MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 67181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_003210	CATT	2	8	568429	568436	25 %	50 %	0 %	25 %	16802573
13002	NC_003210	GTT	2	6	568467	568472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802573
13003	NC_003210	AGA	2	6	568490	568495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802573
13004	NC_003210	ATG	2	6	568540	568545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802573
13005	NC_003210	A	6	6	568587	568592	100 %	0 %	0 %	0 %	16802573
13006	NC_003210	AGA	2	6	568598	568603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802573
13007	NC_003210	AAT	3	9	568632	568640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802573
13008	NC_003210	GAC	2	6	568662	568667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802573
13009	NC_003210	ACA	2	6	568681	568686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802573
13010	NC_003210	A	6	6	568714	568719	100 %	0 %	0 %	0 %	16802573
13011	NC_003210	A	7	7	568729	568735	100 %	0 %	0 %	0 %	16802573
13012	NC_003210	AAC	2	6	568744	568749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802573
13013	NC_003210	CAAA	2	8	568814	568821	75 %	0 %	0 %	25 %	16802573
13014	NC_003210	TCGGA	2	10	568828	568837	20 %	20 %	40 %	20 %	16802573
13015	NC_003210	CAA	2	6	568846	568851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802573
13016	NC_003210	TTG	2	6	568888	568893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802573
13017	NC_003210	A	6	6	568926	568931	100 %	0 %	0 %	0 %	16802573
13018	NC_003210	GAA	2	6	568947	568952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802573
13019	NC_003210	TAA	2	6	568973	568978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802573
13020	NC_003210	AAG	2	6	568981	568986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802573
13021	NC_003210	CGT	2	6	569018	569023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802573
13022	NC_003210	CTA	2	6	569043	569048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802573
13023	NC_003210	GCCGGA	2	12	569065	569076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16802573
13024	NC_003210	GAG	2	6	569080	569085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802573
13025	NC_003210	GAA	2	6	569096	569101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802574
13026	NC_003210	TCA	2	6	569158	569163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802574
13027	NC_003210	ATT	2	6	569208	569213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802574
13028	NC_003210	TTA	2	6	569214	569219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802574
13029	NC_003210	T	6	6	569228	569233	0 %	100 %	0 %	0 %	16802574
13030	NC_003210	TAT	2	6	569315	569320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802574
13031	NC_003210	CAAAT	2	10	569335	569344	60 %	20 %	0 %	20 %	16802574
13032	NC_003210	AAG	2	6	569437	569442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802574
13033	NC_003210	T	6	6	569539	569544	0 %	100 %	0 %	0 %	16802574
13034	NC_003210	TCA	2	6	569587	569592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802574
13035	NC_003210	AGATG	2	10	569633	569642	40 %	20 %	40 %	0 %	16802574
13036	NC_003210	TTA	2	6	569709	569714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802574
13037	NC_003210	GAT	2	6	569721	569726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802574
13038	NC_003210	TGT	2	6	569740	569745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802574
13039	NC_003210	GAA	2	6	569817	569822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802574
13040	NC_003210	AG	3	6	569952	569957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_003210	AGG	2	6	569973	569978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_003210	GGA	2	6	569997	570002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_003210	AGA	2	6	570016	570021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802575
13044	NC_003210	TTA	2	6	570038	570043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802575
13045	NC_003210	A	6	6	570116	570121	100 %	0 %	0 %	0 %	16802575
13046	NC_003210	GGTT	2	8	570139	570146	0 %	50 %	50 %	0 %	16802575
13047	NC_003210	AAAC	2	8	570494	570501	75 %	0 %	0 %	25 %	16802575
13048	NC_003210	ATC	2	6	570529	570534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802575
13049	NC_003210	ATT	2	6	570605	570610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802575
13050	NC_003210	TCT	2	6	570648	570653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802575
13051	NC_003210	A	6	6	570657	570662	100 %	0 %	0 %	0 %	16802575
13052	NC_003210	TAC	2	6	570812	570817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802575
13053	NC_003210	CTT	2	6	570819	570824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802575
13054	NC_003210	CTTT	2	8	570844	570851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13055	NC_003210	AGATTT	2	12	570858	570869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_003210	T	6	6	570867	570872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_003210	TACT	2	8	570926	570933	25 %	50 %	0 %	25 %	16802576
13058	NC_003210	TAA	2	6	570975	570980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802576
13059	NC_003210	CTGAA	2	10	570986	570995	40 %	20 %	20 %	20 %	16802576
13060	NC_003210	ATGG	2	8	571027	571034	25 %	25 %	50 %	0 %	16802576
13061	NC_003210	GAT	4	12	571044	571055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802576
13062	NC_003210	TGA	2	6	571086	571091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802576
