MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 69257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45121	NC_003212	TTC	2	6	1949633	1949638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801000
45122	NC_003212	AC	3	6	1949650	1949655	50 %	0 %	0 %	50 %	16801000
45123	NC_003212	AATC	2	8	1949737	1949744	50 %	25 %	0 %	25 %	16801000
45124	NC_003212	ATC	2	6	1949865	1949870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801000
45125	NC_003212	TCCC	2	8	1949879	1949886	0 %	25 %	0 %	75 %	16801001
45126	NC_003212	TTTC	2	8	1949900	1949907	0 %	75 %	0 %	25 %	16801001
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45143	NC_003212	TCGC	2	8	1950482	1950489	0 %	25 %	25 %	50 %	16801001
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45149	NC_003212	TGCA	2	8	1950619	1950626	25 %	25 %	25 %	25 %	16801001
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45152	NC_003212	GC	3	6	1950802	1950807	0 %	0 %	50 %	50 %	16801002
45153	NC_003212	TTC	2	6	1950822	1950827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801002
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45225	NC_003212	T	6	6	1954596	1954601	0 %	100 %	0 %	0 %	16801004
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45230	NC_003212	T	7	7	1954666	1954672	0 %	100 %	0 %	0 %	16801004
45231	NC_003212	A	6	6	1954711	1954716	100 %	0 %	0 %	0 %	16801004
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45235	NC_003212	T	6	6	1954813	1954818	0 %	100 %	0 %	0 %	16801004
45236	NC_003212	ATTTT	2	10	1954826	1954835	20 %	80 %	0 %	0 %	16801004
45237	NC_003212	GAC	2	6	1954846	1954851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801004
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45239	NC_003212	AAT	2	6	1954943	1954948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801004
45240	NC_003212	TTC	2	6	1954966	1954971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801004
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45244	NC_003212	ACTC	2	8	1955212	1955219	25 %	25 %	0 %	50 %	16801004
45245	NC_003212	TCT	2	6	1955240	1955245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801004
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45258	NC_003212	T	6	6	1955668	1955673	0 %	100 %	0 %	0 %	16801005
45259	NC_003212	GCT	2	6	1955709	1955714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801005
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45271	NC_003212	GTT	2	6	1956213	1956218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801005
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45275	NC_003212	TA	3	6	1956355	1956360	50 %	50 %	0 %	0 %	16801005
45276	NC_003212	CAT	2	6	1956361	1956366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801005
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45282	NC_003212	TAT	2	6	1956573	1956578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45303	NC_003212	CCT	2	6	1957514	1957519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45304	NC_003212	CGT	2	6	1957564	1957569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801008
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45323	NC_003212	ATGT	2	8	1958508	1958515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45324	NC_003212	TAAC	2	8	1958528	1958535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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45331	NC_003212	A	6	6	1958677	1958682	100 %	0 %	0 %	0 %	16801009
45332	NC_003212	TTC	2	6	1958707	1958712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801009
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45341	NC_003212	T	6	6	1959236	1959241	0 %	100 %	0 %	0 %	16801009
45342	NC_003212	ATT	3	9	1959318	1959326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801009
45343	NC_003212	CGT	2	6	1959413	1959418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801009
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45348	NC_003212	AGT	2	6	1959727	1959732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801009
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45354	NC_003212	A	6	6	1959887	1959892	100 %	0 %	0 %	0 %	16801009
45355	NC_003212	CTT	2	6	1959921	1959926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801009
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45358	NC_003212	AAT	2	6	1959998	1960003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801009
45359	NC_003212	TGT	2	6	1960042	1960047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801009
45360	NC_003212	GAT	2	6	1960093	1960098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801009
45361	NC_003212	TGC	2	6	1960099	1960104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801009
45362	NC_003212	CTA	2	6	1960105	1960110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801009
45363	NC_003212	A	6	6	1960169	1960174	100 %	0 %	0 %	0 %	16801009
45364	NC_003212	GTTAT	2	10	1960194	1960203	20 %	60 %	20 %	0 %	16801009
45365	NC_003212	ACA	2	6	1960217	1960222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801009
