MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8005	NC_005362	TGG	2	6	344551	344556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518398
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8009	NC_005362	GTAT	2	8	344835	344842	25 %	50 %	25 %	0 %	42518398
8010	NC_005362	AT	3	6	344863	344868	50 %	50 %	0 %	0 %	42518398
8011	NC_005362	TAT	2	6	344963	344968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518398
8012	NC_005362	TAT	2	6	345009	345014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518398
8013	NC_005362	TAC	2	6	345056	345061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518398
8014	NC_005362	GAA	2	6	345066	345071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518398
8015	NC_005362	GAT	2	6	345145	345150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518398
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8018	NC_005362	GAT	2	6	345332	345337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518398
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8022	NC_005362	TGAA	2	8	345531	345538	50 %	25 %	25 %	0 %	42518399
8023	NC_005362	A	7	7	345587	345593	100 %	0 %	0 %	0 %	42518399
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8029	NC_005362	TGT	2	6	345979	345984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518399
8030	NC_005362	TGA	2	6	345991	345996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518399
8031	NC_005362	AAGAA	2	10	346035	346044	80 %	0 %	20 %	0 %	42518399
8032	NC_005362	TTG	2	6	346101	346106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518399
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8046	NC_005362	ATGA	2	8	346511	346518	50 %	25 %	25 %	0 %	42518399
8047	NC_005362	GTT	2	6	346564	346569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518399
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8108	NC_005362	A	6	6	349912	349917	100 %	0 %	0 %	0 %	42518404
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8119	NC_005362	GAT	2	6	350517	350522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518404
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8121	NC_005362	TAA	2	6	350618	350623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518405
8122	NC_005362	GTA	2	6	350698	350703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518405
8123	NC_005362	A	6	6	350718	350723	100 %	0 %	0 %	0 %	42518405
8124	NC_005362	TTA	2	6	350731	350736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518405
8125	NC_005362	TAAC	2	8	350788	350795	50 %	25 %	0 %	25 %	42518405
8126	NC_005362	GAT	2	6	350930	350935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518406
8127	NC_005362	GAAT	2	8	350979	350986	50 %	25 %	25 %	0 %	42518406
8128	NC_005362	TGG	2	6	350998	351003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518406
8129	NC_005362	TGA	2	6	351344	351349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518407
8130	NC_005362	TGAAG	2	10	351404	351413	40 %	20 %	40 %	0 %	42518407
8131	NC_005362	TGG	2	6	351441	351446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518407
8132	NC_005362	TAT	2	6	351533	351538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518407
8133	NC_005362	AGAC	2	8	351543	351550	50 %	0 %	25 %	25 %	42518407
8134	NC_005362	TTC	2	6	351558	351563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518407
8135	NC_005362	TTGATC	2	12	351577	351588	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42518407
8136	NC_005362	AT	3	6	351597	351602	50 %	50 %	0 %	0 %	42518407
8137	NC_005362	TAAGAT	2	12	351611	351622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42518407
8138	NC_005362	ACT	2	6	351645	351650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518407
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8146	NC_005362	TCT	2	6	351894	351899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518408
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8150	NC_005362	TA	3	6	351958	351963	50 %	50 %	0 %	0 %	42518408
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8154	NC_005362	TTA	2	6	352163	352168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518409
8155	NC_005362	CAGGAA	2	12	352215	352226	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	42518409
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8157	NC_005362	A	6	6	352311	352316	100 %	0 %	0 %	0 %	42518409
8158	NC_005362	ACT	2	6	352325	352330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518409
8159	NC_005362	GAT	2	6	352337	352342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518409
8160	NC_005362	TA	3	6	352398	352403	50 %	50 %	0 %	0 %	42518409
8161	NC_005362	ACA	2	6	352509	352514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518409
8162	NC_005362	TGC	3	9	352591	352599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518409
8163	NC_005362	AGC	2	6	352603	352608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518409
8164	NC_005362	GTAA	2	8	352620	352627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8165	NC_005362	ACA	2	6	352672	352677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8166	NC_005362	CAA	3	9	352697	352705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518410
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8172	NC_005362	T	6	6	353007	353012	0 %	100 %	0 %	0 %	42518410
8173	NC_005362	AGA	2	6	353024	353029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518410
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8179	NC_005362	GAA	2	6	353397	353402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518411
