MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 7651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004343	AGC	2	6	304700	304705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217368
6502	NC_004343	GAA	2	6	304720	304725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217368
6503	NC_004343	A	6	6	304789	304794	100 %	0 %	0 %	0 %	24217368
6504	NC_004343	AAC	2	6	304823	304828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_004343	TTTGA	2	10	304873	304882	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_004343	AGA	2	6	304912	304917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_004343	AT	3	6	304929	304934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_004343	AGT	2	6	304942	304947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_004343	AGA	2	6	305089	305094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_004343	ATT	2	6	305148	305153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_004343	AAACAA	2	12	305205	305216	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6512	NC_004343	AATT	2	8	305224	305231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_004343	CAA	2	6	305235	305240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_004343	CTA	2	6	305295	305300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_004343	A	6	6	305334	305339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_004343	T	6	6	305343	305348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_004343	TACT	2	8	305377	305384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6518	NC_004343	CAAAAT	2	12	305386	305397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6519	NC_004343	AAAAT	2	10	305444	305453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_004343	CTGAA	2	10	305469	305478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6521	NC_004343	A	7	7	305484	305490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_004343	TAA	2	6	305538	305543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_004343	TATTT	2	10	305573	305582	20 %	80 %	0 %	0 %	294653525
6524	NC_004343	T	7	7	305595	305601	0 %	100 %	0 %	0 %	294653525
6525	NC_004343	CCG	2	6	305622	305627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294653525
6526	NC_004343	TAA	2	6	305701	305706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653525
6527	NC_004343	CTG	2	6	305730	305735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294653525
6528	NC_004343	TTG	2	6	305779	305784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653525
6529	NC_004343	TAA	2	6	305845	305850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653525
6530	NC_004343	GACC	2	8	305877	305884	25 %	0 %	25 %	50 %	294653525
6531	NC_004343	ACTT	2	8	305935	305942	25 %	50 %	0 %	25 %	294653525
6532	NC_004343	AAT	2	6	306143	306148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653525
6533	NC_004343	T	7	7	306166	306172	0 %	100 %	0 %	0 %	294653525
6534	NC_004343	GCA	2	6	306227	306232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294653525
6535	NC_004343	CAA	2	6	306235	306240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294653525
6536	NC_004343	CAC	2	6	306264	306269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294653525
6537	NC_004343	AGCAC	2	10	306290	306299	40 %	0 %	20 %	40 %	294653525
6538	NC_004343	TATT	2	8	306310	306317	25 %	75 %	0 %	0 %	294653525
6539	NC_004343	CTT	2	6	306351	306356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653525
6540	NC_004343	CTT	2	6	306401	306406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653525
6541	NC_004343	GAG	2	6	306432	306437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294653525
6542	NC_004343	ATGT	2	8	306442	306449	25 %	50 %	25 %	0 %	294653525
6543	NC_004343	T	8	8	306609	306616	0 %	100 %	0 %	0 %	294653525
6544	NC_004343	AC	3	6	306621	306626	50 %	0 %	0 %	50 %	294653525
6545	NC_004343	CTA	2	6	306651	306656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653525
6546	NC_004343	AAG	2	6	306805	306810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_004343	T	6	6	306855	306860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_004343	A	6	6	306863	306868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_004343	GAA	2	6	306933	306938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_004343	ATA	2	6	306944	306949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_004343	GAA	2	6	306991	306996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_004343	TAT	2	6	306997	307002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217371
6553	NC_004343	CAT	2	6	307023	307028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217371
6554	NC_004343	CTT	2	6	307046	307051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217371
6555	NC_004343	ATCCG	2	10	307071	307080	20 %	20 %	20 %	40 %	24217371
6556	NC_004343	GAA	2	6	307105	307110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217371
6557	NC_004343	ACA	2	6	307249	307254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217371
6558	NC_004343	AAC	2	6	307293	307298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217371