45366	NC_003212	T	6	6	1960290	1960295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45367	NC_003212	ACTTT	2	10	1960325	1960334	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45368	NC_003212	T	6	6	1960332	1960337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45369	NC_003212	GAT	2	6	1960346	1960351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45370	NC_003212	TTA	2	6	1960367	1960372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801010
45371	NC_003212	A	6	6	1960421	1960426	100 %	0 %	0 %	0 %	16801010
45372	NC_003212	CTG	2	6	1960440	1960445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801010
45373	NC_003212	GTG	2	6	1960455	1960460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801010
45374	NC_003212	A	8	8	1960495	1960502	100 %	0 %	0 %	0 %	16801010
45375	NC_003212	TAG	2	6	1960606	1960611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801010
45376	NC_003212	ATG	2	6	1960697	1960702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801010
45377	NC_003212	AGA	2	6	1960828	1960833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801010
45378	NC_003212	TCC	2	6	1960869	1960874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16801010
45379	NC_003212	CTG	2	6	1960881	1960886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801010
45380	NC_003212	A	6	6	1960908	1960913	100 %	0 %	0 %	0 %	16801010
45381	NC_003212	TAA	2	6	1960955	1960960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801010
45382	NC_003212	A	6	6	1960959	1960964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45383	NC_003212	T	7	7	1960989	1960995	0 %	100 %	0 %	0 %	16801011
45384	NC_003212	TTC	2	6	1961019	1961024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801011
45385	NC_003212	AGT	2	6	1961051	1961056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801011
45386	NC_003212	TTTA	2	8	1961066	1961073	25 %	75 %	0 %	0 %	16801011
45387	NC_003212	TTC	2	6	1961129	1961134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801011
45388	NC_003212	AGT	2	6	1961136	1961141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801011
45389	NC_003212	T	6	6	1961141	1961146	0 %	100 %	0 %	0 %	16801011
45390	NC_003212	CTT	2	6	1961203	1961208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801011
45391	NC_003212	AAATC	2	10	1961248	1961257	60 %	20 %	0 %	20 %	16801011
45392	NC_003212	ACT	2	6	1961268	1961273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801011
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45394	NC_003212	ACA	2	6	1961415	1961420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801011
45395	NC_003212	T	6	6	1961446	1961451	0 %	100 %	0 %	0 %	16801011
45396	NC_003212	TAA	2	6	1961588	1961593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801011
45397	NC_003212	TGC	2	6	1961653	1961658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801012
45398	NC_003212	ACG	2	6	1961693	1961698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801012
45399	NC_003212	GAT	2	6	1961705	1961710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801012
45400	NC_003212	ACG	2	6	1961738	1961743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801012
45401	NC_003212	ACA	2	6	1961852	1961857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801012
45402	NC_003212	AAG	2	6	1961908	1961913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801012
45403	NC_003212	TTG	2	6	1962003	1962008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801012
45404	NC_003212	AGC	2	6	1962031	1962036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801012
45405	NC_003212	CAT	2	6	1962040	1962045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801012
45406	NC_003212	TTTC	2	8	1962046	1962053	0 %	75 %	0 %	25 %	16801012
45407	NC_003212	ATC	2	6	1962104	1962109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801012
45408	NC_003212	TTG	2	6	1962169	1962174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801012
45409	NC_003212	T	6	6	1962180	1962185	0 %	100 %	0 %	0 %	16801012
45410	NC_003212	CAA	2	6	1962186	1962191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801012
45411	NC_003212	A	6	6	1962210	1962215	100 %	0 %	0 %	0 %	16801012
45412	NC_003212	A	6	6	1962263	1962268	100 %	0 %	0 %	0 %	16801012
45413	NC_003212	CTT	2	6	1962276	1962281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801012
45414	NC_003212	TAG	2	6	1962327	1962332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801013
45415	NC_003212	AGA	2	6	1962354	1962359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801013
45416	NC_003212	TAAT	2	8	1962395	1962402	50 %	50 %	0 %	0 %	16801013
45417	NC_003212	CGACTG	2	12	1962440	1962451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16801013
45418	NC_003212	TCA	2	6	1962484	1962489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801013
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45420	NC_003212	GAT	2	6	1962513	1962518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801013
45421	NC_003212	TTAC	2	8	1962526	1962533	25 %	50 %	0 %	25 %	16801013
45422	NC_003212	TGA	2	6	1962544	1962549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801013