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8186	NC_005362	TGA	2	6	353551	353556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
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8194	NC_005362	TCAG	2	8	353815	353822	25 %	25 %	25 %	25 %	42518412
8195	NC_005362	AAG	2	6	353856	353861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518412
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8198	NC_005362	ATG	2	6	353907	353912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
8199	NC_005362	TAA	2	6	353913	353918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
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8204	NC_005362	GTA	2	6	354216	354221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
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8207	NC_005362	TAA	2	6	354460	354465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
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8209	NC_005362	ATAC	2	8	354534	354541	50 %	25 %	0 %	25 %	42518412
8210	NC_005362	TTC	2	6	354574	354579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518412
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8215	NC_005362	ATG	2	6	354830	354835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
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8221	NC_005362	A	6	6	355130	355135	100 %	0 %	0 %	0 %	42518412
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8230	NC_005362	A	6	6	355571	355576	100 %	0 %	0 %	0 %	42518412
8231	NC_005362	TGT	2	6	355600	355605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518412
8232	NC_005362	TTA	2	6	355643	355648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518412
8233	NC_005362	TTCT	2	8	355663	355670	0 %	75 %	0 %	25 %	42518412
8234	NC_005362	AG	3	6	355786	355791	50 %	0 %	50 %	0 %	42518412
8235	NC_005362	TC	3	6	355829	355834	0 %	50 %	0 %	50 %	42518412
8236	NC_005362	AAT	2	6	355835	355840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
8237	NC_005362	CAT	2	6	355856	355861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518412
8238	NC_005362	CTA	2	6	355938	355943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518412
8239	NC_005362	AGTT	2	8	355944	355951	25 %	50 %	25 %	0 %	42518412
8240	NC_005362	TTG	2	6	355956	355961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518412
8241	NC_005362	TGA	2	6	355981	355986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
8242	NC_005362	AAT	2	6	356045	356050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
8243	NC_005362	TGA	2	6	356086	356091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
8244	NC_005362	ATT	2	6	356135	356140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518412
8245	NC_005362	AAG	2	6	356309	356314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518412
8246	NC_005362	GGAT	2	8	356389	356396	25 %	25 %	50 %	0 %	42518412
8247	NC_005362	GCT	3	9	356480	356488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518412
8248	NC_005362	TTC	2	6	356540	356545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518412
8249	NC_005362	TTA	2	6	356553	356558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518412
8250	NC_005362	CTAA	2	8	356609	356616	50 %	25 %	0 %	25 %	42518412
8251	NC_005362	ATC	3	9	356646	356654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518412
8252	NC_005362	CTA	2	6	356718	356723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518412
8253	NC_005362	GCT	2	6	356792	356797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518412
8254	NC_005362	TGA	2	6	356809	356814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
8255	NC_005362	TTA	2	6	356816	356821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518412
8256	NC_005362	TAAA	2	8	356937	356944	75 %	25 %	0 %	0 %	42518412
8257	NC_005362	GCTC	2	8	356990	356997	0 %	25 %	25 %	50 %	42518412
8258	NC_005362	TAA	2	6	357109	357114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
8259	NC_005362	AGA	2	6	357118	357123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518412
8260	NC_005362	TGG	2	6	357151	357156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518412
8261	NC_005362	TGG	2	6	357163	357168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518412
8262	NC_005362	ACA	2	6	357214	357219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518412
8263	NC_005362	TGGT	2	8	357274	357281	0 %	50 %	50 %	0 %	42518412
8264	NC_005362	CTT	2	6	357363	357368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518412
8265	NC_005362	TAA	2	6	357394	357399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
8266	NC_005362	A	6	6	357416	357421	100 %	0 %	0 %	0 %	42518412
8267	NC_005362	AAAG	2	8	357481	357488	75 %	0 %	25 %	0 %	42518412
8268	NC_005362	CTA	2	6	357591	357596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518412
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8270	NC_005362	AAAG	2	8	357616	357623	75 %	0 %	25 %	0 %	42518412
8271	NC_005362	TCT	2	6	357635	357640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518412
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8274	NC_005362	ATC	2	6	357805	357810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518412
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8276	NC_005362	AAG	2	6	357856	357861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518412
8277	NC_005362	GGA	2	6	357869	357874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518412
8278	NC_005362	CCAA	2	8	357876	357883	50 %	0 %	0 %	50 %	42518412
8279	NC_005362	GGAAT	2	10	358056	358065	40 %	20 %	40 %	0 %	42518412
