MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 69257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_003212	ATC	2	6	1344980	1344985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16800416
31003	NC_003212	ATA	2	6	1344995	1345000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16800416
31004	NC_003212	TCG	2	6	1345014	1345019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800416
31005	NC_003212	GAA	2	6	1345071	1345076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800416
31006	NC_003212	TAA	2	6	1345132	1345137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16800416
31007	NC_003212	TGT	2	6	1345149	1345154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800416
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31009	NC_003212	GA	4	8	1345237	1345244	50 %	0 %	50 %	0 %	16800416
31010	NC_003212	T	6	6	1345365	1345370	0 %	100 %	0 %	0 %	16800416
31011	NC_003212	ATA	3	9	1345389	1345397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16800416
31012	NC_003212	AAT	2	6	1345475	1345480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16800416
31013	NC_003212	TTTC	2	8	1345528	1345535	0 %	75 %	0 %	25 %	16800416
31014	NC_003212	ACTT	2	8	1345571	1345578	25 %	50 %	0 %	25 %	16800416
31015	NC_003212	TTAA	2	8	1345581	1345588	50 %	50 %	0 %	0 %	16800416
31016	NC_003212	ATAA	2	8	1345626	1345633	75 %	25 %	0 %	0 %	16800416
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31025	NC_003212	AAAATA	2	12	1345890	1345901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16800417
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31035	NC_003212	TAGC	2	8	1346285	1346292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31036	NC_003212	TAG	2	6	1346297	1346302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31039	NC_003212	TAT	2	6	1346362	1346367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16800418
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31239	NC_003212	ATG	2	6	1355760	1355765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800425
31240	NC_003212	GCT	2	6	1355781	1355786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800425
31241	NC_003212	TGA	2	6	1355870	1355875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800425
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31244	NC_003212	A	6	6	1355920	1355925	100 %	0 %	0 %	0 %	16800425
31245	NC_003212	ATTC	2	8	1356000	1356007	25 %	50 %	0 %	25 %	16800425
31246	NC_003212	CCTT	2	8	1356091	1356098	0 %	50 %	0 %	50 %	16800425
31247	NC_003212	GAA	2	6	1356102	1356107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800425
31248	NC_003212	TCG	2	6	1356121	1356126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800425
31249	NC_003212	TGGA	2	8	1356153	1356160	25 %	25 %	50 %	0 %	16800425
31250	NC_003212	AGA	2	6	1356212	1356217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800425
31251	NC_003212	TAT	2	6	1356314	1356319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16800425
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31253	NC_003212	TAG	2	6	1356391	1356396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800425
31254	NC_003212	GGTT	2	8	1356410	1356417	0 %	50 %	50 %	0 %	16800425
31255	NC_003212	CTT	2	6	1356418	1356423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16800425
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31332	NC_003212	GAAAAA	2	12	1360048	1360059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16800428
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31342	NC_003212	TGT	2	6	1360325	1360330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800429
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31345	NC_003212	A	6	6	1360633	1360638	100 %	0 %	0 %	0 %	16800430
31346	NC_003212	AAGA	2	8	1360651	1360658	75 %	0 %	25 %	0 %	16800430
31347	NC_003212	ACT	2	6	1360660	1360665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16800430
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31349	NC_003212	CAG	2	6	1360748	1360753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16800430
31350	NC_003212	TAA	2	6	1360761	1360766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16800430
31351	NC_003212	CAAA	2	8	1360778	1360785	75 %	0 %	0 %	25 %	16800430
31352	NC_003212	CAA	3	9	1360881	1360889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16800430
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31354	NC_003212	GGC	3	9	1360909	1360917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16800430
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31356	NC_003212	GGC	2	6	1360957	1360962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16800430
31357	NC_003212	GAA	2	6	1360989	1360994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800430
31358	NC_003212	A	6	6	1360993	1360998	100 %	0 %	0 %	0 %	16800430
31359	NC_003212	CAGTA	2	10	1361013	1361022	40 %	20 %	20 %	20 %	16800430
31360	NC_003212	CGC	2	6	1361030	1361035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16800430
31361	NC_003212	A	6	6	1361057	1361062	100 %	0 %	0 %	0 %	16800430
31362	NC_003212	A	6	6	1361101	1361106	100 %	0 %	0 %	0 %	16800430
31363	NC_003212	TA	3	6	1361108	1361113	50 %	50 %	0 %	0 %	16800430
31364	NC_003212	A	6	6	1361134	1361139	100 %	0 %	0 %	0 %	16800430
31365	NC_003212	GTT	2	6	1361155	1361160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800430
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31367	NC_003212	AATT	2	8	1361198	1361205	50 %	50 %	0 %	0 %	16800430
31368	NC_003212	TGA	2	6	1361208	1361213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800430
31369	NC_003212	AGA	3	9	1361229	1361237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800430
31370	NC_003212	TTG	2	6	1361312	1361317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800430