45423	NC_003212	ATC	2	6	1962550	1962555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801013
45424	NC_003212	ATC	2	6	1962661	1962666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801013
45425	NC_003212	CGC	2	6	1962684	1962689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801013
45426	NC_003212	ATA	2	6	1962712	1962717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801013
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45429	NC_003212	CGCT	2	8	1963037	1963044	0 %	25 %	25 %	50 %	16801013
45430	NC_003212	GTG	2	6	1963058	1963063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801013
45431	NC_003212	T	6	6	1963189	1963194	0 %	100 %	0 %	0 %	16801013
45432	NC_003212	CTT	2	6	1963286	1963291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801014
45433	NC_003212	TTC	2	6	1963352	1963357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801014
45434	NC_003212	AAAG	2	8	1963359	1963366	75 %	0 %	25 %	0 %	16801014
45435	NC_003212	AGCT	2	8	1963610	1963617	25 %	25 %	25 %	25 %	16801014
45436	NC_003212	ACT	2	6	1963754	1963759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801014
45437	NC_003212	GTC	2	6	1963843	1963848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801014
45438	NC_003212	TAA	2	6	1963853	1963858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801014
45439	NC_003212	TCT	2	6	1964008	1964013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45440	NC_003212	CATT	2	8	1964051	1964058	25 %	50 %	0 %	25 %	16801015
45441	NC_003212	CTG	2	6	1964105	1964110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801015
45442	NC_003212	ACG	2	6	1964154	1964159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801015
45443	NC_003212	T	7	7	1964270	1964276	0 %	100 %	0 %	0 %	16801015
45444	NC_003212	CTT	2	6	1964300	1964305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801015
45445	NC_003212	GCTG	2	8	1964313	1964320	0 %	25 %	50 %	25 %	16801015
45446	NC_003212	CTT	3	9	1964381	1964389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801015
45447	NC_003212	GTT	2	6	1964437	1964442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801015
45448	NC_003212	AG	3	6	1964465	1964470	50 %	0 %	50 %	0 %	16801015
45449	NC_003212	ATTTC	2	10	1964513	1964522	20 %	60 %	0 %	20 %	16801015
45450	NC_003212	TCAA	2	8	1964629	1964636	50 %	25 %	0 %	25 %	16801015
45451	NC_003212	TTG	2	6	1964657	1964662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801015
45452	NC_003212	CTT	2	6	1964747	1964752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801015
45453	NC_003212	CAA	2	6	1964759	1964764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801015
45454	NC_003212	ACTTCT	2	12	1964965	1964976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16801015
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45463	NC_003212	AAGT	2	8	1965386	1965393	50 %	25 %	25 %	0 %	16801015
45464	NC_003212	TTG	2	6	1965451	1965456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801015
45465	NC_003212	TTG	2	6	1965480	1965485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801015
45466	NC_003212	CTTT	2	8	1965571	1965578	0 %	75 %	0 %	25 %	16801015
45467	NC_003212	CCA	2	6	1965662	1965667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16801015
45468	NC_003212	TA	3	6	1965671	1965676	50 %	50 %	0 %	0 %	16801015
45469	NC_003212	TCG	2	6	1965721	1965726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801015
45470	NC_003212	TTC	2	6	1965789	1965794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801015
45471	NC_003212	TTTC	2	8	1965806	1965813	0 %	75 %	0 %	25 %	16801015
45472	NC_003212	GAA	2	6	1965855	1965860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801015
45473	NC_003212	GTT	2	6	1965887	1965892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801015
45474	NC_003212	TGC	3	9	1965915	1965923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801015
45475	NC_003212	AAG	2	6	1965925	1965930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801015
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45477	NC_003212	CTT	2	6	1965995	1966000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801015
45478	NC_003212	AGT	2	6	1966003	1966008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801015
45479	NC_003212	CTT	2	6	1966055	1966060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801015
45480	NC_003212	TG	3	6	1966105	1966110	0 %	50 %	50 %	0 %	16801015
45481	NC_003212	CGA	2	6	1966117	1966122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801015
45482	NC_003212	CAA	2	6	1966166	1966171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801015
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45484	NC_003212	TGC	2	6	1966260	1966265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801015
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45490	NC_003212	T	6	6	1966604	1966609	0 %	100 %	0 %	0 %	16801015
45491	NC_003212	AATT	2	8	1966662	1966669	50 %	50 %	0 %	0 %	16801015
45492	NC_003212	CGC	2	6	1966691	1966696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801015
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