MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_005362	TA	3	6	1851879	1851884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43002	NC_005362	TAT	2	6	1851901	1851906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43003	NC_005362	TAT	2	6	1851927	1851932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_005362	AAAAGA	2	12	1851959	1851970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43005	NC_005362	TAG	2	6	1851990	1851995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_005362	TTTA	2	8	1852005	1852012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43007	NC_005362	ATT	2	6	1852017	1852022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43008	NC_005362	TAC	2	6	1852027	1852032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519797
43009	NC_005362	TCT	2	6	1852084	1852089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519797
43010	NC_005362	A	6	6	1852151	1852156	100 %	0 %	0 %	0 %	42519797
43011	NC_005362	AGC	2	6	1852180	1852185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519797
43012	NC_005362	TGA	2	6	1852240	1852245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519797
43013	NC_005362	AAT	2	6	1852260	1852265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519797
43014	NC_005362	TAA	2	6	1852299	1852304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519797
43015	NC_005362	TC	3	6	1852371	1852376	0 %	50 %	0 %	50 %	42519797
43016	NC_005362	A	6	6	1852504	1852509	100 %	0 %	0 %	0 %	42519797
43017	NC_005362	ATCA	2	8	1852536	1852543	50 %	25 %	0 %	25 %	42519797
43018	NC_005362	T	6	6	1852553	1852558	0 %	100 %	0 %	0 %	42519797
43019	NC_005362	TAT	2	6	1852562	1852567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519797
43020	NC_005362	TTG	2	6	1852710	1852715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519797
43021	NC_005362	ATC	2	6	1852726	1852731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519797
43022	NC_005362	AGC	2	6	1852734	1852739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519797
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43025	NC_005362	AATA	2	8	1852804	1852811	75 %	25 %	0 %	0 %	42519797
43026	NC_005362	TAG	2	6	1852865	1852870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519797
43027	NC_005362	ATT	2	6	1852923	1852928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43028	NC_005362	TAA	2	6	1852950	1852955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519798
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43036	NC_005362	ATT	2	6	1853247	1853252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519798
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43039	NC_005362	TCT	2	6	1853308	1853313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519798
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43044	NC_005362	AGCC	2	8	1853556	1853563	25 %	0 %	25 %	50 %	42519798
43045	NC_005362	GTA	2	6	1853626	1853631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519798
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43051	NC_005362	A	6	6	1853859	1853864	100 %	0 %	0 %	0 %	42519799
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43055	NC_005362	T	7	7	1854169	1854175	0 %	100 %	0 %	0 %	42519799
43056	NC_005362	TGCT	2	8	1854184	1854191	0 %	50 %	25 %	25 %	42519799
43057	NC_005362	T	6	6	1854281	1854286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43058	NC_005362	A	6	6	1854295	1854300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43059	NC_005362	TAG	2	6	1854316	1854321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43061	NC_005362	TGC	2	6	1854360	1854365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519800
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43121	NC_005362	TGA	2	6	1857061	1857066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519803
43122	NC_005362	ACC	2	6	1857114	1857119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42519803
43123	NC_005362	AAC	2	6	1857143	1857148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42519803
43124	NC_005362	TTG	2	6	1857156	1857161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519803
43125	NC_005362	TAT	2	6	1857178	1857183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519803
43126	NC_005362	A	6	6	1857264	1857269	100 %	0 %	0 %	0 %	42519803
43127	NC_005362	T	6	6	1857281	1857286	0 %	100 %	0 %	0 %	42519803
43128	NC_005362	T	6	6	1857340	1857345	0 %	100 %	0 %	0 %	42519804
43129	NC_005362	ATT	2	6	1857347	1857352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519804
43130	NC_005362	CTTC	2	8	1857363	1857370	0 %	50 %	0 %	50 %	42519804
43131	NC_005362	TTA	2	6	1857393	1857398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519804
43132	NC_005362	TCA	2	6	1857519	1857524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519804
43133	NC_005362	T	6	6	1857635	1857640	0 %	100 %	0 %	0 %	42519804
43134	NC_005362	TCG	2	6	1857687	1857692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519804
43135	NC_005362	ATC	2	6	1857731	1857736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519804
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43141	NC_005362	CTT	2	6	1858007	1858012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519804
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43149	NC_005362	CAG	3	9	1858237	1858245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519804
43150	NC_005362	AATT	2	8	1858250	1858257	50 %	50 %	0 %	0 %	42519804
43151	NC_005362	TTG	2	6	1858321	1858326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519804
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43153	NC_005362	TAA	2	6	1858447	1858452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519804
43154	NC_005362	CTA	2	6	1858455	1858460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519804
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43158	NC_005362	T	6	6	1858647	1858652	0 %	100 %	0 %	0 %	42519804
