MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 66408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002973	AT	3	6	22400	22405	50 %	50 %	0 %	0 %	46906243
502	NC_002973	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	46906243
503	NC_002973	ATA	2	6	22507	22512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906243
504	NC_002973	CTG	2	6	22574	22579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906243
505	NC_002973	CAA	2	6	22682	22687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906243
506	NC_002973	ATC	2	6	22704	22709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906243
507	NC_002973	T	6	6	22716	22721	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
508	NC_002973	GAC	2	6	22782	22787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906243
509	NC_002973	T	6	6	22807	22812	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
510	NC_002973	TTC	2	6	22818	22823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906243
511	NC_002973	T	6	6	22829	22834	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
512	NC_002973	TTA	2	6	22939	22944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906243
513	NC_002973	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46906243
514	NC_002973	AGC	2	6	23028	23033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906243
515	NC_002973	TTA	2	6	23077	23082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906243
516	NC_002973	T	7	7	23169	23175	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
517	NC_002973	CAA	2	6	23204	23209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906243
518	NC_002973	ATT	2	6	23244	23249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906243
519	NC_002973	ATA	2	6	23305	23310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906243
520	NC_002973	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906243
521	NC_002973	T	6	6	23361	23366	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
522	NC_002973	CAG	2	6	23375	23380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906243
523	NC_002973	T	6	6	23392	23397	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
524	NC_002973	ATG	2	6	23425	23430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906243
525	NC_002973	TAA	2	6	23439	23444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906243
526	NC_002973	A	6	6	23453	23458	100 %	0 %	0 %	0 %	46906243
527	NC_002973	TAA	2	6	23462	23467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906243
528	NC_002973	T	7	7	23490	23496	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
529	NC_002973	T	6	6	23507	23512	0 %	100 %	0 %	0 %	46906243
530	NC_002973	CTC	2	6	23513	23518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_002973	T	8	8	23581	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_002973	A	6	6	23643	23648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002973	ATT	2	6	23655	23660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_002973	GAG	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_002973	TGC	2	6	23780	23785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906244
536	NC_002973	TTG	2	6	23833	23838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906244
537	NC_002973	GGAC	2	8	23858	23865	25 %	0 %	50 %	25 %	46906244
538	NC_002973	ATC	2	6	23947	23952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906244
539	NC_002973	AGA	2	6	23960	23965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906244
540	NC_002973	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	46906244
541	NC_002973	TGA	2	6	24041	24046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906244
542	NC_002973	ATG	2	6	24079	24084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906244
543	NC_002973	TGA	2	6	24092	24097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906244
544	NC_002973	GTT	2	6	24123	24128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906244
545	NC_002973	A	6	6	24165	24170	100 %	0 %	0 %	0 %	46906244
546	NC_002973	TGG	2	6	24173	24178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906244
547	NC_002973	TTC	2	6	24289	24294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906244
548	NC_002973	TGG	2	6	24308	24313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906244
549	NC_002973	GCT	2	6	24363	24368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906244
550	NC_002973	CAT	2	6	24369	24374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906244
551	NC_002973	AATC	2	8	24416	24423	50 %	25 %	0 %	25 %	46906244
552	NC_002973	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	46906244
553	NC_002973	CTT	2	6	24527	24532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906244
554	NC_002973	TAC	2	6	24555	24560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906244
555	NC_002973	TTC	2	6	24579	24584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906244
556	NC_002973	ACA	2	6	24592	24597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906244
