MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 69257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_003212	ATT	2	6	2212717	2212722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801258
51003	NC_003212	TGC	2	6	2212738	2212743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801258
51004	NC_003212	TCT	2	6	2212754	2212759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801258
51005	NC_003212	A	6	6	2212783	2212788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51006	NC_003212	GAC	2	6	2212791	2212796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51007	NC_003212	GTAA	2	8	2212802	2212809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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51009	NC_003212	A	7	7	2212839	2212845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_003212	ATTT	2	8	2212875	2212882	25 %	75 %	0 %	0 %	16801259
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51013	NC_003212	TGT	3	9	2212934	2212942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801259
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51015	NC_003212	CAG	2	6	2213050	2213055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801259
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51018	NC_003212	CTTTGG	2	12	2213296	2213307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16801259
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51041	NC_003212	AT	3	6	2214067	2214072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51102	NC_003212	ATAC	2	8	2216849	2216856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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51110	NC_003212	T	6	6	2217051	2217056	0 %	100 %	0 %	0 %	16801262
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51119	NC_003212	AAC	2	6	2217539	2217544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801262
51120	NC_003212	ATC	2	6	2217560	2217565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801262
51121	NC_003212	ATTGTC	2	12	2217566	2217577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16801262
51122	NC_003212	TTTTAT	2	12	2217582	2217593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	16801262
51123	NC_003212	TTA	2	6	2217629	2217634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
51124	NC_003212	TAT	2	6	2217703	2217708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
51125	NC_003212	ATT	2	6	2217735	2217740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
51126	NC_003212	GATT	2	8	2217802	2217809	25 %	50 %	25 %	0 %	16801262
51127	NC_003212	T	6	6	2217819	2217824	0 %	100 %	0 %	0 %	16801262
51128	NC_003212	TGG	2	6	2217833	2217838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801262
51129	NC_003212	CG	3	6	2217882	2217887	0 %	0 %	50 %	50 %	16801262
51130	NC_003212	TTA	2	6	2217908	2217913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
51131	NC_003212	GTTA	2	8	2217934	2217941	25 %	50 %	25 %	0 %	16801262
51132	NC_003212	TGG	2	6	2217964	2217969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801262
51133	NC_003212	TAT	2	6	2218071	2218076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
51134	NC_003212	TTG	2	6	2218080	2218085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801262
51135	NC_003212	GAT	2	6	2218087	2218092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801262
51136	NC_003212	TTC	2	6	2218106	2218111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801262
51137	NC_003212	TGG	2	6	2218159	2218164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801262
51138	NC_003212	CCA	2	6	2218175	2218180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16801262
51139	NC_003212	CTT	2	6	2218232	2218237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801262
51140	NC_003212	ATT	2	6	2218274	2218279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801262
51141	NC_003212	TGTT	2	8	2218326	2218333	0 %	75 %	25 %	0 %	16801262
51142	NC_003212	CCGA	2	8	2218372	2218379	25 %	0 %	25 %	50 %	16801262
51143	NC_003212	A	6	6	2218379	2218384	100 %	0 %	0 %	0 %	16801262
51144	NC_003212	TAA	2	6	2218403	2218408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801262
51145	NC_003212	T	6	6	2218444	2218449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51146	NC_003212	T	6	6	2218455	2218460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51147	NC_003212	ATT	2	6	2218474	2218479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51148	NC_003212	T	7	7	2218496	2218502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51149	NC_003212	T	6	6	2218509	2218514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51150	NC_003212	GAAA	2	8	2218517	2218524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51151	NC_003212	ACT	2	6	2218534	2218539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51152	NC_003212	TAA	2	6	2218599	2218604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51153	NC_003212	CTC	2	6	2218653	2218658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16801263