43159	NC_005362	TCA	2	6	1858759	1858764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519804
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43163	NC_005362	TAT	2	6	1858988	1858993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519805
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43165	NC_005362	TGT	2	6	1859050	1859055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519805
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43172	NC_005362	CAAA	2	8	1859532	1859539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43173	NC_005362	A	7	7	1859537	1859543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43174	NC_005362	AAT	2	6	1859592	1859597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519806
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43221	NC_005362	TTTAC	2	10	1861422	1861431	20 %	60 %	0 %	20 %	42519806
43222	NC_005362	AGC	2	6	1861472	1861477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519806
43223	NC_005362	CTA	2	6	1861480	1861485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519806
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43225	NC_005362	TGTC	2	8	1861540	1861547	0 %	50 %	25 %	25 %	42519806
43226	NC_005362	TCC	2	6	1861548	1861553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43227	NC_005362	TAT	2	6	1861588	1861593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43228	NC_005362	A	6	6	1861631	1861636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43229	NC_005362	TAT	2	6	1861640	1861645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43230	NC_005362	T	6	6	1861667	1861672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43231	NC_005362	TA	3	6	1861734	1861739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43232	NC_005362	ATGGA	2	10	1861776	1861785	40 %	20 %	40 %	0 %	42519807
43233	NC_005362	AAC	2	6	1861792	1861797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42519807
43234	NC_005362	TTA	2	6	1861833	1861838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519807
43235	NC_005362	TCAAGC	2	12	1861844	1861855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42519807
43236	NC_005362	CCAC	2	8	1861889	1861896	25 %	0 %	0 %	75 %	42519807
43237	NC_005362	TAT	2	6	1861932	1861937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519807
43238	NC_005362	ATG	2	6	1862113	1862118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519807
43239	NC_005362	ATT	2	6	1862282	1862287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519807
43240	NC_005362	ATG	2	6	1862293	1862298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519807
43241	NC_005362	CTAAGA	2	12	1862332	1862343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42519807
43242	NC_005362	ACTTAG	2	12	1862401	1862412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	42519807
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43249	NC_005362	TCA	2	6	1863121	1863126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519807
43250	NC_005362	GTC	2	6	1863133	1863138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519807
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43252	NC_005362	A	6	6	1863178	1863183	100 %	0 %	0 %	0 %	42519807
43253	NC_005362	GAC	2	6	1863214	1863219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519807
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43256	NC_005362	GCT	2	6	1863290	1863295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519808
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43260	NC_005362	A	6	6	1863355	1863360	100 %	0 %	0 %	0 %	42519808
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43279	NC_005362	T	6	6	1864273	1864278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43354	NC_005362	ATC	2	6	1867576	1867581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519812
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43356	NC_005362	TCT	2	6	1867602	1867607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519812
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43477	NC_005362	CAT	2	6	1872718	1872723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519816
43478	NC_005362	AAT	2	6	1872725	1872730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519816
43479	NC_005362	AAT	2	6	1872749	1872754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519816
43480	NC_005362	ACTT	2	8	1872781	1872788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43481	NC_005362	TACAT	2	10	1872810	1872819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43482	NC_005362	TAA	2	6	1872888	1872893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43483	NC_005362	AATT	2	8	1872920	1872927	50 %	50 %	0 %	0 %	42519817
43484	NC_005362	TTA	2	6	1872933	1872938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519817
43485	NC_005362	ACA	2	6	1873032	1873037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42519817
43486	NC_005362	TAA	2	6	1873043	1873048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519817
43487	NC_005362	TGCAAA	2	12	1873052	1873063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42519817
43488	NC_005362	AG	3	6	1873081	1873086	50 %	0 %	50 %	0 %	42519817
43489	NC_005362	ATT	2	6	1873121	1873126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519817
43490	NC_005362	T	6	6	1873125	1873130	0 %	100 %	0 %	0 %	42519817
43491	NC_005362	AGA	2	6	1873187	1873192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42519817
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43496	NC_005362	CAG	2	6	1873447	1873452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519817
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43499	NC_005362	AATT	2	8	1873643	1873650	50 %	50 %	0 %	0 %	42519817
43500	NC_005362	AAT	2	6	1873673	1873678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519817

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