557	NC_002973	CA	3	6	24642	24647	50 %	0 %	0 %	50 %	46906244
558	NC_002973	CTA	2	6	24668	24673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906244
559	NC_002973	TTC	2	6	24674	24679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906244
560	NC_002973	A	6	6	24743	24748	100 %	0 %	0 %	0 %	46906244
561	NC_002973	AAGC	2	8	24760	24767	50 %	0 %	25 %	25 %	46906244
562	NC_002973	AGA	2	6	24887	24892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906244
563	NC_002973	TGA	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906244
564	NC_002973	CTT	2	6	24978	24983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906244
565	NC_002973	A	6	6	25038	25043	100 %	0 %	0 %	0 %	46906244
566	NC_002973	ATA	2	6	25072	25077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906244
567	NC_002973	GAA	2	6	25103	25108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906244
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569	NC_002973	A	6	6	25128	25133	100 %	0 %	0 %	0 %	46906244
570	NC_002973	AT	3	6	25166	25171	50 %	50 %	0 %	0 %	46906244
571	NC_002973	TCA	2	6	25187	25192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_002973	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	46906245
573	NC_002973	CAA	2	6	25247	25252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906245
574	NC_002973	T	7	7	25283	25289	0 %	100 %	0 %	0 %	46906245
575	NC_002973	ATT	2	6	25318	25323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906245
576	NC_002973	T	6	6	25399	25404	0 %	100 %	0 %	0 %	46906245
577	NC_002973	TTC	2	6	25448	25453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906245
578	NC_002973	T	6	6	25468	25473	0 %	100 %	0 %	0 %	46906245
579	NC_002973	CAA	2	6	25533	25538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906245
580	NC_002973	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	46906245
581	NC_002973	CAT	2	6	25621	25626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906245
582	NC_002973	CATT	2	8	25686	25693	25 %	50 %	0 %	25 %	46906245
583	NC_002973	T	6	6	25772	25777	0 %	100 %	0 %	0 %	46906245
584	NC_002973	CCAA	2	8	25849	25856	50 %	0 %	0 %	50 %	46906245
585	NC_002973	GAAC	2	8	25883	25890	50 %	0 %	25 %	25 %	46906245
586	NC_002973	GTT	2	6	25904	25909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906245
587	NC_002973	GCC	3	9	25940	25948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46906245
588	NC_002973	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
589	NC_002973	TTA	2	6	26154	26159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_002973	CG	3	6	26246	26251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_002973	TAT	3	9	26295	26303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906246
593	NC_002973	ATTA	2	8	26319	26326	50 %	50 %	0 %	0 %	46906246
594	NC_002973	A	6	6	26351	26356	100 %	0 %	0 %	0 %	46906246
595	NC_002973	GTT	2	6	26407	26412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906246
596	NC_002973	TAT	2	6	26487	26492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906246
597	NC_002973	GAA	2	6	26497	26502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906246
598	NC_002973	A	6	6	26620	26625	100 %	0 %	0 %	0 %	46906246
599	NC_002973	TGA	2	6	26679	26684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906246
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601	NC_002973	AT	3	6	26952	26957	50 %	50 %	0 %	0 %	46906246
602	NC_002973	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906246
603	NC_002973	A	6	6	27004	27009	100 %	0 %	0 %	0 %	46906246
604	NC_002973	TAT	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906247
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614	NC_002973	CAA	2	6	27493	27498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906248
615	NC_002973	TTG	2	6	27535	27540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906248
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619	NC_002973	AAT	2	6	27648	27653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906248
620	NC_002973	GCA	2	6	27668	27673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906248
621	NC_002973	TAG	2	6	27715	27720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906248
622	NC_002973	A	6	6	27789	27794	100 %	0 %	0 %	0 %	46906248
623	NC_002973	A	7	7	27911	27917	100 %	0 %	0 %	0 %	46906248
624	NC_002973	AAG	2	6	27926	27931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002973	GTTA	2	8	27972	27979	25 %	50 %	25 %	0 %	46906249
626	NC_002973	TAA	2	6	28040	28045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906249
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629	NC_002973	CGG	2	6	28343	28348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906249
630	NC_002973	CG	3	6	28393	28398	0 %	0 %	50 %	50 %	46906249
631	NC_002973	GGC	2	6	28477	28482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906249
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