MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 7651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004343	CCT	2	6	280956	280961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653534
6002	NC_004343	CTAC	2	8	281031	281038	25 %	25 %	0 %	50 %	294653534
6003	NC_004343	GAA	2	6	281049	281054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653534
6004	NC_004343	TTC	2	6	281084	281089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653534
6005	NC_004343	ATTC	2	8	281124	281131	25 %	50 %	0 %	25 %	294653534
6006	NC_004343	TAAA	2	8	281200	281207	75 %	25 %	0 %	0 %	294653534
6007	NC_004343	AATTTT	2	12	281483	281494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217342
6008	NC_004343	TTC	2	6	281524	281529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217342
6009	NC_004343	AATC	2	8	281575	281582	50 %	25 %	0 %	25 %	24217342
6010	NC_004343	AT	3	6	281602	281607	50 %	50 %	0 %	0 %	24217342
6011	NC_004343	TC	3	6	281617	281622	0 %	50 %	0 %	50 %	24217342
6012	NC_004343	GGTC	2	8	281645	281652	0 %	25 %	50 %	25 %	24217342
6013	NC_004343	AAG	2	6	281674	281679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217342
6014	NC_004343	ATC	2	6	281685	281690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217342
6015	NC_004343	ATT	2	6	281917	281922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217342
6016	NC_004343	AAG	2	6	281997	282002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217342
6017	NC_004343	TTA	2	6	282034	282039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_004343	CTCC	2	8	282108	282115	0 %	25 %	0 %	75 %	24217343
6019	NC_004343	GAA	2	6	282125	282130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217343
6020	NC_004343	TGG	2	6	282156	282161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217343
6021	NC_004343	TTC	2	6	282174	282179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217343
6022	NC_004343	CTT	2	6	282205	282210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217343
6023	NC_004343	A	7	7	282211	282217	100 %	0 %	0 %	0 %	24217343
6024	NC_004343	ATCAAT	2	12	282224	282235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	24217343
6025	NC_004343	TTC	2	6	282409	282414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217343
6026	NC_004343	TTTTA	2	10	282595	282604	20 %	80 %	0 %	0 %	24217344
6027	NC_004343	GAA	3	9	282650	282658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217344
6028	NC_004343	TCT	2	6	282662	282667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217344
6029	NC_004343	AGA	2	6	282700	282705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217344
6030	NC_004343	TCC	2	6	282709	282714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217344
6031	NC_004343	AAC	2	6	282730	282735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217344
6032	NC_004343	CCAA	2	8	282777	282784	50 %	0 %	0 %	50 %	24217344
6033	NC_004343	AGA	2	6	282790	282795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217344
6034	NC_004343	ATTT	2	8	282858	282865	25 %	75 %	0 %	0 %	24217344
6035	NC_004343	T	7	7	282919	282925	0 %	100 %	0 %	0 %	24217344
6036	NC_004343	CAG	2	6	282942	282947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217344
6037	NC_004343	GTC	2	6	282968	282973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217344
6038	NC_004343	GTT	2	6	282974	282979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217344
6039	NC_004343	TGA	2	6	283045	283050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217344
6040	NC_004343	AGC	2	6	283051	283056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217344
6041	NC_004343	TTTC	2	8	283137	283144	0 %	75 %	0 %	25 %	24217344
6042	NC_004343	AGA	2	6	283150	283155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217344
6043	NC_004343	AAT	2	6	283196	283201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_004343	CTTT	2	8	283250	283257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_004343	CA	3	6	283284	283289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_004343	A	6	6	283292	283297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_004343	CCAAT	2	10	283298	283307	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6048	NC_004343	AAG	2	6	283319	283324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_004343	GCT	2	6	283372	283377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_004343	TAG	2	6	283388	283393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_004343	A	6	6	283414	283419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_004343	TATT	2	8	283468	283475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_004343	GTTT	2	8	283507	283514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_004343	AAT	2	6	283550	283555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_004343	AAAT	2	8	283595	283602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_004343	TTAC	2	8	283634	283641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_004343	TATAAA	2	12	283652	283663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_004343	GTT	2	6	283675	283680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_004343	AATC	2	8	283717	283724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_004343	AGT	2	6	283816	283821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_004343	TCA	2	6	284005	284010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_004343	TGA	2	6	284022	284027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_004343	GTA	2	6	284083	284088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_004343	TAAA	2	8	284092	284099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_004343	ATC	2	6	284100	284105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_004343	T	6	6	284161	284166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_004343	ACT	2	6	284174	284179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_004343	AGA	2	6	284191	284196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_004343	GA	3	6	284195	284200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_004343	GATT	2	8	284318	284325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_004343	CTA	2	6	284336	284341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_004343	ATG	2	6	284367	284372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217346