6559	NC_004343	T	9	9	307334	307342	0 %	100 %	0 %	0 %	24217371
6560	NC_004343	A	6	6	307408	307413	100 %	0 %	0 %	0 %	24217371
6561	NC_004343	CGAAT	2	10	307417	307426	40 %	20 %	20 %	20 %	24217371
6562	NC_004343	ATA	2	6	307479	307484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217371
6563	NC_004343	A	6	6	307620	307625	100 %	0 %	0 %	0 %	24217371
6564	NC_004343	TCCAA	2	10	307747	307756	40 %	20 %	0 %	40 %	24217371
6565	NC_004343	AGA	2	6	307762	307767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217371
6566	NC_004343	TCCC	2	8	307817	307824	0 %	25 %	0 %	75 %	24217371
6567	NC_004343	ATTTT	2	10	307835	307844	20 %	80 %	0 %	0 %	294653524
6568	NC_004343	CGC	2	6	307883	307888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294653524
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6570	NC_004343	ACT	2	6	308016	308021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653524
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6572	NC_004343	AAT	2	6	308078	308083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653524
6573	NC_004343	CTT	2	6	308131	308136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653524
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6576	NC_004343	ACAT	2	8	308330	308337	50 %	25 %	0 %	25 %	294653524
6577	NC_004343	CTT	2	6	308371	308376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653524
6578	NC_004343	TCC	2	6	308411	308416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653524
6579	NC_004343	TCA	2	6	308461	308466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653524
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6581	NC_004343	TCA	2	6	308515	308520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653524
6582	NC_004343	ACT	2	6	308523	308528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294653524
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6584	NC_004343	T	6	6	308578	308583	0 %	100 %	0 %	0 %	294653524
6585	NC_004343	A	6	6	308732	308737	100 %	0 %	0 %	0 %	24217373
6586	NC_004343	CAG	2	6	308752	308757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217373
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6591	NC_004343	ATCT	2	8	309080	309087	25 %	50 %	0 %	25 %	24217373
6592	NC_004343	GCA	2	6	309210	309215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217373
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6594	NC_004343	ATCGA	2	10	309291	309300	40 %	20 %	20 %	20 %	24217373
6595	NC_004343	CAT	2	6	309304	309309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217373
6596	NC_004343	TAAA	2	8	309326	309333	75 %	25 %	0 %	0 %	24217373
6597	NC_004343	GCCA	2	8	309374	309381	25 %	0 %	25 %	50 %	24217373
6598	NC_004343	AG	3	6	309452	309457	50 %	0 %	50 %	0 %	24217373
6599	NC_004343	CT	3	6	309566	309571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_004343	GAA	2	6	309608	309613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_004343	TGA	2	6	309675	309680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653596
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6603	NC_004343	CGC	2	6	309874	309879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294653596
6604	NC_004343	TCG	2	6	309919	309924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294653596
6605	NC_004343	ATG	2	6	309954	309959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653596
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6607	NC_004343	AGA	2	6	310058	310063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_004343	T	7	7	310101	310107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_004343	ATTTT	3	15	310125	310139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_004343	T	7	7	310136	310142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_004343	A	6	6	310180	310185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_004343	TTTTA	2	10	310314	310323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_004343	CTT	2	6	310577	310582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653523
6614	NC_004343	ACTTC	2	10	310625	310634	20 %	40 %	0 %	40 %	294653523
6615	NC_004343	CTT	2	6	310645	310650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653523
6616	NC_004343	GGA	2	6	310720	310725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294653523
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6618	NC_004343	CTT	2	6	310865	310870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653523
6619	NC_004343	T	6	6	310869	310874	0 %	100 %	0 %	0 %	294653523
6620	NC_004343	T	6	6	310894	310899	0 %	100 %	0 %	0 %	294653523
6621	NC_004343	CT	3	6	310935	310940	0 %	50 %	0 %	50 %	294653523
6622	NC_004343	ACGGG	2	10	310961	310970	20 %	0 %	60 %	20 %	294653523
6623	NC_004343	TTG	2	6	310974	310979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653523
6624	NC_004343	TTCC	2	8	311025	311032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6625	NC_004343	GTTTT	2	10	311038	311047	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_004343	TAA	2	6	311058	311063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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