MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_005362	AGC	2	6	300644	300649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518354
7002	NC_005362	AAT	2	6	300692	300697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518354
7003	NC_005362	TGG	2	6	300704	300709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518354
7004	NC_005362	ATT	2	6	300735	300740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
7005	NC_005362	TGCT	2	8	300826	300833	0 %	50 %	25 %	25 %	42518354
7006	NC_005362	TGC	2	6	300989	300994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518354
7007	NC_005362	GAT	2	6	301091	301096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518354
7008	NC_005362	TAC	2	6	301181	301186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518354
7009	NC_005362	TATT	2	8	301286	301293	25 %	75 %	0 %	0 %	42518354
7010	NC_005362	CAA	3	9	301306	301314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518354
7011	NC_005362	ATTT	2	8	301350	301357	25 %	75 %	0 %	0 %	42518354
7012	NC_005362	TAT	2	6	301359	301364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
7013	NC_005362	AAAG	2	8	301379	301386	75 %	0 %	25 %	0 %	42518354
7014	NC_005362	TGC	2	6	301409	301414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518354
7015	NC_005362	TATT	2	8	301435	301442	25 %	75 %	0 %	0 %	42518354
7016	NC_005362	TAT	2	6	301445	301450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
7017	NC_005362	TGG	2	6	301475	301480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518354
7018	NC_005362	TCT	2	6	301537	301542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518354
7019	NC_005362	CGG	2	6	301582	301587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518354
7020	NC_005362	A	6	6	301603	301608	100 %	0 %	0 %	0 %	42518354
7021	NC_005362	AAG	2	6	301617	301622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518354
7022	NC_005362	AAT	2	6	301697	301702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_005362	AAG	2	6	301773	301778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518355
7024	NC_005362	AGA	2	6	301837	301842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518355
7025	NC_005362	TTC	2	6	301891	301896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518355
7026	NC_005362	GCAA	2	8	301920	301927	50 %	0 %	25 %	25 %	42518355
7027	NC_005362	CAA	2	6	301963	301968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518355
7028	NC_005362	TAA	2	6	301994	301999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518355
7029	NC_005362	AGC	2	6	302020	302025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_005362	T	7	7	302042	302048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_005362	TAGG	2	8	302136	302143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_005362	ATTT	2	8	302148	302155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_005362	TGT	2	6	302236	302241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518356
7034	NC_005362	A	6	6	302357	302362	100 %	0 %	0 %	0 %	42518356
7035	NC_005362	TGT	2	6	302467	302472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518356
7036	NC_005362	TAA	2	6	302569	302574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518356
7037	NC_005362	GGAT	2	8	302643	302650	25 %	25 %	50 %	0 %	42518356
7038	NC_005362	TTC	2	6	302735	302740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518356
7039	NC_005362	TTTA	2	8	302807	302814	25 %	75 %	0 %	0 %	42518356
7040	NC_005362	AGA	2	6	302836	302841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518356
7041	NC_005362	AGA	3	9	302887	302895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518356
7042	NC_005362	GCC	2	6	303030	303035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42518356
7043	NC_005362	ATG	2	6	303048	303053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518356
7044	NC_005362	GAA	2	6	303109	303114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518356
7045	NC_005362	GAT	2	6	303140	303145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518356
7046	NC_005362	TGG	2	6	303214	303219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518356
7047	NC_005362	AGCT	2	8	303292	303299	25 %	25 %	25 %	25 %	42518356
7048	NC_005362	ATT	2	6	303311	303316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518356
7049	NC_005362	ATG	2	6	303357	303362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518356
7050	NC_005362	TTG	2	6	303366	303371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518356
7051	NC_005362	CAG	2	6	303381	303386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518356
7052	NC_005362	TAT	2	6	303398	303403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518356
7053	NC_005362	TGAT	2	8	303426	303433	25 %	50 %	25 %	0 %	42518356
7054	NC_005362	AGGA	2	8	303525	303532	50 %	0 %	50 %	0 %	42518356
7055	NC_005362	GAA	2	6	303605	303610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518357
7056	NC_005362	A	6	6	303627	303632	100 %	0 %	0 %	0 %	42518357
7057	NC_005362	CTG	2	6	303696	303701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518357