51154	NC_003212	TAATT	2	10	2218666	2218675	40 %	60 %	0 %	0 %	16801263
51155	NC_003212	T	6	6	2218692	2218697	0 %	100 %	0 %	0 %	16801263
51156	NC_003212	CATAT	2	10	2218764	2218773	40 %	40 %	0 %	20 %	16801263
51157	NC_003212	ACA	2	6	2218798	2218803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801263
51158	NC_003212	TTTA	2	8	2218812	2218819	25 %	75 %	0 %	0 %	16801263
51159	NC_003212	TACG	2	8	2218868	2218875	25 %	25 %	25 %	25 %	16801263
51160	NC_003212	T	6	6	2218934	2218939	0 %	100 %	0 %	0 %	16801263
51161	NC_003212	GAA	2	6	2219012	2219017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801263
51162	NC_003212	TTC	2	6	2219078	2219083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801263
51163	NC_003212	ATT	2	6	2219103	2219108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801263
51164	NC_003212	CTA	2	6	2219114	2219119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801263
51165	NC_003212	TCA	2	6	2219162	2219167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801263
51166	NC_003212	ATA	3	9	2219179	2219187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801263
51167	NC_003212	ATT	2	6	2219193	2219198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801263
51168	NC_003212	TCCC	2	8	2219216	2219223	0 %	25 %	0 %	75 %	16801263
51169	NC_003212	GCA	2	6	2219224	2219229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801263
51170	NC_003212	TC	3	6	2219305	2219310	0 %	50 %	0 %	50 %	16801264
51171	NC_003212	TACT	2	8	2219325	2219332	25 %	50 %	0 %	25 %	16801264
51172	NC_003212	TTG	2	6	2219380	2219385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801264
51173	NC_003212	AAC	2	6	2219403	2219408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801264
51174	NC_003212	TTC	2	6	2219623	2219628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801264
51175	NC_003212	T	6	6	2219640	2219645	0 %	100 %	0 %	0 %	16801264
51176	NC_003212	CTTCAT	2	12	2219664	2219675	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16801264
51177	NC_003212	TAG	2	6	2219773	2219778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801264
51178	NC_003212	GAG	2	6	2219805	2219810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16801264
51179	NC_003212	CAC	2	6	2219827	2219832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16801264
51180	NC_003212	T	6	6	2219842	2219847	0 %	100 %	0 %	0 %	16801264
51181	NC_003212	T	6	6	2219851	2219856	0 %	100 %	0 %	0 %	16801264
51182	NC_003212	TTG	2	6	2219882	2219887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801264
51183	NC_003212	ATC	2	6	2219918	2219923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801264
51184	NC_003212	TGC	2	6	2219925	2219930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801264
51185	NC_003212	TCA	2	6	2219939	2219944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801264
51186	NC_003212	GAC	2	6	2219950	2219955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801264
51187	NC_003212	T	6	6	2220165	2220170	0 %	100 %	0 %	0 %	16801264
51188	NC_003212	ATC	2	6	2220230	2220235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801264
51189	NC_003212	TCA	2	6	2220236	2220241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51190	NC_003212	AGCT	2	8	2220257	2220264	25 %	25 %	25 %	25 %	16801265
51191	NC_003212	T	6	6	2220285	2220290	0 %	100 %	0 %	0 %	16801265
51192	NC_003212	CAT	2	6	2220291	2220296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801265
51193	NC_003212	TAA	2	6	2220315	2220320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
51194	NC_003212	AAAT	2	8	2220338	2220345	75 %	25 %	0 %	0 %	16801265
51195	NC_003212	TGT	2	6	2220421	2220426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801265
51196	NC_003212	ATAC	2	8	2220494	2220501	50 %	25 %	0 %	25 %	16801265
51197	NC_003212	AAG	2	6	2220502	2220507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16801265
51198	NC_003212	AAT	2	6	2220531	2220536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
51199	NC_003212	CA	3	6	2220578	2220583	50 %	0 %	0 %	50 %	16801265
51200	NC_003212	GCT	3	9	2220838	2220846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801265
51201	NC_003212	CAT	2	6	2220875	2220880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801265
51202	NC_003212	CTG	2	6	2220884	2220889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801265
51203	NC_003212	ATA	2	6	2220910	2220915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
