MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_006814	GAAGA	2	10	559775	559784	60 %	0 %	40 %	0 %	58336900
13003	NC_006814	A	6	6	559806	559811	100 %	0 %	0 %	0 %	58336900
13004	NC_006814	T	6	6	559861	559866	0 %	100 %	0 %	0 %	58336900
13005	NC_006814	GAA	2	6	559874	559879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336900
13006	NC_006814	TAAT	2	8	559885	559892	50 %	50 %	0 %	0 %	58336900
13007	NC_006814	A	6	6	559933	559938	100 %	0 %	0 %	0 %	58336901
13008	NC_006814	GCA	2	6	559948	559953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336901
13009	NC_006814	ATT	2	6	560074	560079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336901
13010	NC_006814	AAT	2	6	560085	560090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336901
13011	NC_006814	TAT	2	6	560119	560124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336901
13012	NC_006814	GCA	2	6	560125	560130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336901
13013	NC_006814	TTAA	2	8	560242	560249	50 %	50 %	0 %	0 %	58336901
13014	NC_006814	TTG	2	6	560318	560323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336901
13015	NC_006814	T	6	6	560333	560338	0 %	100 %	0 %	0 %	58336901
13016	NC_006814	TGG	2	6	560362	560367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336901
13017	NC_006814	GTAT	2	8	560409	560416	25 %	50 %	25 %	0 %	58336901
13018	NC_006814	CAA	2	6	560449	560454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336901
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13020	NC_006814	A	6	6	560542	560547	100 %	0 %	0 %	0 %	58336901
13021	NC_006814	AGAT	2	8	560562	560569	50 %	25 %	25 %	0 %	58336901
13022	NC_006814	AATT	2	8	560627	560634	50 %	50 %	0 %	0 %	58336901
13023	NC_006814	TTA	2	6	560645	560650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336901
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13027	NC_006814	TA	3	6	560728	560733	50 %	50 %	0 %	0 %	58336901
13028	NC_006814	CTT	2	6	560740	560745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336901
13029	NC_006814	ATG	2	6	560773	560778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336901
13030	NC_006814	AAG	2	6	560816	560821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336901
13031	NC_006814	TGGT	2	8	560975	560982	0 %	50 %	50 %	0 %	58336901
13032	NC_006814	TTG	2	6	560984	560989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336901
13033	NC_006814	AATT	2	8	561023	561030	50 %	50 %	0 %	0 %	58336901
13034	NC_006814	A	6	6	561075	561080	100 %	0 %	0 %	0 %	58336901
13035	NC_006814	TTTTG	2	10	561123	561132	0 %	80 %	20 %	0 %	58336901
13036	NC_006814	ATTTT	2	10	561142	561151	20 %	80 %	0 %	0 %	58336901
13037	NC_006814	AGC	2	6	561216	561221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336901
13038	NC_006814	AGA	2	6	561282	561287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336901
13039	NC_006814	AATTTT	2	12	561360	561371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336901
13040	NC_006814	GAT	2	6	561373	561378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336901
13041	NC_006814	AGAAA	2	10	561405	561414	80 %	0 %	20 %	0 %	58336901
13042	NC_006814	CAA	2	6	561418	561423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336901
13043	NC_006814	TAT	2	6	561459	561464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336901
13044	NC_006814	TTTTAG	2	12	561503	561514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58336901
13045	NC_006814	ATG	2	6	561515	561520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336901
13046	NC_006814	TTG	2	6	561527	561532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336901
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13050	NC_006814	TTA	2	6	561652	561657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336902
13051	NC_006814	ATT	3	9	561684	561692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336902
13052	NC_006814	GTT	2	6	561696	561701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336902
13053	NC_006814	GTG	2	6	561718	561723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336902
13054	NC_006814	GTT	2	6	561729	561734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336902
13055	NC_006814	TCTA	2	8	561809	561816	25 %	50 %	0 %	25 %	58336902
13056	NC_006814	TTC	2	6	561846	561851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336902
13057	NC_006814	CTA	2	6	561916	561921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336902
13058	NC_006814	GA	3	6	561929	561934	50 %	0 %	50 %	0 %	58336902
13059	NC_006814	TCA	2	6	561983	561988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336902
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13062	NC_006814	AAC	2	6	562047	562052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336902
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13074	NC_006814	ACTT	2	8	562518	562525	25 %	50 %	0 %	25 %	58336902
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13081	NC_006814	ATG	2	6	562819	562824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336902
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13088	NC_006814	TAG	2	6	563066	563071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336902
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13090	NC_006814	GATG	2	8	563204	563211	25 %	25 %	50 %	0 %	58336902
13091	NC_006814	AGATA	2	10	563273	563282	60 %	20 %	20 %	0 %	58336902
13092	NC_006814	GAA	2	6	563310	563315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336902
13093	NC_006814	TAC	2	6	563352	563357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336902
13094	NC_006814	AAT	2	6	563386	563391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336902
13095	NC_006814	T	6	6	563511	563516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_006814	TAGT	2	8	563537	563544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_006814	ATT	2	6	563594	563599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336903
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13101	NC_006814	GCT	2	6	563741	563746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336903
13102	NC_006814	ATT	2	6	563797	563802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336903
13103	NC_006814	TGG	2	6	563827	563832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336903
13104	NC_006814	A	7	7	563903	563909	100 %	0 %	0 %	0 %	58336903
13105	NC_006814	T	6	6	563954	563959	0 %	100 %	0 %	0 %	58336903
13106	NC_006814	CAT	2	6	563982	563987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336903
13107	NC_006814	ATG	2	6	564032	564037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336903
13108	NC_006814	TTTG	2	8	564100	564107	0 %	75 %	25 %	0 %	58336903
13109	NC_006814	A	6	6	564144	564149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_006814	TTTTA	2	10	564174	564183	20 %	80 %	0 %	0 %	58336904
13111	NC_006814	TAG	2	6	564204	564209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336904
13112	NC_006814	ATG	2	6	564254	564259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336904
13113	NC_006814	ATTG	2	8	564288	564295	25 %	50 %	25 %	0 %	58336904
13114	NC_006814	ATTA	2	8	564325	564332	50 %	50 %	0 %	0 %	58336904
13115	NC_006814	TCA	2	6	564395	564400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336904
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13117	NC_006814	CAG	2	6	564486	564491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336904
13118	NC_006814	AT	3	6	564538	564543	50 %	50 %	0 %	0 %	58336904
13119	NC_006814	CAAG	2	8	564591	564598	50 %	0 %	25 %	25 %	58336904
13120	NC_006814	GAT	2	6	564618	564623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336904
13121	NC_006814	TTCT	2	8	564639	564646	0 %	75 %	0 %	25 %	58336904
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13498	NC_006814	CCG	2	6	580823	580828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58336920
13499	NC_006814	ATC	2	6	580869	580874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336920
13500	NC_006814	T	7	7	580934	580940	0 %	100 %	0 %	0 %	58336920

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