MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 46256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005362	AGA	2	6	233664	233669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5502	NC_005362	GAA	2	6	233671	233676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5503	NC_005362	TA	3	6	233705	233710	50 %	50 %	0 %	0 %	42518288
5504	NC_005362	GAT	3	9	233713	233721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518288
5505	NC_005362	CAT	2	6	233780	233785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518288
5506	NC_005362	CTT	2	6	233787	233792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518288
5507	NC_005362	TAC	2	6	233827	233832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518288
5508	NC_005362	GAAA	2	8	233871	233878	75 %	0 %	25 %	0 %	42518288
5509	NC_005362	TTA	2	6	233891	233896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518288
5510	NC_005362	AGA	2	6	233907	233912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5511	NC_005362	TGT	2	6	233973	233978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518288
5512	NC_005362	ATG	2	6	234038	234043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518288
5513	NC_005362	ATT	2	6	234045	234050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518288
5514	NC_005362	TATT	2	8	234111	234118	25 %	75 %	0 %	0 %	42518288
5515	NC_005362	TCTTCC	2	12	234144	234155	0 %	50 %	0 %	50 %	42518288
5516	NC_005362	GA	3	6	234189	234194	50 %	0 %	50 %	0 %	42518288
5517	NC_005362	TTA	2	6	234273	234278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518288
5518	NC_005362	TTG	2	6	234332	234337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518288
5519	NC_005362	TTAA	2	8	234466	234473	50 %	50 %	0 %	0 %	42518288
5520	NC_005362	TC	3	6	234527	234532	0 %	50 %	0 %	50 %	42518288
5521	NC_005362	AAAT	2	8	234570	234577	75 %	25 %	0 %	0 %	42518288
5522	NC_005362	AT	3	6	234576	234581	50 %	50 %	0 %	0 %	42518288
5523	NC_005362	TGA	2	6	234582	234587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518288
5524	NC_005362	GAA	2	6	234625	234630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5525	NC_005362	AAC	2	6	234725	234730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518288
5526	NC_005362	GAA	2	6	234744	234749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5527	NC_005362	TGA	2	6	234750	234755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518288
5528	NC_005362	GGC	2	6	234775	234780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518288
5529	NC_005362	ATG	2	6	234839	234844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518288
5530	NC_005362	GAA	2	6	234865	234870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5531	NC_005362	GAA	2	6	234873	234878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5532	NC_005362	AGA	3	9	234890	234898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5533	NC_005362	CAA	2	6	234907	234912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518288
5534	NC_005362	AGA	2	6	234915	234920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518288
5535	NC_005362	TGA	2	6	234936	234941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518288
5536	NC_005362	ATT	2	6	235008	235013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518288
5537	NC_005362	AACG	2	8	235042	235049	50 %	0 %	25 %	25 %	42518288
5538	NC_005362	TTG	2	6	235211	235216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518288
5539	NC_005362	AC	3	6	235272	235277	50 %	0 %	0 %	50 %	42518289
5540	NC_005362	ATG	2	6	235282	235287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518289
5541	NC_005362	AGA	2	6	235304	235309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518289
5542	NC_005362	AACG	2	8	235380	235387	50 %	0 %	25 %	25 %	42518289
5543	NC_005362	TTG	2	6	235429	235434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518289
5544	NC_005362	ATT	3	9	235540	235548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518289
5545	NC_005362	GA	3	6	235562	235567	50 %	0 %	50 %	0 %	42518289
5546	NC_005362	TGG	2	6	235697	235702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518289
5547	NC_005362	GAT	2	6	235760	235765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518289
5548	NC_005362	GAA	2	6	235965	235970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518289
5549	NC_005362	A	6	6	236023	236028	100 %	0 %	0 %	0 %	42518289
5550	NC_005362	GTT	2	6	236047	236052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518290
5551	NC_005362	GAT	2	6	236062	236067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518290
5552	NC_005362	T	6	6	236086	236091	0 %	100 %	0 %	0 %	42518290
5553	NC_005362	ATT	2	6	236182	236187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518290
5554	NC_005362	AGC	2	6	236238	236243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518290
5555	NC_005362	AAGC	2	8	236254	236261	50 %	0 %	25 %	25 %	42518290
5556	NC_005362	TTA	2	6	236264	236269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518290
5557	NC_005362	AAG	2	6	236276	236281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518290
5558	NC_005362	AAG	2	6	236330	236335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518290
5559	NC_005362	ATG	2	6	236534	236539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518290
5560	NC_005362	ATGC	2	8	236624	236631	25 %	25 %	25 %	25 %	42518291
5561	NC_005362	TAG	2	6	236658	236663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518291
5562	NC_005362	TTG	2	6	236685	236690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518291
5563	NC_005362	AGC	2	6	236692	236697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518291
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5565	NC_005362	A	6	6	236841	236846	100 %	0 %	0 %	0 %	42518291
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5569	NC_005362	TAC	2	6	236975	236980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518291
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5571	NC_005362	ATG	2	6	237044	237049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518291
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5577	NC_005362	CGT	2	6	237287	237292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518291
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5579	NC_005362	TAAAGA	2	12	237325	237336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42518291
5580	NC_005362	ATTA	2	8	237349	237356	50 %	50 %	0 %	0 %	42518291
5581	NC_005362	GAA	2	6	237389	237394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518291
5582	NC_005362	TCT	2	6	237427	237432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518291
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5585	NC_005362	TAG	4	12	237585	237596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518292
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5588	NC_005362	CGT	2	6	237623	237628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518292
5589	NC_005362	TGT	2	6	237664	237669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518292
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5591	NC_005362	TTA	2	6	237725	237730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518292
5592	NC_005362	TGA	2	6	237754	237759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518292
5593	NC_005362	TA	3	6	237829	237834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_005362	T	6	6	237959	237964	0 %	100 %	0 %	0 %	42518293
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5598	NC_005362	A	7	7	238105	238111	100 %	0 %	0 %	0 %	42518293
5599	NC_005362	CGC	2	6	238209	238214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42518293
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5605	NC_005362	GAAG	2	8	238460	238467	50 %	0 %	50 %	0 %	42518293
5606	NC_005362	GAA	2	6	238523	238528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518293
5607	NC_005362	TG	3	6	238563	238568	0 %	50 %	50 %	0 %	42518293
5608	NC_005362	AGT	2	6	238600	238605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518293
5609	NC_005362	TGA	2	6	238606	238611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518293
5610	NC_005362	TTAA	2	8	238622	238629	50 %	50 %	0 %	0 %	42518293
5611	NC_005362	CAGA	2	8	238691	238698	50 %	0 %	25 %	25 %	42518293
5612	NC_005362	GATA	2	8	238727	238734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_005362	AATA	2	8	238771	238778	75 %	25 %	0 %	0 %	42518294
5614	NC_005362	TGT	2	6	238779	238784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518294
5615	NC_005362	GCT	2	6	238792	238797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518294
5616	NC_005362	GCA	2	6	238882	238887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518294
5617	NC_005362	TGT	2	6	238917	238922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518294
5618	NC_005362	AG	3	6	238935	238940	50 %	0 %	50 %	0 %	42518294
5619	NC_005362	GTCA	2	8	238961	238968	25 %	25 %	25 %	25 %	42518294
5620	NC_005362	AGC	2	6	239016	239021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518294
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5622	NC_005362	TAA	2	6	239100	239105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518294
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5624	NC_005362	AG	3	6	239124	239129	50 %	0 %	50 %	0 %	42518294
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5751	NC_005362	AGA	2	6	244597	244602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518298
5752	NC_005362	AGA	2	6	244615	244620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518298
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