MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12122	NC_006814	CGA	2	6	520482	520487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336857
12123	NC_006814	GAA	2	6	520668	520673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336857
12124	NC_006814	TGA	2	6	520719	520724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336857
12125	NC_006814	GGC	2	6	520783	520788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336857
12126	NC_006814	AGG	2	6	520793	520798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336857
12127	NC_006814	GAA	2	6	520869	520874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336858
12128	NC_006814	ATCA	2	8	520901	520908	50 %	25 %	0 %	25 %	58336858
12129	NC_006814	GTT	2	6	520968	520973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336858
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12132	NC_006814	AGGATG	2	12	521098	521109	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58336858
12133	NC_006814	CAG	2	6	521175	521180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336859
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12135	NC_006814	GAT	2	6	521255	521260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336859
12136	NC_006814	ACT	2	6	521283	521288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336859
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12155	NC_006814	TCA	2	6	522038	522043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336859
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12157	NC_006814	CGT	2	6	522155	522160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336859
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12194	NC_006814	GTT	2	6	523833	523838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336860
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12202	NC_006814	CAAT	2	8	524225	524232	50 %	25 %	0 %	25 %	58336861
12203	NC_006814	AGT	2	6	524235	524240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336861
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12208	NC_006814	GAAGT	2	10	524485	524494	40 %	20 %	40 %	0 %	58336861
12209	NC_006814	GCA	2	6	524509	524514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336861
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12214	NC_006814	ATG	2	6	524725	524730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336861
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12216	NC_006814	TGA	2	6	524766	524771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336861
12217	NC_006814	CAT	2	6	524778	524783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336861
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12219	NC_006814	TAAAA	2	10	524943	524952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12220	NC_006814	TA	3	6	524979	524984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12221	NC_006814	TAAGAA	2	12	525041	525052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58336862
12222	NC_006814	CAT	2	6	525157	525162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336862
12223	NC_006814	ACA	2	6	525186	525191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336862
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12225	NC_006814	AATG	2	8	525206	525213	50 %	25 %	25 %	0 %	58336862
12226	NC_006814	GCT	2	6	525273	525278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336863
12227	NC_006814	GTT	2	6	525296	525301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336863
12228	NC_006814	TCT	2	6	525308	525313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336863
12229	NC_006814	GTA	2	6	525393	525398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336863
12230	NC_006814	AGCA	2	8	525402	525409	50 %	0 %	25 %	25 %	58336863
12231	NC_006814	ATC	2	6	525442	525447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336863
12232	NC_006814	AACA	2	8	525516	525523	75 %	0 %	0 %	25 %	58336863
12233	NC_006814	GCA	2	6	525592	525597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336863
12234	NC_006814	GAC	2	6	525680	525685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336863
12235	NC_006814	ATT	2	6	525711	525716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336863
12236	NC_006814	TA	3	6	525741	525746	50 %	50 %	0 %	0 %	58336863
12237	NC_006814	TATT	2	8	525755	525762	25 %	75 %	0 %	0 %	58336863
12238	NC_006814	TAAG	2	8	525832	525839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12239	NC_006814	TGA	3	9	525869	525877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336864
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12367	NC_006814	TAAGGG	2	12	531554	531565	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58336868
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12488	NC_006814	ATG	2	6	537724	537729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336877
12489	NC_006814	CCA	2	6	537738	537743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336877
12490	NC_006814	ATG	2	6	537744	537749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336877
12491	NC_006814	TTGA	2	8	537803	537810	25 %	50 %	25 %	0 %	58336877
12492	NC_006814	AAG	2	6	537817	537822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336877
12493	NC_006814	CTT	2	6	537840	537845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336877
12494	NC_006814	GTT	2	6	537865	537870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336877
12495	NC_006814	AAAG	2	8	537970	537977	75 %	0 %	25 %	0 %	58336877
12496	NC_006814	GAA	2	6	538080	538085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12497	NC_006814	TCA	2	6	538088	538093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12498	NC_006814	CTTG	2	8	538107	538114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12499	NC_006814	CTTGG	2	10	538123	538132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12500	NC_006814	ATC	2	6	538135	538140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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