	NC_006814	TTA	2	6	45417	45422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336400
1016	NC_006814	GATG	2	8	45460	45467	25 %	25 %	50 %	0 %	58336400
1017	NC_006814	ATT	2	6	45499	45504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336400
1018	NC_006814	ATC	2	6	45591	45596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336400
1019	NC_006814	A	7	7	45616	45622	100 %	0 %	0 %	0 %	58336400
1020	NC_006814	GAA	2	6	45647	45652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336400
1021	NC_006814	ATT	2	6	45657	45662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336400
1022	NC_006814	ATT	2	6	45687	45692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336400
1023	NC_006814	TAG	2	6	45697	45702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336400
1024	NC_006814	TGA	2	6	45718	45723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336400
1025	NC_006814	T	6	6	45731	45736	0 %	100 %	0 %	0 %	58336400
1026	NC_006814	AAT	2	6	45884	45889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336400
1027	NC_006814	AAG	2	6	45896	45901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336400
1028	NC_006814	TAG	2	6	45919	45924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_006814	T	6	6	45950	45955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_006814	AAT	2	6	45968	45973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006814	A	7	7	45979	45985	100 %	0 %	0 %	0 %	58336401
1032	NC_006814	ACT	2	6	46024	46029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336401
1033	NC_006814	TA	3	6	46046	46051	50 %	50 %	0 %	0 %	58336401
1034	NC_006814	T	6	6	46142	46147	0 %	100 %	0 %	0 %	58336401
1035	NC_006814	TGA	2	6	46163	46168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336401
1036	NC_006814	TTACT	2	10	46184	46193	20 %	60 %	0 %	20 %	58336401
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1039	NC_006814	TATT	2	8	46343	46350	25 %	75 %	0 %	0 %	58336401
1040	NC_006814	TAA	2	6	46356	46361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336401
1041	NC_006814	TAA	2	6	46380	46385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336401
1042	NC_006814	GAT	2	6	46399	46404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336401
1043	NC_006814	TGA	2	6	46449	46454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336401
1044	NC_006814	TGA	3	9	46482	46490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336401
1045	NC_006814	TTA	2	6	46492	46497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336401
1046	NC_006814	AT	3	6	46573	46578	50 %	50 %	0 %	0 %	58336401
1047	NC_006814	GCA	2	6	46669	46674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336401
1048	NC_006814	CA	3	6	46689	46694	50 %	0 %	0 %	50 %	58336401
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1050	NC_006814	TGA	2	6	46956	46961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336401
1051	NC_006814	CATG	2	8	46966	46973	25 %	25 %	25 %	25 %	58336401
1052	NC_006814	AGA	2	6	46995	47000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336401
1053	NC_006814	TA	3	6	47147	47152	50 %	50 %	0 %	0 %	58336401
1054	NC_006814	ATT	2	6	47161	47166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336401
1055	NC_006814	TTA	2	6	47224	47229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336401
1056	NC_006814	A	7	7	47243	47249	100 %	0 %	0 %	0 %	58336401
1057	NC_006814	GTG	2	6	47252	47257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336401
1058	NC_006814	TTA	2	6	47390	47395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336401
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1060	NC_006814	AAAT	2	8	47490	47497	75 %	25 %	0 %	0 %	58336401
1061	NC_006814	ATGA	2	8	47563	47570	50 %	25 %	25 %	0 %	58336401
1062	NC_006814	ATT	3	9	47626	47634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336401
1063	NC_006814	TGCCA	2	10	47732	47741	20 %	20 %	20 %	40 %	58336401
1064	NC_006814	A	6	6	47750	47755	100 %	0 %	0 %	0 %	58336401
1065	NC_006814	A	6	6	47762	47767	100 %	0 %	0 %	0 %	58336401
1066	NC_006814	GAAA	2	8	47933	47940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006814	TTTG	2	8	47947	47954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_006814	AAT	2	6	47958	47963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_006814	ATGG	2	8	48052	48059	25 %	25 %	50 %	0 %	58336402
1070	NC_006814	T	6	6	48063	48068	0 %	100 %	0 %	0 %	58336402
1071	NC_006814	ATA	2	6	48074	48079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336402
1072	NC_006814	A	6	6	48114	48119	100 %	0 %	0 %	0 %	58336402
1073	NC_006814	ACAA	2	8	48127	48134	75 %	0 %	0 %	25 %	58336402
1074	NC_006814	AATT	2	8	48164	48171	50 %	50 %	0 %	0 %	58336402
1075	NC_006814	ATT	2	6	48334	48339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336402