31371	NC_003212	GTT	2	6	1361329	1361334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800430
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31373	NC_003212	TGG	2	6	1361415	1361420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16800430
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31375	NC_003212	A	7	7	1361464	1361470	100 %	0 %	0 %	0 %	16800430
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31404	NC_003212	CAAT	2	8	1362560	1362567	50 %	25 %	0 %	25 %	16800430
31405	NC_003212	GCTG	2	8	1362589	1362596	0 %	25 %	50 %	25 %	16800430
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31418	NC_003212	AAG	2	6	1363240	1363245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800432
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31422	NC_003212	T	7	7	1363526	1363532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31423	NC_003212	AGG	2	6	1363539	1363544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31424	NC_003212	TACA	2	8	1363627	1363634	50 %	25 %	0 %	25 %	16800433
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31426	NC_003212	CAA	2	6	1363705	1363710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16800433
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31432	NC_003212	AT	3	6	1364075	1364080	50 %	50 %	0 %	0 %	16800433
31433	NC_003212	A	6	6	1364166	1364171	100 %	0 %	0 %	0 %	16800433
31434	NC_003212	TGA	2	6	1364198	1364203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800433
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31437	NC_003212	GAA	2	6	1364283	1364288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800433
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31440	NC_003212	TAT	2	6	1364489	1364494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31441	NC_003212	A	6	6	1364531	1364536	100 %	0 %	0 %	0 %	16800434
31442	NC_003212	CAT	2	6	1364554	1364559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16800434
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31444	NC_003212	TCA	2	6	1364634	1364639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16800434
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31447	NC_003212	A	6	6	1364783	1364788	100 %	0 %	0 %	0 %	16800434
31448	NC_003212	ATGT	2	8	1364812	1364819	25 %	50 %	25 %	0 %	16800434
31449	NC_003212	TAC	2	6	1364829	1364834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16800434
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31451	NC_003212	TTG	2	6	1364879	1364884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800434
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31453	NC_003212	A	7	7	1364931	1364937	100 %	0 %	0 %	0 %	16800434
31454	NC_003212	AAAC	2	8	1365004	1365011	75 %	0 %	0 %	25 %	16800434
31455	NC_003212	GCT	2	6	1365013	1365018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800434
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31459	NC_003212	GAA	2	6	1365349	1365354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800434
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31461	NC_003212	TGCT	2	8	1365492	1365499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31462	NC_003212	AGG	2	6	1365602	1365607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31463	NC_003212	GAAA	2	8	1365610	1365617	75 %	0 %	25 %	0 %	16800435
31464	NC_003212	ATT	2	6	1365647	1365652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16800435
31465	NC_003212	CTG	2	6	1365714	1365719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800435
31466	NC_003212	A	6	6	1365755	1365760	100 %	0 %	0 %	0 %	16800435
31467	NC_003212	ATC	2	6	1365762	1365767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16800435
31468	NC_003212	CGT	2	6	1365803	1365808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800435
31469	NC_003212	A	6	6	1365830	1365835	100 %	0 %	0 %	0 %	16800435
31470	NC_003212	T	8	8	1365922	1365929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31471	NC_003212	GAA	2	6	1365965	1365970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31472	NC_003212	TG	3	6	1366041	1366046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31473	NC_003212	CAAG	2	8	1366209	1366216	50 %	0 %	25 %	25 %	16800436
31474	NC_003212	AGC	2	6	1366220	1366225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16800436
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31476	NC_003212	GAA	2	6	1366320	1366325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800436
31477	NC_003212	A	6	6	1366324	1366329	100 %	0 %	0 %	0 %	16800436
31478	NC_003212	GC	3	6	1366404	1366409	0 %	0 %	50 %	50 %	16800436
31479	NC_003212	ATT	2	6	1366433	1366438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16800436
31480	NC_003212	GCA	2	6	1366515	1366520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16800436
31481	NC_003212	TCT	2	6	1366530	1366535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16800436
31482	NC_003212	TTA	2	6	1366615	1366620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16800436
31483	NC_003212	A	6	6	1366642	1366647	100 %	0 %	0 %	0 %	16800436
31484	NC_003212	ATG	2	6	1366678	1366683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800436
31485	NC_003212	AAG	2	6	1366711	1366716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800436
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31491	NC_003212	AGC	2	6	1366895	1366900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16800436
31492	NC_003212	AGA	2	6	1366910	1366915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16800436
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31500	NC_003212	TCG	2	6	1367315	1367320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16800436

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