MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 67181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_003210	TAT	2	6	2448924	2448929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804409
56002	NC_003210	GTG	2	6	2448937	2448942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16804409
56003	NC_003210	ATT	2	6	2448943	2448948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804409
56004	NC_003210	ATT	2	6	2448952	2448957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804409
56005	NC_003210	CAT	2	6	2448999	2449004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804409
56006	NC_003210	TTC	2	6	2449063	2449068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804409
56007	NC_003210	GAG	2	6	2449139	2449144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16804409
56008	NC_003210	TGA	2	6	2449146	2449151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804409
56009	NC_003210	CTA	2	6	2449164	2449169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804410
56010	NC_003210	TA	3	6	2449183	2449188	50 %	50 %	0 %	0 %	16804410
56011	NC_003210	ATT	2	6	2449212	2449217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804410
56012	NC_003210	A	6	6	2449248	2449253	100 %	0 %	0 %	0 %	16804410
56013	NC_003210	TTG	2	6	2449270	2449275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804410
56014	NC_003210	ATCT	2	8	2449375	2449382	25 %	50 %	0 %	25 %	16804410
56015	NC_003210	AACA	2	8	2449390	2449397	75 %	0 %	0 %	25 %	16804410
56016	NC_003210	AGA	2	6	2449409	2449414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804410
56017	NC_003210	AGC	2	6	2449433	2449438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804410
56018	NC_003210	CTTA	2	8	2449450	2449457	25 %	50 %	0 %	25 %	16804410
56019	NC_003210	GCG	2	6	2449506	2449511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16804410
56020	NC_003210	GCTTC	2	10	2449530	2449539	0 %	40 %	20 %	40 %	16804410
56021	NC_003210	CG	3	6	2449563	2449568	0 %	0 %	50 %	50 %	16804410
56022	NC_003210	CG	3	6	2449623	2449628	0 %	0 %	50 %	50 %	16804410
56023	NC_003210	TTA	2	6	2449630	2449635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804410
56024	NC_003210	AAG	2	6	2449688	2449693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804410
56025	NC_003210	ATG	2	6	2449762	2449767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804410
56026	NC_003210	A	6	6	2449834	2449839	100 %	0 %	0 %	0 %	16804410
56027	NC_003210	CA	3	6	2449858	2449863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56028	NC_003210	T	7	7	2449866	2449872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56029	NC_003210	TTAA	2	8	2449894	2449901	50 %	50 %	0 %	0 %	16804411
56030	NC_003210	TGC	2	6	2449947	2449952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804411
56031	NC_003210	CAG	2	6	2449982	2449987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804411
56032	NC_003210	TCA	2	6	2449993	2449998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804411
56033	NC_003210	T	7	7	2450003	2450009	0 %	100 %	0 %	0 %	16804411
56034	NC_003210	CAT	2	6	2450048	2450053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16804411
56035	NC_003210	TTAC	2	8	2450062	2450069	25 %	50 %	0 %	25 %	16804411
56036	NC_003210	TTC	2	6	2450112	2450117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804411
56037	NC_003210	TGC	2	6	2450118	2450123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804411
56038	NC_003210	TTG	2	6	2450150	2450155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804411
56039	NC_003210	CTTTC	2	10	2450199	2450208	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56040	NC_003210	GCT	2	6	2450217	2450222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56041	NC_003210	T	7	7	2450222	2450228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56042	NC_003210	TTA	2	6	2450237	2450242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56043	NC_003210	ACT	2	6	2450272	2450277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56044	NC_003210	GA	3	6	2450284	2450289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56045	NC_003210	AAT	2	6	2450291	2450296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56046	NC_003210	A	6	6	2450307	2450312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56047	NC_003210	ATA	2	6	2450339	2450344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56048	NC_003210	CAT	2	6	2450380	2450385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56049	NC_003210	AAC	2	6	2450391	2450396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56050	NC_003210	A	6	6	2450410	2450415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56051	NC_003210	GT	3	6	2450428	2450433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56052	NC_003210	GGA	2	6	2450511	2450516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16804412