7058	NC_005362	ATTCA	2	10	303744	303753	40 %	40 %	0 %	20 %	42518357
7059	NC_005362	TAT	3	9	303757	303765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518357
7060	NC_005362	AAG	2	6	303798	303803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518357
7061	NC_005362	GTT	2	6	303805	303810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518357
7062	NC_005362	TGA	2	6	303823	303828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
7063	NC_005362	AGT	2	6	303844	303849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
7064	NC_005362	AAAC	2	8	303890	303897	75 %	0 %	0 %	25 %	42518357
7065	NC_005362	ATGA	2	8	304127	304134	50 %	25 %	25 %	0 %	42518357
7066	NC_005362	TAATT	2	10	304174	304183	40 %	60 %	0 %	0 %	42518357
7067	NC_005362	TGA	2	6	304297	304302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
7068	NC_005362	GCT	2	6	304337	304342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518357
7069	NC_005362	GAT	2	6	304624	304629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
7070	NC_005362	CCA	2	6	304640	304645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518357
7071	NC_005362	TGA	2	6	304648	304653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
7072	NC_005362	TAA	2	6	304684	304689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518357
7073	NC_005362	GAA	2	6	304733	304738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518357
7074	NC_005362	CTT	2	6	304748	304753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518357
7075	NC_005362	ATT	2	6	304758	304763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518357
7076	NC_005362	GATT	2	8	304768	304775	25 %	50 %	25 %	0 %	42518357
7077	NC_005362	GTAAAA	2	12	304820	304831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42518357
7078	NC_005362	TAA	2	6	304873	304878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518357
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7080	NC_005362	ATC	2	6	304929	304934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518357
7081	NC_005362	GGT	2	6	304955	304960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518357
7082	NC_005362	A	6	6	304985	304990	100 %	0 %	0 %	0 %	42518357
7083	NC_005362	T	6	6	305032	305037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_005362	TG	3	6	305055	305060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_005362	AAT	2	6	305068	305073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518358
7086	NC_005362	AGTTGA	2	12	305098	305109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518358
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7088	NC_005362	TGG	2	6	305221	305226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518358
7089	NC_005362	GAT	2	6	305315	305320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518358
7090	NC_005362	CA	3	6	305377	305382	50 %	0 %	0 %	50 %	42518358
7091	NC_005362	TGA	2	6	305383	305388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518358
7092	NC_005362	GGA	2	6	305416	305421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518358
7093	NC_005362	GTA	2	6	305458	305463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518359
7094	NC_005362	AGC	2	6	305607	305612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518359
7095	NC_005362	TTTTAG	2	12	305678	305689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42518359
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7097	NC_005362	TGC	2	6	305718	305723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518359
7098	NC_005362	AAG	2	6	305768	305773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518359
7099	NC_005362	GAA	2	6	305840	305845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518359
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7102	NC_005362	TGA	2	6	305955	305960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518359
7103	NC_005362	GCTT	2	8	306005	306012	0 %	50 %	25 %	25 %	42518359
7104	NC_005362	ATA	2	6	306041	306046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518359
7105	NC_005362	GCA	2	6	306049	306054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518359
7106	NC_005362	TTAG	2	8	306085	306092	25 %	50 %	25 %	0 %	42518359
7107	NC_005362	CTT	2	6	306122	306127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518359
7108	NC_005362	TCA	2	6	306216	306221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518359
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7110	NC_005362	ATT	2	6	306271	306276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518359
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7114	NC_005362	TTG	2	6	306362	306367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518359
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7117	NC_005362	GCTT	2	8	306514	306521	0 %	50 %	25 %	25 %	42518359
7118	NC_005362	AAGC	2	8	306592	306599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7119	NC_005362	T	6	6	306600	306605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_005362	CAA	2	6	306697	306702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518360
7121	NC_005362	CT	3	6	306709	306714	0 %	50 %	0 %	50 %	42518360
