MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 93275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004342	CAA	2	6	601160	601165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_004342	TATAG	2	10	601181	601190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_004342	GTATA	2	10	601195	601204	40 %	40 %	20 %	0 %	24213292
13004	NC_004342	A	8	8	601272	601279	100 %	0 %	0 %	0 %	24213292
13005	NC_004342	GAT	2	6	601308	601313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213292
13006	NC_004342	GAT	2	6	601333	601338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213292
13007	NC_004342	AG	3	6	601425	601430	50 %	0 %	50 %	0 %	24213292
13008	NC_004342	AGA	2	6	601458	601463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213292
13009	NC_004342	AGA	2	6	601502	601507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_004342	GAAA	2	8	601517	601524	75 %	0 %	25 %	0 %	24213293
13011	NC_004342	AAG	2	6	601588	601593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213293
13012	NC_004342	TTA	2	6	601637	601642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213293
13013	NC_004342	AGA	2	6	601658	601663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213293
13014	NC_004342	A	7	7	601691	601697	100 %	0 %	0 %	0 %	24213293
13015	NC_004342	CAA	2	6	601721	601726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24213294
13016	NC_004342	A	7	7	601808	601814	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13017	NC_004342	AGAT	2	8	601863	601870	50 %	25 %	25 %	0 %	24213294
13018	NC_004342	T	6	6	601915	601920	0 %	100 %	0 %	0 %	24213294
13019	NC_004342	GTT	2	6	601934	601939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213294
13020	NC_004342	A	6	6	601973	601978	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13021	NC_004342	A	6	6	601985	601990	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13022	NC_004342	AAT	2	6	602063	602068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213294
13023	NC_004342	GTTT	2	8	602113	602120	0 %	75 %	25 %	0 %	24213294
13024	NC_004342	CCAAT	2	10	602129	602138	40 %	20 %	0 %	40 %	24213294
13025	NC_004342	CTT	2	6	602151	602156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213294
13026	NC_004342	GTT	2	6	602213	602218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213294
13027	NC_004342	ATTT	2	8	602260	602267	25 %	75 %	0 %	0 %	24213294
13028	NC_004342	TTG	2	6	602351	602356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213294
13029	NC_004342	A	7	7	602416	602422	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13030	NC_004342	TTGC	2	8	602462	602469	0 %	50 %	25 %	25 %	24213294
13031	NC_004342	GATTT	2	10	602483	602492	20 %	60 %	20 %	0 %	24213294
13032	NC_004342	AAT	2	6	602527	602532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213294
13033	NC_004342	AGA	2	6	602533	602538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213294
13034	NC_004342	CGA	2	6	602554	602559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24213294
13035	NC_004342	A	6	6	602592	602597	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13036	NC_004342	CTA	2	6	602946	602951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24213294
13037	NC_004342	AAT	2	6	603089	603094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213294
13038	NC_004342	TTAC	2	8	603095	603102	25 %	50 %	0 %	25 %	24213294
13039	NC_004342	CTG	2	6	603114	603119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24213294
13040	NC_004342	A	6	6	603170	603175	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13041	NC_004342	GGA	2	6	603218	603223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213294
13042	NC_004342	ATTG	2	8	603256	603263	25 %	50 %	25 %	0 %	24213294
13043	NC_004342	AG	3	6	603268	603273	50 %	0 %	50 %	0 %	24213294
13044	NC_004342	ATT	2	6	603274	603279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213294
13045	NC_004342	AGA	3	9	603334	603342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213294
13046	NC_004342	GTC	2	6	603353	603358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24213294
13047	NC_004342	ATTC	2	8	603377	603384	25 %	50 %	0 %	25 %	24213294
13048	NC_004342	TTC	2	6	603546	603551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213294
13049	NC_004342	A	6	6	603557	603562	100 %	0 %	0 %	0 %	24213294
13050	NC_004342	TGG	2	6	603609	603614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24213294
13051	NC_004342	CAG	2	6	603757	603762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24213294
13052	NC_004342	T	6	6	603790	603795	0 %	100 %	0 %	0 %	24213294
13053	NC_004342	ATA	2	6	603810	603815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213294
13054	NC_004342	TTCGGT	2	12	603886	603897	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	24213294
13055	NC_004342	GATT	2	8	603926	603933	25 %	50 %	25 %	0 %	24213294
