MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 54694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_002662	CAA	2	6	1464796	1464801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15673424
34003	NC_002662	GCA	2	6	1464874	1464879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15673424
34004	NC_002662	TCATT	2	10	1464955	1464964	20 %	60 %	0 %	20 %	15673424
34005	NC_002662	TGA	2	6	1465006	1465011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15673424
34006	NC_002662	TAG	2	6	1465121	1465126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15673424
34007	NC_002662	T	7	7	1465150	1465156	0 %	100 %	0 %	0 %	15673424
34008	NC_002662	AAT	2	6	1465184	1465189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15673424
34009	NC_002662	T	6	6	1465312	1465317	0 %	100 %	0 %	0 %	15673424
34010	NC_002662	TCC	2	6	1465358	1465363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15673424
34011	NC_002662	CCA	2	6	1465458	1465463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15673424
34012	NC_002662	TCAAA	2	10	1465501	1465510	60 %	20 %	0 %	20 %	15673424
34013	NC_002662	TGAA	2	8	1465520	1465527	50 %	25 %	25 %	0 %	15673424
34014	NC_002662	TGT	2	6	1465559	1465564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15673424
34015	NC_002662	AAAT	2	8	1465575	1465582	75 %	25 %	0 %	0 %	15673424
34016	NC_002662	ATC	2	6	1465641	1465646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15673424
34017	NC_002662	CAC	2	6	1465672	1465677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15673424
34018	NC_002662	TCTTT	2	10	1465682	1465691	0 %	80 %	0 %	20 %	15673424
34019	NC_002662	CTC	3	9	1465724	1465732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34020	NC_002662	AAT	2	6	1465746	1465751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15673425
34021	NC_002662	TA	3	6	1465752	1465757	50 %	50 %	0 %	0 %	15673425
34022	NC_002662	CTT	2	6	1465767	1465772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15673425
34023	NC_002662	CTT	2	6	1465822	1465827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15673425
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34026	NC_002662	CAT	2	6	1465975	1465980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15673425
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34029	NC_002662	TGAC	2	8	1466267	1466274	25 %	25 %	25 %	25 %	15673425
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34031	NC_002662	ATTTT	2	10	1466356	1466365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34032	NC_002662	T	6	6	1466379	1466384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34033	NC_002662	A	7	7	1466390	1466396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34034	NC_002662	T	7	7	1466498	1466504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34035	NC_002662	ATA	2	6	1466529	1466534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34038	NC_002662	CTCA	2	8	1466645	1466652	25 %	25 %	0 %	50 %	15673426
34039	NC_002662	ATG	2	6	1466653	1466658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15673426
34040	NC_002662	GGA	2	6	1466678	1466683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15673426
34041	NC_002662	TCT	2	6	1466705	1466710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15673426
34042	NC_002662	TA	3	6	1466716	1466721	50 %	50 %	0 %	0 %	15673426
34043	NC_002662	A	8	8	1466721	1466728	100 %	0 %	0 %	0 %	15673426
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34045	NC_002662	A	6	6	1466767	1466772	100 %	0 %	0 %	0 %	15673426
34046	NC_002662	TCA	2	6	1466791	1466796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15673426
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34052	NC_002662	AT	3	6	1467371	1467376	50 %	50 %	0 %	0 %	15673426
34053	NC_002662	ATT	2	6	1467402	1467407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15673426
34054	NC_002662	A	6	6	1467450	1467455	100 %	0 %	0 %	0 %	15673426
34055	NC_002662	A	7	7	1467460	1467466	100 %	0 %	0 %	0 %	15673426
34056	NC_002662	T	6	6	1467487	1467492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_002662	CTG	2	6	1467539	1467544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15673427
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34061	NC_002662	CAAT	2	8	1467614	1467621	50 %	25 %	0 %	25 %	15673427
34062	NC_002662	AAC	2	6	1467652	1467657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15673427
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34070	NC_002662	CTT	2	6	1467970	1467975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34090	NC_002662	GCT	2	6	1468848	1468853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15673428
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34092	NC_002662	CT	3	6	1468960	1468965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34093	NC_002662	ATCT	2	8	1468979	1468986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34094	NC_002662	AAAG	2	8	1469069	1469076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34095	NC_002662	ATC	2	6	1469094	1469099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34103	NC_002662	CTTATA	2	12	1469426	1469437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15673429
34104	NC_002662	CAA	2	6	1469510	1469515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15673429
34105	NC_002662	AAAT	2	8	1469534	1469541	75 %	25 %	0 %	0 %	15673429
34106	NC_002662	ATA	3	9	1469553	1469561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15673429
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34108	NC_002662	T	6	6	1469569	1469574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34109	NC_002662	T	6	6	1469577	1469582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34110	NC_002662	AATAA	2	10	1469605	1469614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34122	NC_002662	T	6	6	1470195	1470200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34368	NC_002662	ATTT	2	8	1481030	1481037	25 %	75 %	0 %	0 %	15673438
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34433	NC_002662	ATA	3	9	1483237	1483245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34435	NC_002662	AGAT	2	8	1483265	1483272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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34487	NC_002662	CCA	2	6	1485743	1485748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15673440
34488	NC_002662	CAT	2	6	1485813	1485818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15673440
34489	NC_002662	CTG	2	6	1485819	1485824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15673440
34490	NC_002662	GTT	2	6	1485974	1485979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15673440
34491	NC_002662	CAT	2	6	1486050	1486055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15673440
34492	NC_002662	CTG	2	6	1486104	1486109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15673440
34493	NC_002662	TGT	2	6	1486147	1486152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15673440
34494	NC_002662	GTTG	2	8	1486157	1486164	0 %	50 %	50 %	0 %	15673440
34495	NC_002662	CAT	2	6	1486170	1486175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15673440
34496	NC_002662	CTG	2	6	1486248	1486253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15673440
34497	NC_002662	TGT	2	6	1486371	1486376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15673440
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34499	NC_002662	TGT	2	6	1486402	1486407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15673440
34500	NC_002662	TTTG	2	8	1486412	1486419	0 %	75 %	25 %	0 %	15673440

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