7122	NC_005362	ACG	2	6	306782	306787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518360
7123	NC_005362	AAC	2	6	306820	306825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518360
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7125	NC_005362	TTC	2	6	306989	306994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518360
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7251	NC_005362	GAA	2	6	312785	312790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518364
7252	NC_005362	TGA	2	6	312868	312873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518364
7253	NC_005362	GTT	2	6	312884	312889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518364
7254	NC_005362	GAA	2	6	312899	312904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518364
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7264	NC_005362	AATTT	2	10	313410	313419	40 %	60 %	0 %	0 %	42518364
7265	NC_005362	GAT	2	6	313436	313441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518364
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7269	NC_005362	AATT	2	8	313530	313537	50 %	50 %	0 %	0 %	42518364
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7281	NC_005362	GTG	2	6	314164	314169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7332	NC_005362	A	6	6	316115	316120	100 %	0 %	0 %	0 %	42518368
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7374	NC_005362	TGA	2	6	318105	318110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518369
7375	NC_005362	ATT	2	6	318163	318168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518369
7376	NC_005362	ATT	2	6	318219	318224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518369
7377	NC_005362	ATG	2	6	318248	318253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518369
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7382	NC_005362	AGA	2	6	318360	318365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518369
7383	NC_005362	TGA	2	6	318381	318386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518369
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7387	NC_005362	TGA	2	6	318441	318446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518369
7388	NC_005362	GAT	2	6	318469	318474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518369
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7391	NC_005362	A	7	7	318582	318588	100 %	0 %	0 %	0 %	42518370
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7399	NC_005362	GTTTAA	2	12	318955	318966	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518370
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7403	NC_005362	TCA	2	6	319249	319254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518370
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7405	NC_005362	CTTT	2	8	319320	319327	0 %	75 %	0 %	25 %	42518370
7406	NC_005362	ATT	2	6	319417	319422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518370
7407	NC_005362	TTG	2	6	319458	319463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518370
7408	NC_005362	TATT	2	8	319482	319489	25 %	75 %	0 %	0 %	42518370
7409	NC_005362	CTTTA	2	10	319490	319499	20 %	60 %	0 %	20 %	42518370
7410	NC_005362	AAAG	2	8	319520	319527	75 %	0 %	25 %	0 %	42518370
7411	NC_005362	T	6	6	319553	319558	0 %	100 %	0 %	0 %	42518370
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7419	NC_005362	TGC	2	6	319732	319737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518370
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7421	NC_005362	AGC	2	6	319762	319767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518370
7422	NC_005362	TA	3	6	319770	319775	50 %	50 %	0 %	0 %	42518370
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7425	NC_005362	TAT	2	6	319887	319892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518370
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7442	NC_005362	CAA	2	6	320744	320749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518370
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7445	NC_005362	AAT	2	6	320906	320911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518370
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7449	NC_005362	TCTA	2	8	321186	321193	25 %	50 %	0 %	25 %	42518370
7450	NC_005362	TAA	2	6	321226	321231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518370
7451	NC_005362	ATA	2	6	321292	321297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7475	NC_005362	TATT	2	8	322193	322200	25 %	75 %	0 %	0 %	42518371
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7479	NC_005362	A	7	7	322254	322260	100 %	0 %	0 %	0 %	42518371
7480	NC_005362	ATT	2	6	322267	322272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518371
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7483	NC_005362	ATCT	2	8	322321	322328	25 %	50 %	0 %	25 %	42518371
7484	NC_005362	GGA	2	6	322339	322344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518371
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7487	NC_005362	A	6	6	322441	322446	100 %	0 %	0 %	0 %	42518371
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