51204	NC_003212	TTC	2	6	2221000	2221005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801265
51205	NC_003212	CAAT	2	8	2221012	2221019	50 %	25 %	0 %	25 %	16801265
51206	NC_003212	ATC	2	6	2221042	2221047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801265
51207	NC_003212	GTTG	2	8	2221100	2221107	0 %	50 %	50 %	0 %	16801265
51208	NC_003212	AAT	2	6	2221185	2221190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
51209	NC_003212	TGA	2	6	2221256	2221261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801265
51210	NC_003212	ATA	2	6	2221267	2221272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
51211	NC_003212	TCCA	2	8	2221346	2221353	25 %	25 %	0 %	50 %	16801265
51212	NC_003212	GTTC	2	8	2221381	2221388	0 %	50 %	25 %	25 %	16801265
51213	NC_003212	TGC	2	6	2221401	2221406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801265
51214	NC_003212	AAT	3	9	2221521	2221529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801265
51215	NC_003212	T	6	6	2221601	2221606	0 %	100 %	0 %	0 %	16801265
51216	NC_003212	CCATGC	2	12	2221667	2221678	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16801266
51217	NC_003212	TTG	2	6	2221862	2221867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801266
51218	NC_003212	T	6	6	2221896	2221901	0 %	100 %	0 %	0 %	16801266
51219	NC_003212	T	7	7	2221925	2221931	0 %	100 %	0 %	0 %	16801267
51220	NC_003212	GCT	2	6	2221949	2221954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801267
51221	NC_003212	ATTT	2	8	2221958	2221965	25 %	75 %	0 %	0 %	16801267
51222	NC_003212	TAG	2	6	2222423	2222428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801268
51223	NC_003212	TAA	2	6	2222484	2222489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16801268
51224	NC_003212	ATC	2	6	2222578	2222583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801268
51225	NC_003212	TTA	2	6	2222600	2222605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801268
51226	NC_003212	AAAT	2	8	2222632	2222639	75 %	25 %	0 %	0 %	16801268
51227	NC_003212	ATC	3	9	2222650	2222658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801268
51228	NC_003212	TTC	2	6	2222682	2222687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801268
51229	NC_003212	GCC	2	6	2222707	2222712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801268
51230	NC_003212	TGC	2	6	2222742	2222747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801268
51231	NC_003212	TTC	2	6	2222757	2222762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801268
51232	NC_003212	A	6	6	2222782	2222787	100 %	0 %	0 %	0 %	16801268
51233	NC_003212	T	6	6	2222826	2222831	0 %	100 %	0 %	0 %	16801268
51234	NC_003212	CAG	2	6	2222834	2222839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801268
51235	NC_003212	T	6	6	2222847	2222852	0 %	100 %	0 %	0 %	16801268
51236	NC_003212	A	6	6	2222856	2222861	100 %	0 %	0 %	0 %	16801268
51237	NC_003212	TTC	2	6	2222895	2222900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801268
51238	NC_003212	ATC	2	6	2222907	2222912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801268
51239	NC_003212	T	7	7	2222939	2222945	0 %	100 %	0 %	0 %	16801268
51240	NC_003212	GCT	2	6	2223039	2223044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801268
51241	NC_003212	CAT	2	6	2223141	2223146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16801268
51242	NC_003212	AGT	2	6	2223163	2223168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801268
51243	NC_003212	GATG	2	8	2223174	2223181	25 %	25 %	50 %	0 %	16801268
51244	NC_003212	ACG	2	6	2223199	2223204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801268
51245	NC_003212	GCT	2	6	2223218	2223223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801268
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51267	NC_003212	TCATG	2	10	2224223	2224232	20 %	40 %	20 %	20 %	16801268
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51271	NC_003212	TCCC	2	8	2224398	2224405	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51272	NC_003212	ATG	2	6	2224441	2224446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51273	NC_003212	TCA	2	6	2224449	2224454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51277	NC_003212	T	6	6	2224586	2224591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51278	NC_003212	A	7	7	2224723	2224729	100 %	0 %	0 %	0 %	16801269
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51348	NC_003212	GTTTT	2	10	2228180	2228189	0 %	80 %	20 %	0 %	16801272
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51351	NC_003212	AGC	2	6	2228316	2228321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801272
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51355	NC_003212	CTTTTG	2	12	2228435	2228446	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16801272
