MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_005362	ACC	2	6	1421784	1421789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42519419
33003	NC_005362	CCATT	2	10	1421792	1421801	20 %	40 %	0 %	40 %	42519419
33004	NC_005362	GCTTCT	2	12	1421905	1421916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	42519419
33005	NC_005362	T	6	6	1421922	1421927	0 %	100 %	0 %	0 %	42519419
33006	NC_005362	AAGT	2	8	1421933	1421940	50 %	25 %	25 %	0 %	42519419
33007	NC_005362	CGA	2	6	1421947	1421952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519419
33008	NC_005362	ATC	2	6	1421955	1421960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519419
33009	NC_005362	ATC	2	6	1421979	1421984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519419
33010	NC_005362	AATT	2	8	1422006	1422013	50 %	50 %	0 %	0 %	42519419
33011	NC_005362	TTC	2	6	1422237	1422242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519420
33012	NC_005362	CTA	2	6	1422296	1422301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519420
33013	NC_005362	CAT	2	6	1422323	1422328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519420
33014	NC_005362	TTA	2	6	1422418	1422423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519420
33015	NC_005362	TTC	2	6	1422450	1422455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519420
33016	NC_005362	ATT	2	6	1422459	1422464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519420
33017	NC_005362	T	7	7	1422479	1422485	0 %	100 %	0 %	0 %	42519420
33018	NC_005362	TAACTT	2	12	1422535	1422546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42519421
33019	NC_005362	TCA	2	6	1422548	1422553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519421
33020	NC_005362	ATC	2	6	1422643	1422648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519421
33021	NC_005362	TTG	2	6	1422652	1422657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519421
33022	NC_005362	AAAT	2	8	1422712	1422719	75 %	25 %	0 %	0 %	42519421
33023	NC_005362	TAC	2	6	1422724	1422729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519421
33024	NC_005362	GATG	2	8	1422855	1422862	25 %	25 %	50 %	0 %	42519421
33025	NC_005362	TTG	2	6	1422874	1422879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519421
33026	NC_005362	TTG	2	6	1422883	1422888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42519421
33027	NC_005362	GCA	2	6	1422977	1422982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519421
33028	NC_005362	CTG	2	6	1423047	1423052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519421
33029	NC_005362	CAG	2	6	1423053	1423058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42519421
33030	NC_005362	GCT	2	6	1423067	1423072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519421
33031	NC_005362	ACTGA	2	10	1423121	1423130	40 %	20 %	20 %	20 %	42519421
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33033	NC_005362	TCT	2	6	1423193	1423198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519421
33034	NC_005362	ACA	2	6	1423226	1423231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42519421
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33043	NC_005362	CTG	2	6	1423515	1423520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519421
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33051	NC_005362	TTAG	2	8	1424073	1424080	25 %	50 %	25 %	0 %	42519422
33052	NC_005362	T	6	6	1424091	1424096	0 %	100 %	0 %	0 %	42519422
33053	NC_005362	AAT	2	6	1424180	1424185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519422
33054	NC_005362	ATA	2	6	1424216	1424221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519422
33055	NC_005362	GAG	2	6	1424365	1424370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42519422
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33058	NC_005362	T	6	6	1424495	1424500	0 %	100 %	0 %	0 %	42519422
33059	NC_005362	AAAT	2	8	1424523	1424530	75 %	25 %	0 %	0 %	42519422
33060	NC_005362	ATC	2	6	1424543	1424548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519422
33061	NC_005362	T	7	7	1424597	1424603	0 %	100 %	0 %	0 %	42519422
33062	NC_005362	TCT	2	6	1424607	1424612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519422
33063	NC_005362	T	6	6	1424660	1424665	0 %	100 %	0 %	0 %	42519422
33064	NC_005362	A	7	7	1424682	1424688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33065	NC_005362	TTAG	2	8	1424711	1424718	25 %	50 %	25 %	0 %	42519423
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33071	NC_005362	TCA	2	6	1424935	1424940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519423
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33092	NC_005362	GAAC	2	8	1426023	1426030	50 %	0 %	25 %	25 %	42519425
33093	NC_005362	CAA	2	6	1426069	1426074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42519425
33094	NC_005362	TTAT	2	8	1426169	1426176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33101	NC_005362	T	6	6	1426579	1426584	0 %	100 %	0 %	0 %	42519426