6073	NC_004343	TTTC	2	8	284378	284385	0 %	75 %	0 %	25 %	24217346
6074	NC_004343	CAA	2	6	284404	284409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217346
6075	NC_004343	A	7	7	284408	284414	100 %	0 %	0 %	0 %	24217346
6076	NC_004343	CACAAA	2	12	284423	284434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217346
6077	NC_004343	TAT	2	6	284506	284511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217346
6078	NC_004343	A	9	9	284555	284563	100 %	0 %	0 %	0 %	24217346
6079	NC_004343	TGG	2	6	284605	284610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24217346
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6081	NC_004343	AAAG	2	8	284690	284697	75 %	0 %	25 %	0 %	24217346
6082	NC_004343	A	6	6	284715	284720	100 %	0 %	0 %	0 %	24217346
6083	NC_004343	T	6	6	284806	284811	0 %	100 %	0 %	0 %	24217346
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6086	NC_004343	CA	3	6	284941	284946	50 %	0 %	0 %	50 %	24217346
6087	NC_004343	ATC	2	6	285011	285016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217346
6088	NC_004343	TCTTT	2	10	285140	285149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6089	NC_004343	ATTT	2	8	285222	285229	25 %	75 %	0 %	0 %	294653533
6090	NC_004343	T	8	8	285275	285282	0 %	100 %	0 %	0 %	294653533
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6092	NC_004343	TGG	2	6	285338	285343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294653533
6093	NC_004343	AT	4	8	285354	285361	50 %	50 %	0 %	0 %	294653533
6094	NC_004343	AGG	2	6	285410	285415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294653533
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6098	NC_004343	A	6	6	285634	285639	100 %	0 %	0 %	0 %	294653533
6099	NC_004343	CGT	2	6	285657	285662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294653533
6100	NC_004343	TC	3	6	285688	285693	0 %	50 %	0 %	50 %	294653533
6101	NC_004343	A	6	6	285696	285701	100 %	0 %	0 %	0 %	294653533
6102	NC_004343	ATG	2	6	285730	285735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653533
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6105	NC_004343	A	6	6	285964	285969	100 %	0 %	0 %	0 %	294653533
6106	NC_004343	GAG	2	6	285995	286000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294653533
6107	NC_004343	GAAC	2	8	286146	286153	50 %	0 %	25 %	25 %	294653533
6108	NC_004343	CAA	2	6	286176	286181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294653533
6109	NC_004343	CGG	2	6	286206	286211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294653533
6110	NC_004343	ATG	2	6	286423	286428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653533
6111	NC_004343	AAG	2	6	286571	286576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653533
6112	NC_004343	CA	3	6	286587	286592	50 %	0 %	0 %	50 %	294653533
6113	NC_004343	GCA	2	6	286594	286599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294653533
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6117	NC_004343	GAAACA	2	12	286906	286917	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6118	NC_004343	T	6	6	286932	286937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_004343	AAC	2	6	286938	286943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_004343	GAT	2	6	286967	286972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_004343	A	6	6	287004	287009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_004343	A	7	7	287107	287113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_004343	TG	3	6	287116	287121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_004343	CTTTT	2	10	287150	287159	0 %	80 %	0 %	20 %	24217348
6125	NC_004343	GAA	2	6	287172	287177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217348
6126	NC_004343	GAA	2	6	287235	287240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217348
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6128	NC_004343	TA	3	6	287272	287277	50 %	50 %	0 %	0 %	24217348
6129	NC_004343	TGC	2	6	287297	287302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217348
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6241	NC_004343	GATTC	2	10	292771	292780	20 %	40 %	20 %	20 %	24217353
6242	NC_004343	CAAC	2	8	292803	292810	50 %	0 %	0 %	50 %	24217353
6243	NC_004343	AAG	2	6	292946	292951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217353
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6246	NC_004343	GTA	2	6	293051	293056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217353
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6248	NC_004343	T	6	6	293087	293092	0 %	100 %	0 %	0 %	24217353
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6250	NC_004343	T	7	7	293183	293189	0 %	100 %	0 %	0 %	24217354
6251	NC_004343	ATC	2	6	293190	293195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217354
6252	NC_004343	GAAAT	2	10	293230	293239	60 %	20 %	20 %	0 %	24217354
6253	NC_004343	ATCC	2	8	293300	293307	25 %	25 %	0 %	50 %	24217354
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