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51359	NC_003212	TCC	2	6	2228619	2228624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51360	NC_003212	TA	3	6	2228628	2228633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51361	NC_003212	A	7	7	2228679	2228685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51362	NC_003212	AGA	2	6	2228756	2228761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51363	NC_003212	T	6	6	2228782	2228787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51364	NC_003212	CTA	2	6	2228799	2228804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51365	NC_003212	ACATA	2	10	2228900	2228909	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51366	NC_003212	AGG	2	6	2228912	2228917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51367	NC_003212	CTG	2	6	2228945	2228950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801273
51368	NC_003212	CGC	2	6	2229004	2229009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16801273
51369	NC_003212	CAAA	2	8	2229051	2229058	75 %	0 %	0 %	25 %	16801273
51370	NC_003212	TGG	2	6	2229069	2229074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801273
51371	NC_003212	AT	3	6	2229102	2229107	50 %	50 %	0 %	0 %	16801273
51372	NC_003212	TGG	2	6	2229140	2229145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801273
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51374	NC_003212	AAAG	2	8	2229269	2229276	75 %	0 %	25 %	0 %	16801274
51375	NC_003212	AATT	2	8	2229304	2229311	50 %	50 %	0 %	0 %	16801274
51376	NC_003212	TC	3	6	2229343	2229348	0 %	50 %	0 %	50 %	16801274
51377	NC_003212	TGA	2	6	2229350	2229355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801274
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51379	NC_003212	AATTTA	2	12	2229435	2229446	50 %	50 %	0 %	0 %	16801274
51380	NC_003212	TGT	2	6	2229476	2229481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16801274
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51384	NC_003212	AGT	2	6	2229575	2229580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801274
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51390	NC_003212	TTTG	2	8	2229910	2229917	0 %	75 %	25 %	0 %	16801274
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51392	NC_003212	CGG	2	6	2230091	2230096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16801274
51393	NC_003212	TCTT	2	8	2230119	2230126	0 %	75 %	0 %	25 %	16801274
51394	NC_003212	AAC	2	6	2230127	2230132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16801274
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51398	NC_003212	AT	3	6	2230262	2230267	50 %	50 %	0 %	0 %	16801274
51399	NC_003212	ATT	2	6	2230341	2230346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16801274
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51403	NC_003212	TCG	3	9	2230603	2230611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16801274
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51449	NC_003212	GAA	2	6	2232297	2232302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51451	NC_003212	A	6	6	2232334	2232339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51452	NC_003212	ACATAA	2	12	2232350	2232361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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51454	NC_003212	TTA	2	6	2232389	2232394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51455	NC_003212	ATA	2	6	2232395	2232400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51456	NC_003212	TAAAT	2	10	2232416	2232425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51467	NC_003212	GCA	2	6	2232822	2232827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16801277
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51469	NC_003212	CTTG	2	8	2232854	2232861	0 %	50 %	25 %	25 %	16801277
51470	NC_003212	T	6	6	2232866	2232871	0 %	100 %	0 %	0 %	16801277
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51481	NC_003212	TTC	2	6	2233507	2233512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16801278
51482	NC_003212	CAAA	2	8	2233541	2233548	75 %	0 %	0 %	25 %	16801278
51483	NC_003212	A	7	7	2233546	2233552	100 %	0 %	0 %	0 %	16801278
51484	NC_003212	A	7	7	2233620	2233626	100 %	0 %	0 %	0 %	16801278
51485	NC_003212	TGA	2	6	2233687	2233692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801278
51486	NC_003212	GGT	2	6	2233739	2233744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16801278
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51490	NC_003212	ATG	2	6	2233926	2233931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16801278
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