33102	NC_005362	CAATTA	2	12	1426663	1426674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42519426
33103	NC_005362	ATT	2	6	1426743	1426748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519426
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33109	NC_005362	GCT	2	6	1427044	1427049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519426
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33112	NC_005362	TGCT	2	8	1427258	1427265	0 %	50 %	25 %	25 %	42519426
33113	NC_005362	TAG	2	6	1427281	1427286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42519426
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33117	NC_005362	A	7	7	1427363	1427369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33118	NC_005362	ATT	2	6	1427410	1427415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519427
33119	NC_005362	CTT	2	6	1427419	1427424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42519427
33120	NC_005362	AAC	2	6	1427477	1427482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42519427
33121	NC_005362	CAAA	2	8	1427497	1427504	75 %	0 %	0 %	25 %	42519427
33122	NC_005362	GTC	2	6	1427507	1427512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519427
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33144	NC_005362	CGC	2	6	1428071	1428076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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33147	NC_005362	AAG	2	6	1428240	1428245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33212	NC_005362	TATT	2	8	1430672	1430679	25 %	75 %	0 %	0 %	42519432
33213	NC_005362	AAT	2	6	1430685	1430690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519432
33214	NC_005362	TCG	2	6	1430788	1430793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42519432
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33216	NC_005362	CTTA	2	8	1430856	1430863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33217	NC_005362	TAT	2	6	1430873	1430878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33218	NC_005362	TAA	2	6	1430886	1430891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33219	NC_005362	ATTCA	2	10	1430893	1430902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33220	NC_005362	AT	3	6	1430934	1430939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33221	NC_005362	A	6	6	1430947	1430952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33222	NC_005362	GAA	2	6	1430999	1431004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33223	NC_005362	AGA	2	6	1431061	1431066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33224	NC_005362	A	6	6	1431071	1431076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33225	NC_005362	A	7	7	1431093	1431099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33226	NC_005362	T	6	6	1431127	1431132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33227	NC_005362	ATTT	2	8	1431133	1431140	25 %	75 %	0 %	0 %	42519433
33228	NC_005362	T	6	6	1431138	1431143	0 %	100 %	0 %	0 %	42519433
33229	NC_005362	AAT	2	6	1431198	1431203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519433
33230	NC_005362	AAT	2	6	1431210	1431215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519433
33231	NC_005362	ATT	2	6	1431262	1431267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519433
33232	NC_005362	ACTTAA	2	12	1431299	1431310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42519433
33233	NC_005362	TAAAA	2	10	1431345	1431354	80 %	20 %	0 %	0 %	42519433
33234	NC_005362	A	6	6	1431456	1431461	100 %	0 %	0 %	0 %	42519433
33235	NC_005362	AAAC	2	8	1431470	1431477	75 %	0 %	0 %	25 %	42519433
33236	NC_005362	TTA	2	6	1431506	1431511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519433
33237	NC_005362	TAA	2	6	1431590	1431595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42519434
33238	NC_005362	TCA	2	6	1431656	1431661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519434
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33240	NC_005362	TCC	2	6	1431727	1431732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33356	NC_005362	CAATT	2	10	1436207	1436216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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33359	NC_005362	CAA	2	6	1436258	1436263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33475	NC_005362	GT	3	6	1440675	1440680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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33488	NC_005362	CTTT	2	8	1441152	1441159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33489	NC_005362	AGAA	2	8	1441177	1441184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33490	NC_005362	TTAT	2	8	1441205	1441212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33491	NC_005362	TAT	2	6	1441256	1441261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42519446
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33493	NC_005362	CAT	2	6	1441353	1441358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42519446
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