56053	NC_003210	TTG	2	6	2450534	2450539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804412
56054	NC_003210	ATTG	2	8	2450593	2450600	25 %	50 %	25 %	0 %	16804412
56055	NC_003210	CTT	2	6	2450614	2450619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804412
56056	NC_003210	CGA	2	6	2450694	2450699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804412
56057	NC_003210	ATCA	2	8	2450704	2450711	50 %	25 %	0 %	25 %	16804412
56058	NC_003210	CGC	2	6	2450817	2450822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16804412
56059	NC_003210	TTTAAA	2	12	2450827	2450838	50 %	50 %	0 %	0 %	16804412
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56061	NC_003210	GTTT	2	8	2450933	2450940	0 %	75 %	25 %	0 %	16804412
56062	NC_003210	TAT	2	6	2450961	2450966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804412
56063	NC_003210	GAA	2	6	2451141	2451146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804412
56064	NC_003210	CTTA	2	8	2451157	2451164	25 %	50 %	0 %	25 %	16804412
56065	NC_003210	ATG	2	6	2451209	2451214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804412
56066	NC_003210	TGA	2	6	2451345	2451350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804412
56067	NC_003210	TGA	2	6	2451383	2451388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804412
56068	NC_003210	CGGA	2	8	2451405	2451412	25 %	0 %	50 %	25 %	16804412
56069	NC_003210	TGA	2	6	2451471	2451476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804412
56070	NC_003210	ATT	3	9	2451484	2451492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804412
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56073	NC_003210	AGA	2	6	2451732	2451737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16804412
56074	NC_003210	CG	3	6	2451757	2451762	0 %	0 %	50 %	50 %	16804412
56075	NC_003210	TA	3	6	2451764	2451769	50 %	50 %	0 %	0 %	16804412
56076	NC_003210	TAAAA	2	10	2451796	2451805	80 %	20 %	0 %	0 %	16804412
56077	NC_003210	CGA	2	6	2451824	2451829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56078	NC_003210	TTTA	2	8	2451839	2451846	25 %	75 %	0 %	0 %	16804413
56079	NC_003210	AAT	2	6	2451885	2451890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16804413
56080	NC_003210	TGT	2	6	2451932	2451937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804413
56081	NC_003210	CTT	2	6	2451943	2451948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804413
56082	NC_003210	CTCG	2	8	2451956	2451963	0 %	25 %	25 %	50 %	16804413
56083	NC_003210	TTA	2	6	2451965	2451970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16804413
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56085	NC_003210	T	6	6	2452034	2452039	0 %	100 %	0 %	0 %	16804413
56086	NC_003210	TGA	2	6	2452059	2452064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804413
56087	NC_003210	GCTT	2	8	2452100	2452107	0 %	50 %	25 %	25 %	16804413
56088	NC_003210	GTTG	2	8	2452142	2452149	0 %	50 %	50 %	0 %	16804413
56089	NC_003210	GTTG	2	8	2452199	2452206	0 %	50 %	50 %	0 %	16804413
56090	NC_003210	TGGG	2	8	2452218	2452225	0 %	25 %	75 %	0 %	16804413
56091	NC_003210	ATT	3	9	2452258	2452266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56092	NC_003210	A	6	6	2452280	2452285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56093	NC_003210	TTCA	2	8	2452314	2452321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56094	NC_003210	TCT	2	6	2452336	2452341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804414
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56096	NC_003210	TG	3	6	2452439	2452444	0 %	50 %	50 %	0 %	16804414
56097	NC_003210	CGTC	2	8	2452446	2452453	0 %	25 %	25 %	50 %	16804414
56098	NC_003210	CAG	2	6	2452534	2452539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804414
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56102	NC_003210	CTT	2	6	2452879	2452884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804414
56103	NC_003210	CTT	2	6	2452920	2452925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56104	NC_003210	ATA	2	6	2452959	2452964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56105	NC_003210	AAC	2	6	2452973	2452978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56106	NC_003210	T	7	7	2453029	2453035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56107	NC_003210	AAT	2	6	2453111	2453116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56108	NC_003210	GAT	2	6	2453126	2453131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56109	NC_003210	TC	3	6	2453225	2453230	0 %	50 %	0 %	50 %	16804415