13056	NC_004342	AT	3	6	603954	603959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_004342	A	6	6	603981	603986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_004342	A	7	7	603992	603998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_004342	TAA	2	6	603999	604004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_004342	ATG	2	6	604006	604011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_004342	ATGA	2	8	604047	604054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_004342	TAAT	2	8	604134	604141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_004342	TAT	2	6	604166	604171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_004342	TGT	2	6	604200	604205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_004342	CT	3	6	604283	604288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_004342	CTT	2	6	604360	604365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_004342	GTT	2	6	604459	604464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_004342	AATT	2	8	604537	604544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_004342	ACT	2	6	604550	604555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_004342	TAT	2	6	604557	604562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_004342	TTG	2	6	604574	604579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_004342	AGT	2	6	604607	604612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_004342	TAT	2	6	604625	604630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213295
13074	NC_004342	CTT	2	6	604644	604649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213295
13075	NC_004342	TATT	2	8	604694	604701	25 %	75 %	0 %	0 %	24213295
13076	NC_004342	TGA	2	6	604731	604736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213295
13077	NC_004342	A	6	6	604793	604798	100 %	0 %	0 %	0 %	24213295
13078	NC_004342	AGAT	2	8	604830	604837	50 %	25 %	25 %	0 %	24213295
13079	NC_004342	CTT	2	6	604863	604868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213295
13080	NC_004342	ATT	2	6	604898	604903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24213295
13081	NC_004342	T	6	6	604916	604921	0 %	100 %	0 %	0 %	24213295
13082	NC_004342	CGA	2	6	604953	604958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24213295
13083	NC_004342	T	7	7	605003	605009	0 %	100 %	0 %	0 %	24213295
13084	NC_004342	TACTT	2	10	605086	605095	20 %	60 %	0 %	20 %	24213295
13085	NC_004342	GT	3	6	605133	605138	0 %	50 %	50 %	0 %	24213295
13086	NC_004342	TTCTT	2	10	605171	605180	0 %	80 %	0 %	20 %	24213295
13087	NC_004342	TAA	2	6	605182	605187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24213295
13088	NC_004342	T	6	6	605218	605223	0 %	100 %	0 %	0 %	24213295
13089	NC_004342	TTCT	2	8	605310	605317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13090	NC_004342	TAT	2	6	605403	605408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_004342	ACT	2	6	605429	605434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_004342	ACT	2	6	605476	605481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_004342	TTA	2	6	605487	605492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_004342	T	6	6	605548	605553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_004342	T	6	6	605636	605641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_004342	ACA	2	6	605657	605662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_004342	T	7	7	605788	605794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_004342	T	7	7	605824	605830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_004342	TGAAT	2	10	606024	606033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_004342	A	8	8	606066	606073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_004342	TGT	2	6	606083	606088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_004342	TAA	2	6	606111	606116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_004342	AGA	2	6	606163	606168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827685
13104	NC_004342	ATTT	2	8	606366	606373	25 %	75 %	0 %	0 %	294827685
13105	NC_004342	TCA	2	6	606415	606420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827685
13106	NC_004342	A	6	6	606489	606494	100 %	0 %	0 %	0 %	294827685
13107	NC_004342	T	6	6	606544	606549	0 %	100 %	0 %	0 %	294827685
13108	NC_004342	TTCCAA	2	12	606557	606568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827685
13109	NC_004342	T	6	6	606577	606582	0 %	100 %	0 %	0 %	294827685
13110	NC_004342	AAGAG	2	10	606633	606642	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_004342	TTAA	2	8	606650	606657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_004342	ATT	2	6	606723	606728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_004342	GGA	2	6	606848	606853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213299
13114	NC_004342	ACG	2	6	606865	606870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24213299
13115	NC_004342	GAG	2	6	606883	606888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24213299
13116	NC_004342	ATG	2	6	606897	606902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213299
13117	NC_004342	TTC	2	6	606908	606913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213299
13118	NC_004342	GAT	2	6	606974	606979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24213299
13119	NC_004342	AT	3	6	606983	606988	50 %	50 %	0 %	0 %	24213299
13120	NC_004342	GTT	2	6	607052	607057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24213299
13121	NC_004342	GAA	2	6	607089	607094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213299
13122	NC_004342	GGAA	2	8	607174	607181	50 %	0 %	50 %	0 %	24213299
13123	NC_004342	GTAGA	2	10	607231	607240	40 %	20 %	40 %	0 %	24213299
13124	NC_004342	TTC	2	6	607244	607249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24213299
13125	NC_004342	GAA	2	6	607278	607283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24213299
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13127	NC_004342	CTG	2	6	607565	607570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24213299
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13252	NC_004342	AAG	2	6	612928	612933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827687
13253	NC_004342	A	7	7	612977	612983	100 %	0 %	0 %	0 %	294827687
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