8280	NC_005362	TGG	3	9	358186	358194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518412
8281	NC_005362	ACTT	2	8	358361	358368	25 %	50 %	0 %	25 %	42518412
8282	NC_005362	TGG	2	6	358441	358446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518412
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8285	NC_005362	TTG	2	6	358548	358553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518412
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8291	NC_005362	ATG	2	6	358712	358717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
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8293	NC_005362	TGG	2	6	358747	358752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518412
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8298	NC_005362	GCA	2	6	359039	359044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518412
8299	NC_005362	TGCT	2	8	359079	359086	0 %	50 %	25 %	25 %	42518412
8300	NC_005362	GTT	2	6	359177	359182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518412
8301	NC_005362	GAA	2	6	359211	359216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518412
8302	NC_005362	TGG	3	9	359251	359259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518412
8303	NC_005362	GGA	2	6	359354	359359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518412
8304	NC_005362	TAA	2	6	359428	359433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518412
8305	NC_005362	TGA	2	6	359473	359478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518412
8306	NC_005362	ATCA	2	8	359516	359523	50 %	25 %	0 %	25 %	42518412
8307	NC_005362	AGG	2	6	359556	359561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8311	NC_005362	TAG	2	6	359789	359794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518413
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8317	NC_005362	TAT	2	6	360232	360237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518414
8318	NC_005362	GAT	2	6	360404	360409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518414
8319	NC_005362	TTTA	2	8	360529	360536	25 %	75 %	0 %	0 %	42518414
8320	NC_005362	CAGT	2	8	360577	360584	25 %	25 %	25 %	25 %	42518414
8321	NC_005362	TGA	2	6	360685	360690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518414
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8328	NC_005362	TC	3	6	361002	361007	0 %	50 %	0 %	50 %	42518414
8329	NC_005362	ACC	2	6	361078	361083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518414
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8332	NC_005362	AAG	2	6	361224	361229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518414
8333	NC_005362	AAGA	2	8	361253	361260	75 %	0 %	25 %	0 %	42518414
8334	NC_005362	TAC	2	6	361351	361356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518414
8335	NC_005362	GTT	2	6	361367	361372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518414
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8337	NC_005362	A	6	6	361418	361423	100 %	0 %	0 %	0 %	42518414
8338	NC_005362	CAA	2	6	361472	361477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518414
8339	NC_005362	TCAA	2	8	361582	361589	50 %	25 %	0 %	25 %	42518414
8340	NC_005362	GAA	2	6	361636	361641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518414
8341	NC_005362	ACT	2	6	361760	361765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518414
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8344	NC_005362	GTG	2	6	361950	361955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518414
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8347	NC_005362	AT	3	6	362122	362127	50 %	50 %	0 %	0 %	42518414
8348	NC_005362	A	6	6	362186	362191	100 %	0 %	0 %	0 %	42518414
8349	NC_005362	ACTG	2	8	362303	362310	25 %	25 %	25 %	25 %	42518414
8350	NC_005362	CAA	2	6	362378	362383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518414
8351	NC_005362	TACTA	2	10	362393	362402	40 %	40 %	0 %	20 %	42518414
8352	NC_005362	A	6	6	362434	362439	100 %	0 %	0 %	0 %	42518414
8353	NC_005362	TCAAT	2	10	362448	362457	40 %	40 %	0 %	20 %	42518414
8354	NC_005362	ATT	2	6	362564	362569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518414
8355	NC_005362	ATA	2	6	362577	362582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518414
8356	NC_005362	GTG	2	6	362583	362588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518414
8357	NC_005362	TTA	2	6	362597	362602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518414
8358	NC_005362	TAA	2	6	362629	362634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518414
8359	NC_005362	T	6	6	362815	362820	0 %	100 %	0 %	0 %	42518414
8360	NC_005362	AGT	2	6	362837	362842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518414
8361	NC_005362	A	6	6	362847	362852	100 %	0 %	0 %	0 %	42518414
8362	NC_005362	GGAT	2	8	362891	362898	25 %	25 %	50 %	0 %	42518414
8363	NC_005362	TGA	2	6	362914	362919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518414
8364	NC_005362	GATA	2	8	362920	362927	50 %	25 %	25 %	0 %	42518414
8365	NC_005362	ACA	2	6	362957	362962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518414
8366	NC_005362	TGA	2	6	363007	363012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518414
8367	NC_005362	CTA	2	6	363072	363077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518414
8368	NC_005362	TCAA	2	8	363151	363158	50 %	25 %	0 %	25 %	42518414
8369	NC_005362	CTG	2	6	363204	363209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518414
8370	NC_005362	AAT	2	6	363242	363247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518414
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