56110	NC_003210	GGTT	2	8	2453386	2453393	0 %	50 %	50 %	0 %	16804415
56111	NC_003210	T	7	7	2453406	2453412	0 %	100 %	0 %	0 %	16804415
56112	NC_003210	ACTT	2	8	2453435	2453442	25 %	50 %	0 %	25 %	16804415
56113	NC_003210	CTC	2	6	2453517	2453522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16804415
56114	NC_003210	CGG	2	6	2453560	2453565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16804415
56115	NC_003210	TGG	2	6	2453596	2453601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16804415
56116	NC_003210	ATTT	2	8	2453613	2453620	25 %	75 %	0 %	0 %	16804415
56117	NC_003210	GAT	2	6	2453656	2453661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804415
56118	NC_003210	GGC	2	6	2453665	2453670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16804415
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56121	NC_003210	CGT	2	6	2453744	2453749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16804415
56122	NC_003210	TTGC	2	8	2453843	2453850	0 %	50 %	25 %	25 %	16804415
56123	NC_003210	TGA	2	6	2453937	2453942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16804415
56124	NC_003210	TTG	2	6	2453999	2454004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804415
56125	NC_003210	GGC	2	6	2454010	2454015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16804415
56126	NC_003210	CGA	2	6	2454042	2454047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16804415
56127	NC_003210	TCT	2	6	2454063	2454068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16804415
56128	NC_003210	TGG	2	6	2454094	2454099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16804415
56129	NC_003210	CGCT	2	8	2454225	2454232	0 %	25 %	25 %	50 %	16804415
56130	NC_003210	TTAT	2	8	2454260	2454267	25 %	75 %	0 %	0 %	16804415
56131	NC_003210	CCGA	2	8	2454318	2454325	25 %	0 %	25 %	50 %	16804415
56132	NC_003210	T	6	6	2454366	2454371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56133	NC_003210	GTTT	2	8	2454377	2454384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56134	NC_003210	T	8	8	2454382	2454389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56135	NC_003210	TTC	2	6	2454391	2454396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56137	NC_003210	AAGTT	2	10	2454437	2454446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56138	NC_003210	T	7	7	2454454	2454460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56139	NC_003210	A	6	6	2454466	2454471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56140	NC_003210	TAA	2	6	2454480	2454485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56141	NC_003210	A	6	6	2454484	2454489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56142	NC_003210	GTT	2	6	2454534	2454539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56143	NC_003210	TGA	2	6	2454546	2454551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56144	NC_003210	A	6	6	2454614	2454619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56145	NC_003210	TTC	2	6	2454674	2454679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56149	NC_003210	CTGG	2	8	2454783	2454790	0 %	25 %	50 %	25 %	16804416
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56155	NC_003210	TATT	2	8	2454985	2454992	25 %	75 %	0 %	0 %	16804416
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56157	NC_003210	TATT	2	8	2455038	2455045	25 %	75 %	0 %	0 %	16804416
56158	NC_003210	ATTG	2	8	2455135	2455142	25 %	50 %	25 %	0 %	16804416
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56240	NC_003210	TTG	2	6	2459041	2459046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16804419
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56362	NC_003210	AATT	2	8	2463677	2463684	50 %	50 %	0 %	0 %	16804426
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56365	NC_003210	GTAA	2	8	2463743	2463750	50 %	25 %	25 %	0 %	16804426
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56482	NC_003210	ATAC	2	8	2468780	2468787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56483	NC_003210	A	7	7	2468830	2468836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56484	NC_003210	TA	4	8	2468858	2468865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56485	NC_003210	ACC	2	6	2468893	2468898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56487	NC_003210	ACC	2	6	2468918	2468923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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