1076	NC_006814	CAT	2	6	48355	48360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336402
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1078	NC_006814	TAT	2	6	48412	48417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336402
1079	NC_006814	GTAAA	2	10	48419	48428	60 %	20 %	20 %	0 %	58336402
1080	NC_006814	CTG	2	6	48488	48493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336402
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1082	NC_006814	ATT	2	6	48511	48516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336402
1083	NC_006814	TAG	2	6	48561	48566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336402
1084	NC_006814	TAT	2	6	48637	48642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336402
1085	NC_006814	TGGTGA	2	12	48672	48683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58336402
1086	NC_006814	GCTAAT	2	12	48730	48741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58336402
1087	NC_006814	AAAGGC	2	12	48744	48755	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	58336402
1088	NC_006814	AAT	2	6	48781	48786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336402
1089	NC_006814	A	7	7	48833	48839	100 %	0 %	0 %	0 %	58336402
1090	NC_006814	GTA	2	6	48853	48858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_006814	TATT	2	8	48866	48873	25 %	75 %	0 %	0 %	58336403
1092	NC_006814	GTTG	2	8	48932	48939	0 %	50 %	50 %	0 %	58336403
1093	NC_006814	TAAT	2	8	48990	48997	50 %	50 %	0 %	0 %	58336403
1094	NC_006814	GAAC	2	8	49023	49030	50 %	0 %	25 %	25 %	58336403
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1099	NC_006814	ATG	2	6	49334	49339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336404
1100	NC_006814	AAAT	2	8	49371	49378	75 %	25 %	0 %	0 %	58336404
1101	NC_006814	TCT	2	6	49399	49404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336404
1102	NC_006814	AAG	2	6	49487	49492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336404
1103	NC_006814	GAA	2	6	49602	49607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336404
1104	NC_006814	T	6	6	49627	49632	0 %	100 %	0 %	0 %	58336404
1105	NC_006814	T	7	7	49692	49698	0 %	100 %	0 %	0 %	58336404
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1107	NC_006814	T	7	7	49807	49813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_006814	ATT	2	6	49815	49820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_006814	AAT	2	6	49824	49829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_006814	T	6	6	49833	49838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_006814	AGG	2	6	49900	49905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_006814	AGCA	2	8	49908	49915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_006814	GTT	2	6	50142	50147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336405
1114	NC_006814	AAC	2	6	50160	50165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336405
1115	NC_006814	AGT	2	6	50184	50189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336405
1116	NC_006814	GT	3	6	50200	50205	0 %	50 %	50 %	0 %	58336405
1117	NC_006814	CAA	2	6	50372	50377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336405
1118	NC_006814	GATT	2	8	50427	50434	25 %	50 %	25 %	0 %	58336405
1119	NC_006814	GTGAA	2	10	50475	50484	40 %	20 %	40 %	0 %	58336405
1120	NC_006814	GCTT	2	8	50494	50501	0 %	50 %	25 %	25 %	58336405
1121	NC_006814	TCA	2	6	50509	50514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336405
1122	NC_006814	GTA	2	6	50526	50531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336405
1123	NC_006814	CTT	2	6	50535	50540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336405
1124	NC_006814	CAA	2	6	50636	50641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336405
1125	NC_006814	AGC	2	6	50757	50762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336405
1126	NC_006814	TTG	2	6	50928	50933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336405
1127	NC_006814	ACA	3	9	50938	50946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336405
1128	NC_006814	CTTC	2	8	51026	51033	0 %	50 %	0 %	50 %	58336405
1129	NC_006814	TTC	2	6	51051	51056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336405
1130	NC_006814	TTA	2	6	51113	51118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336405
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1132	NC_006814	A	6	6	51182	51187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_006814	CAA	2	6	51312	51317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_006814	TTA	2	6	51359	51364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_006814	TAT	2	6	51403	51408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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