13063	NC_003210	GAA	2	6	571153	571158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802576
13064	NC_003210	CAAAT	2	10	571211	571220	60 %	20 %	0 %	20 %	16802577
13065	NC_003210	GAA	3	9	571243	571251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802577
13066	NC_003210	GACGGC	2	12	571303	571314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16802577
13067	NC_003210	GAAA	2	8	571325	571332	75 %	0 %	25 %	0 %	16802577
13068	NC_003210	A	6	6	571340	571345	100 %	0 %	0 %	0 %	16802577
13069	NC_003210	ATT	2	6	571411	571416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802577
13070	NC_003210	GCA	2	6	571507	571512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802577
13071	NC_003210	AAG	2	6	571514	571519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802577
13072	NC_003210	GGC	2	6	571537	571542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802577
13073	NC_003210	CGA	2	6	571578	571583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802577
13074	NC_003210	CAG	2	6	571727	571732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802577
13075	NC_003210	CAAA	2	8	571929	571936	75 %	0 %	0 %	25 %	16802577
13076	NC_003210	AGA	2	6	572070	572075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802577
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13079	NC_003210	GGT	2	6	572176	572181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802577
13080	NC_003210	CATT	2	8	572192	572199	25 %	50 %	0 %	25 %	16802577
13081	NC_003210	CAA	2	6	572236	572241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802577
13082	NC_003210	AGC	2	6	572340	572345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802577
13083	NC_003210	TGA	2	6	572355	572360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802577
13084	NC_003210	TAA	2	6	572375	572380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802577
13085	NC_003210	ATA	2	6	572381	572386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802577
13086	NC_003210	CTG	2	6	572393	572398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802577
13087	NC_003210	CGG	2	6	572448	572453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802577
13088	NC_003210	GGT	2	6	572518	572523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802577
13089	NC_003210	A	7	7	572561	572567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_003210	GGA	2	6	572585	572590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_003210	TAT	2	6	572598	572603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802578
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13093	NC_003210	AAT	2	6	572661	572666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802578
13094	NC_003210	TCG	2	6	572722	572727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802578
13095	NC_003210	GCC	2	6	572803	572808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16802578
13096	NC_003210	AAT	2	6	572836	572841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802578
13097	NC_003210	GC	3	6	572966	572971	0 %	0 %	50 %	50 %	16802578
13098	NC_003210	AGCA	2	8	572987	572994	50 %	0 %	25 %	25 %	16802578
13099	NC_003210	CAT	2	6	573091	573096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802578
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13101	NC_003210	GCA	2	6	573238	573243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802578
13102	NC_003210	GATC	2	8	573271	573278	25 %	25 %	25 %	25 %	16802578
13103	NC_003210	ATC	2	6	573321	573326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802578
13104	NC_003210	T	7	7	573401	573407	0 %	100 %	0 %	0 %	16802578
13105	NC_003210	ATT	2	6	573450	573455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802578
13106	NC_003210	TCA	2	6	573477	573482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802578
13107	NC_003210	TTA	2	6	573498	573503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802578
13108	NC_003210	TGA	2	6	573524	573529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802578
13109	NC_003210	A	6	6	573613	573618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_003210	ATG	2	6	573686	573691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_003210	AGA	2	6	573696	573701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_003210	AGG	2	6	573724	573729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_003210	TAT	2	6	573736	573741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802579
13114	NC_003210	A	6	6	573743	573748	100 %	0 %	0 %	0 %	16802579
13115	NC_003210	TGG	2	6	573769	573774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802579
13116	NC_003210	AC	3	6	573786	573791	50 %	0 %	0 %	50 %	16802579
13117	NC_003210	TTG	2	6	573798	573803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802579
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13119	NC_003210	TAG	2	6	573852	573857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802579
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13245	NC_003210	GAC	2	6	579454	579459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802583
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13497	NC_003210	AGG	2	6	590308	590313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_003210	A	7	7	590327	590333	100 %	0 %	0 %	0 %	16802595
13499	NC_003210	ATC	2	6	590342	590347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802595
13500	NC_003210	CAG	2	6	590384	590389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802595

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